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【技术实现步骤摘要】
本申请涉及一种病毒dna、rna共提取试剂盒及提取方法,属于生物。
技术介绍
1、病毒按照基因组的类型不同,分为dna病毒和rna病毒。dna和rna共提取的关键在于裂解液,dna的提取方法有sds法、胍盐法。鉴于rna的提取需要消除rna酶的影响(rna酶广泛存在,而且很难消除),而高浓度的胍盐可以灭活rna酶,因此胍盐法很适合既提取dna,又提取rna的实验。
2、利用磁珠法提取核酸的应用已经很广泛,磁珠在吸附核酸时,会优先吸附大片段的核酸,因为大片段的核酸所带负电荷的量更多。因此病毒核酸的片段大小不同,被磁珠吸附的难易程度不同。小病毒的核酸片段相应较小,因此更难吸附,例如猪圆环病毒、hbv病毒。因此提取小病毒的核酸,对试剂的要求更高。现在市场上的试剂盒难以兼顾所有种类病毒的提取,尤其是小病毒的提取,在小病毒核酸提取时的性能比较差,存在漏检现象。
3、而且,目前存在的同时提取病毒dna和rna的试剂盒往往需要设置不同的洗脱温度或者洗脱液,导致提取步骤繁琐,因此目前需要一种步骤简单的能同时提取病毒dna和rna,适用范围宽广,能兼顾小病毒核酸的提取方法。
技术实现思路
1、针对现有技术的不足,本专利技术提供了一种操作简单、适用范围广泛的dna、rna共提取试剂盒,包括如下成份:裂解液、结合液、漂洗液1、漂洗液2、洗脱液、磁珠和rna助沉剂;其中,裂解液包括异硫氰酸胍1m-6m,盐酸胍2-7m,10-500 mm tris-hcl((ph为7.5~8.5))
2、在本专利技术的实施例中,漂洗液2包括75~80%(v/v)的乙醇。结合液为醇类中的至少一种,优选地,所述结合液选自甲醇、乙醇、丙醇、异丙醇中的至少一种,更优选地,所述结合液为异丙醇。
3、在本专利技术的实施例中,磁珠为硅羟基磁珠,磁珠用量为1-3mg,磁珠的粒径为300nm,优选地,所述磁珠的浓度为50mg/ml,用量为20-60μl。
4、在本专利技术的实施例中,洗脱液为:depc水。
5、在本专利技术的实施例中,rna助沉剂为carrier rna,所述助沉剂用量为3-12μg。
6、在本专利技术的优选实施例中,病毒dna/rna共提取试剂盒,所述提取试剂盒包括以下组分:
7、裂解液,所述裂解液包括2m异硫氰酸胍,4m盐酸胍,50 mm tris-hcl(ph=8)、150mm氯化钠、50mmedta-2na(ph=8)、5%的吐温20(v/v)、sls十二烷基肌氨酸钠0.5%(m/v)、100mm的nacl;
8、结合液:异丙醇;
9、磁珠:硅羟基磁珠,浓度为50mg/ml,用量为30μl,磁珠的粒径为300nm;
10、carrier rna:每反应,向裂解液中加入8μg的carrier rna,震荡混匀后作为裂解液工作液;这里的carrier rna为“翌圣生物科技上海有限公司”的商品,货号:19704es01。
11、漂洗液1,所述漂洗液1包括1 m异硫氰酸胍或盐酸胍、50mm tris-hcl(ph=8)、5%的吐温20(v/v)(此吐温20的作用是减小漂洗过程中磁珠的聚集成团,并粘1.5ml离心管管壁的现象);
12、漂洗液2,所述漂洗液2为80%的乙醇(v/v);
13、洗脱液,所述洗脱液为depc水。
14、本专利技术另一方面还提供了一种dna和rna同提取的手动提取方法,其特征在于,包括以下步骤:
15、1)制备裂解工作液总体系:按照提取350μl的样本量,需加入396μl的裂解液和132μl的结合液,以及rna助沉剂混匀,得到裂解工作液总体系, 优选地,rna助沉剂为carrierrna,用量为3-12μg,在本专利技术的一个优选实施例中,用量为8μg。在本专利技术的具体实施例中,配置裂解工作液总体系还要计算冗余:比如共提取5个样本,需加入396×5.03,即1992μl的裂解液,132×5.03μl,即665μl的异丙醇,以及40μl的carrier rna(1μg/μl,carrier rna不需要计算冗余);
16、2)向离心管中依次加入10μl蛋白酶k(40mg/ml)、350μl样本、525μl步骤1)制备的裂解工作液,震荡混匀,短离,于金属浴上65-75℃、800rpm,裂解10-15min,其中短离是指使用掌上离心机,离心5s以内,目的是把管壁和管盖上的液体轻轻的离心下来;
17、3)静置5min,待温度降到室温,加入30μl磁珠,震荡混合均匀,室温放置10min,期间不时颠倒混匀,使磁珠保持悬浮状态。短离,放置于磁力架上静置,待磁珠完全吸附后,吸弃上清;
