【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子遗传学，具体涉及一种与玉米籽粒性状相关的snp分子标记组合及其应用。
技术介绍
1、玉米是重要的粮食、经济和饲料作物。高产是玉米育种的最重要的目标之一，粒长、粒宽和百粒重等籽粒相关性状是决定玉米单产水平的关键因子，遗传力较高。因此，解析玉米籽粒相关性状遗传基础，对玉米高产种质资源创新和新品种培育具有理论指导意义。
2、与传统育种提升产量的方式不同，分子标记技术更加高效、可靠，大大缩短了玉米育种的进程。近些年来，rflp(restriction fragment length polymorphism)、ssr(simplesequence repeats)、snp(single nucleotide polymorphism)等多种分子标记被用于玉米育种工作，这对快速鉴定玉米粒重、促进玉米产量的提升有一定的促进作用。其中，snp作为一种常见的遗传变异形式，普遍存在于生物基因组中，约占所有已知变异的90％。虽然snp位点出现的频率较高，但并非所有的snp位点都能成为性状相关候选标记，其主要与snp发生的位置有关。zm00001d014723基因位于玉米5号染色体上，目前还未见有关于zm00001d014723基因位置上的snp的报道，因此，在zm00001d014723基因位置挖掘并鉴定出与玉米籽粒性状相关的优良等位变异，并且开发相应的分子标记，对于高产玉米的选育具有重要的生产应用价值。
技术实现思路
1、针对上述现有技术，本专利技术的目的是提供一种与玉
2、为实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
3、本专利技术的第一方面，提供一种与玉米籽粒性状相关的snp分子标记组合，包括第一分子标记和第二分子标记；
4、所述第一分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，seq id no.1所示序列自5’端起第65位碱基是snp位点，其碱基是t或c；
5、所述第二分子标记的的核苷酸序列如seq id no.2所示，seq id no.2所示序列自5’端起第25位碱基是snp位点，其碱基是c或t。
6、第一分子标记的核苷酸序列具体如下：
7、cagtagacacatcggctctgaagactggcatgcacacatgcacatctggaaacgacaatgagggyacagagtctgtgtgggataggtatgaaaataacctgcaagtgttcgctga
8、注：序列中的加粗阴影处的核苷酸为snp位点，核苷酸多态性为t/c，在序列表中以“y”进行表示。
9、第二分子标记的核苷酸序列具体如下：
10、ctgctggtgcatccatagaaatctytggttcaagcagcttaataagtgatcaa gtgggag
11、注：序列中的加粗阴影处的核苷酸为snp位点，核苷酸多态性为c/t，在序列表中以“y”进行表示。
12、本专利技术在玉米zm00001d014723基因的编码区筛选到两个与玉米籽粒性状相关的snp位点。这两个snp位点的位置分别为seq id no.3所示的zm00001d014723基因编码区的第936位核苷酸和第1112位核苷酸。基于这两个snp位点，本专利技术进一步开发设计了第一分子标记和第二分子标记，其中，第一分子标记在snp位点处的碱基为t，第二分子标记在snp位点处的碱基为c时对应高粒重性状，二者组合使用以用于玉米籽粒性状的检测和高产玉米品种的选育。
13、本专利技术的第二方面，提供上述snp分子标记组合在如下(1)或(2)中的应用：
14、(1)筛选或鉴定玉米种质资源的籽粒性状；
15、(2)玉米分子标记辅助育种。
16、上述应用中，所述籽粒性状包括：百粒重、粒长和粒宽。
17、上述应用中，所述玉米分子标记辅助育种具体为：高产玉米自交系的选育。
18、本专利技术的第三方面，提供用于扩增上述snp分子标记组合的引物对，包括：用于检测第一分子标记的引物对a和用于检测第二分子标记的引物对b；
19、引物对a的核苷酸序列如seq id no.4和seq id no.5所示。具体如下：
20、p-936-f1：5’-cagtagacacatcggctctg-3’；(seq id no.4)
21、p-936-r1：5’-tcagcgaacacttgcaggtta-3’。(seq id no.5)
22、引物对b的核苷酸序列如seq id no.6-seq id no.8所示。具体如下：
23、p-1112-f2-1：5’-gaaggtgaccaagttcatgctctgctggtgcatccatagaaatctt-3’；(seqid no.6)
