【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及植物分子生物学领域，特别是涉及一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性主效基因的引物对及其应用。
技术介绍
1、水稻(学名：oryza sativa l.)属于草本稻属的一种，作为世界三大粮食作物(小麦、水稻和玉米)之一，养活了全球近三分之二的人口，在我国也有超过半数人以之为主粮。近几十年来，各种水稻病害范围的不断扩大和频频爆发，水稻产量和品质也受到严重影响，粮食安全问题日益严重。水稻细菌性条斑病(bacterial leafstreak，bls)简称细条病，是由革兰氏阴性菌黄单胞菌水稻变种xanthomonas oryzae pv.oryzicola(简称xooc)侵染引起的。细条病是国内调运植物应检疫的危险性病害之一，目前亚洲和大洋洲一些国家将其列为重要的检疫性水稻病害。水稻细菌性条斑病也是我国四大水稻病害(水稻纹枯病、白叶枯病、稻瘟病和细条病)之一，水稻细条病流行的因素主要包括病原物、感病品种和适宜发病的环境条件。
2、近年来，水稻细条病发病时间逐年变早，发病范围不断扩大，发病程度也愈演愈烈。据研究调查，在自然条件下，细条病对感病品种会引起15-25％的减产，且发病严重的情况下，产量减少可达40-60％。该病的发生在轻病田减产10％-20％，在重病田减产高达50％-60％。人们常采用噻菌铜、噻唑锌、叶枯唑、灰霜特、代森铵、农用链霉素等药剂去防治细条病的发生。但农药的滥用对生态环境会造成很大的危害，因此，随着人们对食品安全和生态环境的保护意识不断提高，利用分子生物学等手段培育无污染、无公害的抗病品种，提高植
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性主效基因的引物对及其应用，以解决上述现有技术存在的问题。本专利技术发掘并利用水稻抗细菌性条斑病的主效基因(命名为bls3)，开发出可用于辅助育种的引物对，该引物对能够有效区别抗细菌性条斑病的水稻品种和易感细菌性条斑病的水稻品种。
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供了一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性的引物对，所述引物对包括如seq id no.1所示的上游引物和如seq id no.2所示的下游引物。
4、进一步优选的，所述引物对扩增得到的分子标记在于水稻第一条染色体上。
5、本专利技术提供了一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性的产品，所述产品中包括上述的引物对。
6、优选的，所述产品包括试剂、试剂盒和芯片。
7、本专利技术提供了上述的引物对或上述的产品在鉴定水稻细菌性条斑病抗性中的应用。
8、本专利技术提供了一种鉴定水稻细菌性条斑病抗性的方法，包括以下步骤：
9、以待测样本的基因组为样本模板dna，水稻rl6的基因组为阳性模板dna，以水稻9311的基因组为阴性模板dna；
10、将样本模板dna、阳性模板dna和阴性模板dna分别与上述的引物对混合后，进行pcr扩增，得到扩增产物的带型，根据带型判断待测样本对水稻细菌性条斑病抗性。
11、优选的，当所述样本模板dna的带型与所述阳性模板dna带型相同时，判断待测样本为抗细菌性条斑病的水稻品种；当所述样本模板dna的带型与所述阴性模板dna带型相同时，判断待测样本为易感细菌性条斑病的水稻品种。
12、优选的，所述pcr的反应体系为：模板dna 1μl、上游引物0.8μl、下游引物0.8μl、bffuer 1μl、dntp 0.2μl和taq酶0.1μl。
13、优选的，所述pcr的反应程序为：94℃预变性5min，94℃变性30s，55℃-62℃退火30s，72℃延伸45s，72℃再延伸5min，35个循环。
14、本专利技术还提供了上述的引物对或上述的产品在水稻育种中的应用。
15、本专利技术公开了以下技术效果：
16、1、通过本专利技术提供的引物对能够定位水稻品种中抗细条病的主效基因。
17、2、本专利技术提供的引物对可以预测水稻植株的细菌性条斑病的抗性。因此，该引物对可以用于水稻品种或品系的基因型检测，判断水稻品种或品系是否具有细菌性条斑病抗性，进而快速筛选抗病品种或品系用于水稻育种。
18、3、辅助育种选择目标明确，节约成本。在传统育种方法中，一般首先要收集具有抗病基因的亲本与栽培品种进行一系列杂交，而且要对水稻品种进行抗细菌性条斑病性状的鉴定并进行选择育种，选育工作繁琐、耗时，同时还受环境影响很大。然而，通过检测抗细菌性条斑病主效基因位点，可以在苗期就鉴定出高抗病的单株，淘汰其他植株，不仅能够节约生产成本，而且大大提高抗细条病水稻的选择效率，极大地缩短水稻品种的育种周期。
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1.一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性的引物对，其特征在于，所述引物对包括如SEQID NO.1所示的上游引物和如SEQ ID NO.2所示的下游引物。
2.一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性的产品，其特征在于，所述产品中包括权利要求1所述的引物对。
3.根据权利要求2所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂、试剂盒和芯片。
4.权利要求1所述的引物对或权利要求2或3所述的产品在鉴定水稻细菌性条斑病抗性中的应用。
5.一种鉴定水稻细菌性条斑病抗性的方法，其特征在于，包括以下步骤：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，当所述样本模板DNA的带型与所述阳性模板DNA带型相同时，判断待测样本为抗细菌性条斑病的水稻品种；当所述样本模板DNA的带型与所述阴性模板DNA带型相同时，判断待测样本为易感细菌性条斑病的水稻品种。
7.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述PCR的反应体系为：模板DNA 1μL、上游引物0.8μL、下游引物0.8μL、Bffuer 1μL、dNTP 0.2μL和Taq酶0.1μL。
...【技术特征摘要】
1.一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性的引物对，其特征在于，所述引物对包括如seqid no.1所示的上游引物和如seq id no.2所示的下游引物。
2.一种用于鉴别水稻细菌性条斑病抗性的产品，其特征在于，所述产品中包括权利要求1所述的引物对。
3.根据权利要求2所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂、试剂盒和芯片。
4.权利要求1所述的引物对或权利要求2或3所述的产品在鉴定水稻细菌性条斑病抗性中的应用。
5.一种鉴定水稻细菌性条斑病抗性的方法，其特征在于，包括以下步骤：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，当所述样本模板dna的带型与所述阳性模板dna带型相...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘芳，万瑶，邓子秋，唐敏，黄洁怡，韦璇，覃雪梅，
申请(专利权)人：广西大学，
类型：发明
国别省市：
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