【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，尤其涉及一种用于静原鸡品种鉴定的snp引物组合及其应用。
技术介绍
1、静原鸡作为一种肉蛋兼用型地方鸡品种，主要分布在甘肃省的静宁县和宁夏回族自治区的固原市，是黄土高原耐高寒干旱气候的优良品种。静原鸡的羽毛颜色、皮肤颜色、肉质等表型特征具有明显的地方特色，喙多呈灰色，虹彩以橘红为主，胫为灰色且粗壮，体格中等。成年公鸡的羽色主要有红色和红黑色，而成年母鸡的羽色则较为复杂，包括黄色、黑色、白色和花色等，其中以黄色和麻色最多。市场上出现很多静原鸡与其他品种乱杂乱配的冒充品种，这些品种体型外貌酷似静原鸡，消费者很难辨别，使广大养殖户利益受到损害，同时影响了静原鸡原种的保种与选育。目前市场上鉴别静原鸡真伪的方法主要依靠外观观察，这种观察主观性较强，尤其在鉴定静原鸡与其他品种鸡杂种后代时，因其外貌相似，鉴定错误率较高。需要一种能够准确鉴定静原鸡品种的鉴定方法。
技术实现思路
1、有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种用于静原鸡品种鉴定的snp引物组合及其应用。
2、为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：
3、本专利技术提供一种用于静原鸡品种鉴定的snp引物组合，所述引物组合包括鉴定如下jy1～jy7中的任意5～7个位点的引物：
4、jy1位点位于nc_006089.5染色体上，位点为chr2:88999342，该位点碱基为t/g；
5、jy2位点位于nc_006089.5染色体上，位点为chr2:1370165
6、jy3位点位于nc_006091.5染色体上，位点为chr4:22037922，该位点碱基为t/c；
7、jy4位点位于nc_006095.5染色体上，位点为chr8:13527512，该位点碱基为c/a；
8、jy5位点位于nc_006107.5染色体上，位点为chr20:9365087，该位点碱基为c/g；
9、jy6位点位于nc_006111.5染色体上，位点为chr24:150425，该位点碱基为a/c；
10、jy7位点位于nc_006114.5染色体上，位点为chr27:6092287，该位点碱基为a/c。
11、优选地，所述引物组合鉴定的位点包括：jy1+jy2+jy3+jy4+jy5、jy1+jy2+jy3+jy4+jy6、jy1+jy2+jy3+jy5+jy6、jy1+jy2+jy3+jy5+jy7、jy1+jy2+jy3+jy6+jy7、jy1+jy2+jy4+jy5+jy6、jy1+jy2+jy4+jy5+jy7、jy1+jy2+jy4+jy6+jy7、jy1+jy2+jy5+jy6+jy7、jy1+jy3+jy4+jy5+jy6、jy1+jy3+jy4+jy5+jy7、jy1+jy3+jy4+jy6+jy7、jy1+jy3+jy5+jy6+jy7、jy1+jy4+jy5+jy6+jy7、jy2+jy3+jy4+jy6+jy7、jy2+jy4+jy5+jy6+jy7、jy3+jy4+jy5+jy6+jy7、jy1+jy2+jy3+jy4+jy5+jy6、jy1+jy2+jy3+jy4+jy5+jy7、jy1+jy2+jy3+jy4+jy6+jy7、jy1+jy2+jy3+jy5+jy6+jy7、jy1+jy2+jy4+jy5+jy6+jy7、jy1+jy3+jy4+jy5+jy6+jy7、jy2+jy3+jy4+jy5+jy6+jy7或jy1+jy2+jy3+jy4+jy5+jy6+jy7。
12、优选地，各snp引物的序列为：
13、鉴定所述jy1位点的引物序列如seq id no.1-seq id no.3所示；
14、鉴定所述jy2位点的引物序列如seq id no.4-seq id no.6所示；
15、鉴定所述jy3位点的引物序列如seq id no.7-seq id no.9所示；
16、鉴定所述jy4位点的引物序列如seq id no.10-seq id no.12所示；
17、鉴定所述jy5位点的引物序列如seq id no.13-seq id no.15所示；
18、鉴定所述jy6位点的引物序列如seq id no.16-seq id no.18所示；
19、鉴定所述jy7位点的引物序列如seq id no.19-seq id no.21所示。
20、本专利技术提供所述snp引物组合在静原鸡品种鉴定中的应用。
21、优选地，所述鉴定的方法包括如下步骤：
22、(1)提取待测鸡基因组dna；
23、(2)以待测鸡基因组dna为模板，利用所述的引物组合中的引物分别进行扩增，获得扩增产物；
24、(3)将扩增产物测序后、确定不同位点的基因型；