18、4)第一次漂洗:继续加入500μl漂洗液1,震荡混合均匀30s,短离,放置于磁力架上静置,待磁珠完全吸附后,吸弃上清;
19、5)第二次漂洗:继续加入500μl漂洗液2,震荡混合均匀30s,短离,放置于磁力架上静置,待磁珠完全吸附后,吸弃上清;
20、6)第三次漂洗:重复步骤5)一次;
21、7)晾干:短离上一步的离心管,静置,吸弃残余的液体,并敞开盖子,空气干燥7-10min;
22、8)洗脱:加入50-100μl洗脱液,用移液枪吹吸混匀,于金属浴上,1600rpm,50-60℃孵育10min。短离,将管盖上的蒸发的液体离心下来。最后,放置于磁力架上,静置后吸取上清,即得到含有病毒dna、rna的上清液,优选地洗脱温度为56℃。在本专利技术的实施例中,所述样本包括无细胞体液,优选地,所述样本选自血清、血浆、组织研磨液的离心上清中的至少一种。
23、本申请的有益效果包括但不限于:
24、1、通过carrier rna的运用,使得灵敏度得到提高。本试剂盒通过对比不同量的carrier rna提取效果,发现每份样本添加8μg时,病毒检测的ct值最小;
25、2、通过优化裂解液中各组分的搭配、各组分的最适浓度,使病毒核酸得到最大程度释放;
26、3、通过优化裂解液和异丙醇的比例、磁珠的用量,使磁珠和病毒核酸的结合达到最大化;
27、4、由于于磁珠优先吸附大核酸片段,因此,对于较小的病毒,其核酸长度较短,不易于被磁珠吸附。针对此问题,我们选择猪圆环病毒(病毒粒子最小的一种病毒)作为研究对象,结果证明我们的试剂盒在检测小病毒时灵敏度很好,与竞本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种病毒DNA、RNA共提取的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括裂解液、结合液、漂洗液1、漂洗液2、洗脱液、磁珠和RNA助沉剂,其中:
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述漂洗液2包括75~80%的乙醇(v/v);所述洗脱液包括DEPC水。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述结合液包括醇类中的至少一种。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述磁珠为硅羟基磁珠,用量为1~3mg,粒径为300nm。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述RNA助沉剂为carrier RNA,所述助沉剂用量为3-12μg。
6.权利要求1-5任一所述试剂盒的提取方法,其特征在于,所述提取方法包括以下步骤:
7.根据权利要求6所述的提取方法,其特征在于,所述RNA助沉剂用量为3-12μg。
8.根据权利要求6所述的提取方法,其特征在于,在检测多个样本时,步骤1)中制备裂解工作液总体系时裂解液和结合液需要计算冗余。
9.根据权利要求6所述的提取方法,其特征在于,
10.根据权利要求6所述的提取方法,其特征在于,所述样本包括无细胞体液。
...【技术特征摘要】
1.一种病毒dna、rna共提取的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括裂解液、结合液、漂洗液1、漂洗液2、洗脱液、磁珠和rna助沉剂,其中:
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述漂洗液2包括75~80%的乙醇(v/v);所述洗脱液包括depc水。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述结合液包括醇类中的至少一种。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述磁珠为硅羟基磁珠,用量为1~3mg,粒径为300nm。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述rna助沉剂为carrie...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨志豪,王真真,刘小娜,庄晓英,
申请(专利权)人:天津迈基生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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