24、p-1112-f2-2：5’-gaaggtcggagtcaacggattgctggtgcatccatagaaatctc-3’；(seqid no.7)
25、p-1112-r2：5’-ctcccacttgatcacttattaagctgc-3’。(seq id no.8)。
26、其中，p-1112-f2-1中的阴影区域表示fam蓝色荧光的序列；p-1112-f2-2中的阴影区域表示hex红色荧光的序列。
27、本专利技术的第四方面，提供含有上述引物对的试剂盒。
28、利用上述引物对或者试剂盒可以对上述snp分子标记组合进行扩增或检测。其中，对于第一分子标记，是通过引物对a扩增后利用酶切进行鉴定；对于第二分子标记，是通过引物对b扩增后根据荧光信号颜色进行鉴定。
29、本专利技术的第五方面，提供上述引物对或试剂盒在如下(1)或(2)中的应用：
30、(1)筛选或鉴定玉米种质资源的籽粒性状；
31、(2)玉米分子标记辅助育种。
32、上述应用中，所述籽粒性状包括：百粒重、粒长和粒宽。
33、上述应用中，所述玉米分子标记辅助育种具体为：高产玉米自交系的选育。
34、本专利技术的第六方面，提供一种检测玉米籽粒性状的方法，包括以下步骤：
35、以待测玉米的基因组dna为模板，利用seq id no.4和seq id no.5所示的引物对a进行pcr扩增，根据扩增结果对第一分子标记的snp位点处的基因型进行鉴定；利用seq idno.6-seq id no.8所示的引物对b进行pcr扩增，根据扩增结果对第二分子标记的snp位点处的基因型进行鉴定；
36、第一分子标记为tt基因型且第二分子标记为cc基因型的玉米自交系，其百粒重、粒长和粒宽高于第一分子标记为cc基因型且第二分子标记为tt基因型的玉米自交系。
37、优选的，利用限制性内切酶bsesi酶切引物对a扩增后的pcr产物，根据酶切产本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与玉米籽粒性状相关的SNP分子标记组合，其特征在于，包括第一分子标记和第二分子标记；
2.权利要求1所述的SNP分子标记组合在如下(1)或(2)中的应用：
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述籽粒性状包括：百粒重、粒长和粒宽。
4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述玉米分子标记辅助育种具体为：高产玉米自交系的选育。
5.用于扩增权利要求1所述的SNP分子标记组合的引物对，其特征在于，包括：用于检测第一分子标记的引物对A和用于检测第一分子标记的引物对B；
6.含有权利要求5所述的引物对的试剂盒。
7.权利要求5所述的引物对或权利要求6所述的试剂盒在如下(1)或(2)中的应用：
8.一种检测玉米籽粒性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，利用限制性内切酶BseSI酶切引物对A扩增后的PCR产物，根据酶切产物的条带数量对第一分子标记的SNP位点处的基因型进行鉴定；若只有一个115bp的条带，则为TT基因型，若有50bp和65
10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，根据引物对B扩增后的荧光信号颜色对第二分子标记的SNP位点处的基因型进行鉴定；若荧光信号为红色，则为CC基因型，若荧光信号为蓝色，则为TT基因型。
...【技术特征摘要】
1.一种与玉米籽粒性状相关的snp分子标记组合，其特征在于，包括第一分子标记和第二分子标记；
2.权利要求1所述的snp分子标记组合在如下(1)或(2)中的应用：
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述籽粒性状包括：百粒重、粒长和粒宽。
4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述玉米分子标记辅助育种具体为：高产玉米自交系的选育。
5.用于扩增权利要求1所述的snp分子标记组合的引物对，其特征在于，包括：用于检测第一分子标记的引物对a和用于检测第一分子标记的引物对b；
6.含有权利要求5所述的引物对的试剂盒。
7.权利要求5所...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵翔宇，周超，赵丫杰，蒲梦琳，王勃辉，郑光明，
申请(专利权)人：山东农业大学，
类型：发明
国别省市：
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