25、(4)根据基因型结果，判断待测鸡个体是否属于静原鸡品种；
26、所述静原鸡jy1～jy7位点的基因型依次为tg/gg、cc/ct/tt、tt/tc/cc、cc/ca/aa、cc/cg/gg、aa/ac/cc、ac/cc；
27、如果扩增产物中对应所选snp组合的基因型与静原鸡的一致，则判定该待测鸡个体属于静原鸡；如果不一致，则判定该待测鸡个体不属于静原鸡。
28、优选地，步骤(1)中待测鸡的基因组dna来源于翅静脉血。
29、与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：
30、本专利技术提供一种用于静原鸡品种鉴定的snp引物组合，采用本专利技术的snp位点引物组合进行静原鸡品种鉴定时，任意1个snp位点基因型判定待测鸡为静原鸡的概率达到86.57％以上；任意2个snp位点联合基因型判定为静原鸡的概率达到83.58％以上；任意3个snp位点联合基因型判定为静原鸡的概率达到83.58％以上；任意4个snp位点联合基因型判定为静原鸡的概率达到91.79％以上；任意5个snp位点联合基因型判定为静原鸡的概率达到94.03％以上；任意6个snp位点联合基因型判定为静原鸡的概率达到96.27％以上；全部7个snp位点的联合基因型判定为静原鸡的概率为98.51％。将7个位点这一组合的预测结果通过roc曲线分析发现，静原鸡品种鉴别准确率为0.9938。任选5个snp位点组合，根据静原鸡基因型的判定，检测成功率即可达到94％以上。这种方法操作简便，准确性高，可以有效打击市场假冒的静原鸡产品。
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1.一种用于静原鸡品种鉴定的SNP引物组合，其特征在于，所述引物组合包括鉴定如下JY1～JY7中的任意5～7个位点的引物：
2.根据权利要求1所述的SNP引物组合，其特征在于，所述引物组合鉴定的位点包括：JY1+JY2+JY3+JY4+JY5、JY1+JY2+JY3+JY4+JY6、JY1+JY2+JY3+JY5+JY6、JY1+JY2+JY3+JY5+JY7、JY1+JY2+JY3+JY6+JY7、JY1+JY2+JY4+JY5+JY6、JY1+JY2+JY4+JY5+JY7、JY1+JY2+JY4+JY6+JY7、JY1+JY2+JY5+JY6+JY7、JY1+JY3+JY4+JY5+JY6、JY1+JY3+JY4+JY5+JY7、JY1+JY3+JY4+JY6+JY7、JY1+JY3+JY5+JY6+JY7、JY1+JY4+JY5+JY6+JY7、JY2+JY3+JY4+JY6+JY7、JY2+JY4+JY5+JY6+JY7、JY3+JY4+JY5+JY6+JY7、JY1+JY2+JY3+JY4+JY5+JY6、JY1+JY2+JY3+JY4+JY5+JY7、J
3.根据权利要求1或2所述的一种用于静原鸡品种鉴定的SNP引物组合，其特征在于，各SNP引物的序列为：
4.权利要求1～3任意一项所述SNP引物组合在静原鸡品种鉴定中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述鉴定的方法包括如下步骤：
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，步骤(1)中待测鸡的基因组DNA来源于翅静脉血。
...【技术特征摘要】
1.一种用于静原鸡品种鉴定的snp引物组合，其特征在于，所述引物组合包括鉴定如下jy1～jy7中的任意5～7个位点的引物：
2.根据权利要求1所述的snp引物组合，其特征在于，所述引物组合鉴定的位点包括：jy1+jy2+jy3+jy4+jy5、jy1+jy2+jy3+jy4+jy6、jy1+jy2+jy3+jy5+jy6、jy1+jy2+jy3+jy5+jy7、jy1+jy2+jy3+jy6+jy7、jy1+jy2+jy4+jy5+jy6、jy1+jy2+jy4+jy5+jy7、jy1+jy2+jy4+jy6+jy7、jy1+jy2+jy5+jy6+jy7、jy1+jy3+jy4+jy5+jy6、jy1+jy3+jy4+jy5+jy7、jy1+jy3+jy4+jy6+jy7、jy1+jy3+jy5+jy6+jy7、jy1+jy4+jy5+jy6+jy7、jy2+jy3+jy4+jy6+jy7、jy2+jy4+jy5...
【专利技术属性】
技术研发人员：田亚东，乐雅馨，翟彬，吴星，职毅豪，屈丰乐，袁伟东，康相涛，刘小军，李文婷，李东华，张彦华，宫玉杰，李国喜，蒋瑞瑞，李红，孙桂荣，韩瑞丽，李转见，张娟，
申请(专利权)人：河南农业大学，
类型：发明
国别省市：
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