【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及基因农业，具体涉及一种与红米直链淀粉含量相关的基因序列片段及红米直链淀粉含量改良方法。
技术介绍
1、水稻是全球最重要的粮食作物，大约有一半以上的人口以水稻为主食。日常食用的白米一般都是精米，在加工过程中损失了80％的营养。红米等有色米富含花青素、不饱和脂肪酸、谷维素、维生素和多种矿物质，有抗氧化、清除自由基、控血糖、抗衰老的功效，是营养价值较高的食品。但红米的食用以糙米为主，食味欠佳，适口性不如平时食用的白米精米，且难以消化，所以很少被当作主食。因此，红米只被当作杂粮，偶尔出现在餐桌上。定向改良红米的直链淀粉含量，提高其适口性，培育好吃又不失营养的红米品种，对于推动红米产业发展具有重要意义。
2、“皮鼓粘”是贵州的优质特色种质资源，收集于贵州省盘州市，其作为盘州红米的一员在2016年被列为国家地理标志产品，其米饭色泽红润，营养物质丰富，具有抗氧化，降血糖等药用作用，为药食两用的稻米之一。但“皮鼓粘”直链淀粉含量较高(20％左右)，另因红米的食用以糙米为主，导致其口感较硬，难以消化，营养品质高但口感差限制了其推广和应用，如何降低“皮鼓粘”的直链淀粉含量并改善其适口性是当下亟待解决的问题。
3、研究表明稻米中淀粉是胚乳的主要组成成分(占干重的90％)，淀粉的含量、组成和结构决定了稻米的软度和适口性，一般来说，低或中等直链淀粉含量的熟米粒具有弹性、粘性和光滑的质地，适口性更好(li h,prakash s,nicholsont m,et al.the importanceofamylose an
4、对wx基因的编码区进行敲除，会造成wx基因表达完全丧失，稻米直接变成直链淀粉几乎不存在的糯米。因此，如何协调水稻特别是“皮鼓粘”等红米的直链淀粉含量和优良营养品质，精准改良红米“皮鼓粘”等的直链淀粉含量，但是不改变其品质，既是提高水稻食味品质的现实需要，也是农业可持续发展的需要。
技术实现思路
1、为解决现有技术中存在的上述问题，本专利技术提供与红米直链淀粉含量相关的基因序列片段及红米直链淀粉含量改良方法，具体是通过以下技术方案得以实现。
2、一种与红米直链淀粉含量相关的基因序列片段，该基因序列片段位于淀粉颗粒型结合酶wx基因的启动子区域起始密码子上游2206-2183bp的区域以及wx基因的起始密码子上游2050-2027bp的区域。其核苷酸序列如seq id no.1所示：
3、seq id no.1：
4、tgtatctggttttgcggttgaaggacggaaattggatttattgacaagtcaagggaccttagatgaacttattcctttttatatttgcacaggcctaatttcaagtccagcccagctttcttcagcctgtttgataattctctctagcttattacagccgtgggagaggagatatacagctacaagattacaagtcgatgtatacagcaaacccatgagctgattgcctgattagacggtaagaatgcatccctgagaagcaaatgcatcaccaaatttgtagcttagataaatgctgtgacctgcaagaaaataaaattaaaatcaaaataaaagaaaagcgcaggtaattgacaccccacgcatataagtgtagatacataacacgttcatctaatcatcttaattagacttaggtaaaactacaatgaggtttatgtcctacggaatgacgacaagctagcagcacagaggcacagatcatatcgtctccagactcaagtgcacgttgatcgttcgctcactgcttcatcgatcatccctttgtcgaggcgttagttggcaggcactaatagctacagtaaagtaaagagcaacgtgccaacgtacgcacgctaacgtgagtcatgtagcgtaattccaagttcttttttttttgtcagcacgtacaagcagccgctagcctcgccctgcatgagaagctcgcggcgcgccaccaaactggcaggcactcagctcgctgctggtcccgcacgtcgccacacgatcgacgtacgcacgcgagcgagatccaccgatggtttacgcgtacgccgacggctcacacatcccccggtgcccaacagaaaccacacaccacccgcacgaaaaaaaccgaaccgcacgtgcgcgcgcgctccacgcacaccccaaacagacggcacggcgggagcgcgcgcgcgcacgcgagccgaggagaaaacaaacgggggaaacaagctggaaaagcaaaaggggaaaagaacggagcggaggcttcacccacggccaccgcgacgcgccaccagcgtgcggtgcaatgcaacgtacgccaagccgaaacggcaggcagcatcgcgcacgcacgcacacacaggccacagcacacgc本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与红米直链淀粉含量相关的基因序列片段，其特征在于，该基因序列片段位于淀粉颗粒型结合酶Wx基因的启动子区域起始密码子上游2206-2183bp的区域以及Wx基因的起始密码子上游2050-2027bp的区域。
2.如权利要求1所述的基因序列片段，其特征在于，其包含2034-2033bp中间插入或不插入A的CT区域。
3.权利要求1所述的基因序列片段，在水稻改良及育种方面的应用。
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述水稻改良及育种方面，具体是抑制或者敲除权利要求1所述基因序列片段，可以有效降低稻米直链淀粉含量；过表达权利要求1所述基因序列片段，可以有效提高稻米直链淀粉含量。
5.权利要求1所述的基因序列片段的编辑方法，其特征在于，包括如下步骤：
6.如权利要求5所述的编辑方法，其特征在于，所述靶序列位于Wx基因的起始密码子上游2206-2183bp的区域以及Wx基因的起始密码子上游2050-2027bp的区域。
7.如权利要求5所述的编辑方法，其特征在于，所述sgRNA为sgRNA1和sgRNA2；
8.一种精确改良红米直链淀粉含量的方法，其特征在于，抑制或者敲除权利要求1所述基因序列片段。
9.如权利要求8所述的方法，其特征在于，所述抑制或者敲除权利要求1所述基因序列片段，是采用权利要求5所述方法进行敲除，经基因编辑后，获得突变型红米植株，所述红米植株上的一个或者两个所述靶序列发生突变。
...【技术特征摘要】
1.一种与红米直链淀粉含量相关的基因序列片段，其特征在于，该基因序列片段位于淀粉颗粒型结合酶wx基因的启动子区域起始密码子上游2206-2183bp的区域以及wx基因的起始密码子上游2050-2027bp的区域。
2.如权利要求1所述的基因序列片段，其特征在于，其包含2034-2033bp中间插入或不插入a的ct区域。
3.权利要求1所述的基因序列片段，在水稻改良及育种方面的应用。
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述水稻改良及育种方面，具体是抑制或者敲除权利要求1所述基因序列片段，可以有效降低稻米直链淀粉含量；过表达权利要求1所述基因序列片段，可以有效提高稻米直链淀粉含量。
5.权利要求1所述的基因序列片段的编辑方法，其特征在于，包括如下步骤：<...
【专利技术属性】
技术研发人员：方中明，杨小川，武文豪，赵全志，周丽洁，宋晓燕，
申请(专利权)人：贵州大学，
类型：发明
国别省市：
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