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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及膨腹海马体厚关联snp位点的纯合双倍v型在育种中的应用,属于水产育种。
技术介绍
1、体厚的大小与海马产量密切相关。目前,由于养殖海马无序自交和缺乏种质资源把控,导致海马种质资源衰退,海马养殖品种体厚显著降低,极大地影响了海马的体重和产量。
2、目前,人工培育的优良海马养殖品系依然缺乏。研究团队已培育出海马速生品系f3代,在其中筛选出了体厚显著提高的群体,并定位体厚关联snp,以期提高海马养殖产量。
3、目前,尚无膨腹海马(distended hippocampus)体厚关联snp位点应用于育种的报道,与之相似的是膨腹海马体长关联snp位点在育种中的应用。然而,体长关联snp的关键基因只能关联海马体长,无法关联海马体厚,无法应用于体厚大小筛选。
技术实现思路
1、为解决现有技术的不足,本专利技术提供膨腹海马体厚关联snp位点的双倍型在育种中的应用,以期选育体厚较大的膨腹海马,提高膨腹海马的产量,推动膨腹海马工厂化养殖的发展。
2、为实现上述目标,本专利技术采用如下技术方案:
3、膨腹海马体厚关联snp位点的纯合双倍v型在育种中的应用,其中,双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成,其中,单倍i型的csf2rb基因外显子227处和300处的碱基分别是t、c,单倍ii型的csf2rb基因外显子227处和300处的碱基分别是t、a,单倍iii型的csf2rb基因外显子227处和300处的碱基分别是g、a,csf2rb
4、本专利技术的有益之处在于:将膨腹海马csf2rb基因(集落刺激因子2受体亚基β的编码基因)的2个snp位点(分别位于csf2rb基因外显子227和300处)与膨腹海马体厚进行关联分析,发现该2个snp位点与体厚显著相关,其中,单倍iii型(g227a300)个体体厚显著提高。通过进一步对纯合双倍i型(di)、杂合双倍ii型(dii)、纯合双倍iii型(diii)、杂合双倍iv型(div)、纯合双倍v型(dv)5种双倍型个体进行体厚和csf2rb基因表达对比分析,发现膨腹海马体厚和csf2rb基因的表达在速生品系f3代与普通群体中存在显著差异,其中,纯合双倍v型(dv)膨腹海马的平均体厚和csf2rb基因相对表达量均显著高于其它4种双倍型,纯合双倍v型(dv)可作为体厚相关的分子标记,应用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种,以提高海马产量。
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1.膨腹海马体厚关联SNP位点的纯合双倍V型在育种中的应用,其特征在于,其中,双倍型由单倍I型、单倍II型、单倍III型随机形成,其中,单倍I型的CSF2RB基因外显子227处和300处的碱基分别是T、C,单倍II型的CSF2RB基因外显子227处和300处的碱基分别是T、A,单倍III型的CSF2RB基因外显子227处和300处的碱基分别是G、A,CSF2RB基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示,3种单倍型随机形成纯合双倍I型T227T227C300C300、杂合双倍II型T227T227C300A300、纯合双倍III型T227T227A300A300、杂合双倍IV型T227G227A300A300和纯合双倍V型G227G227A300A300 5种双倍型,纯合双倍V型相比于其它4种双倍型在平均体厚和CSF2RB基因相对表达方面具有显著优势,纯合双倍V型可用于膨腹海马速生新品系分子辅助育种。
【技术特征摘要】
1.膨腹海马体厚关联snp位点的纯合双倍v型在育种中的应用,其特征在于,其中,双倍型由单倍i型、单倍ii型、单倍iii型随机形成,其中,单倍i型的csf2rb基因外显子227处和300处的碱基分别是t、c,单倍ii型的csf2rb基因外显子227处和300处的碱基分别是t、a,单倍iii型的csf2rb基因外显子227处和300处的碱基分别是g、a,csf2rb基因的核苷酸序列如seq id no:1或seq id ...
【专利技术属性】
技术研发人员:张宁,王文豪,齐鲁,胡乐彬,赵日祥,宋明毅,王建春,李磊,苏晓磊,王凯,
申请(专利权)人:烟台宗哲海洋科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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