【技术实现步骤摘要】
本申请实施例涉及分子生物学，特别是涉及一种用于构建椰子snp指纹图谱的snp位点组合及应用。
技术介绍
1、椰子(cocosnuciferal.)是重要的热带油料作物、景观植物和果树，素有“生命之树”之称。椰子在世界上约93个国家和地区被广泛种植，全球总种植面积约1.8亿亩，在热带地区人民的经济生活中具有至关重要的地位。椰子在我国已有2000多年的种植历史，在海南、云南、广东、广西等地均有种植。椰子广泛分布在亚洲、非洲、美洲和太平洋岛国等地，存在丰富的地方特色品种，包括非洲高种、海南高种、斯里兰卡高种、红矮、黄矮、褐矮、香水等多个品种。繁多的品种和复杂的遗传背景，给椰子品种鉴定带来了巨大的挑战。
2、dna指纹图谱技术是基于dna分子标记建立的能够用于种质资源分类鉴定的一种现代手段。构建植物品种dna指纹图谱，可以克服单纯依据形态特征鉴定品种的局限性，这对于开展种质资源精准鉴定与基因发掘工作十分重要。dna指纹图谱技术在品种资源多样性和品种鉴定研究中被广泛应用，但在椰子上鲜有相关报道。且目前已有的品种鉴定标准大多是基于ssr、rapd、rflp标记，罕见基于snp分子标记构建指纹图谱实现椰子品种鉴定的方法。
技术实现思路
1、有鉴于此，本申请实施例提供一种用于构建椰子snp指纹图谱的snp位点组合及应用，以327个椰子样本为研究对象，利用基于遗传算法的指纹计算软件gasnp准确获得多态性高，可区分所有样本的snp位点组合，通过计算得到260个核心snp位点信息，利用这些
2、本申请实施例第一方面提供一种用于构建椰子snp指纹图谱的snp位点组合，所述snp位点组合包括位于染色体chr01～chr16上的260个snp位点。
3、在可以包括上述实施例的一些实施例中，所述snp位点包括：
4、第1号位点，其位于1号染色体第11190781bp上，变异类型为t/g；
5、第2号位点，其位于1号染色体第12235818bp上，变异类型为g/a；
6、第3号位点，其位于1号染色体第17980352bp上，变异类型为a/g；
7、第4号位点，其位于1号染色体第110680094bp上，变异类型为a/g；
8、第5号位点，其位于1号染色体第144832968bp上，变异类型为c/g；
9、第6号位点，其位于1号染色体第146014481bp上，变异类型为t/a；
10、第7号位点，其位于1号染色体第146793777bp上，变异类型为a/g；
11、第8号位点，其位于1号染色体第154417159bp上，变异类型为c/t；
12、第9号位点，其位于1号染色体第157934494bp上，变异类型为a/g；
13、第10号位点，其位于1号染色体第159488786bp上，变异类型为a/g；
14、第11号位点，其位于1号染色体第1177659160bp上，变异类型为a/g；
15、第12号位点，其位于1号染色体第1205295810bp上，变异类型为c/t；
16、第13号位点，其位于1号染色体第1209649951bp上，变异类型为g/a；
17、第14号位点，其位于1号染色体第1210539345bp上，变异类型为t/c；
18、第15号位点，其位于1号染色体第1213678628bp上，变异类型为t/c；
19、第16号位点，其位于2号染色体第25511596bp上，变异类型为a/t；
20、第17号位点，其位于2号染色体第242777399bp上，变异类型为t/c；第18号位点，其位于2号染色体第2104373536bp上，变异类型为c/t；第19号位点，其位于2号染色体第2134120172bp上，变异类型为t/c；第20号位点，其位于2号染色体第2139741917bp上，变异类型为t/c；第21号位点，其位于2号染色体第2140969969bp上，变异类型为a/g；第22号位点，其位于2号染色体第2141004076bp上，变异类型为a/g；第23号位点，其位于2号染色体第2144312732bp上，变异类型为c/g；第24号位点，其位于2号染色体第2155951920bp上，变异类型为c/t；第25号位点，其位于2号染色体第2168814238bp上，变异类型为g/a；第26号位点，其位于2号染色体第2171030095bp上，变异类型为t/a；第27号位点，其位于2号染色体第2173296480bp上，变异类型为a/g；第28号位点，其位于2号染色体第2175131148bp上，变异类型为c/g；第29号位点，其位于2号染色体第2175229826bp上，变异类型为t/c；第30号位点，其位于2号染色体第2177772806bp上，变异类型为a/c；第31号位点，其位于2号染色体第2184028384bp上，变异类型为g/a；第32号位点，其位于2号染色体第2184558347bp上，变异类型为t/c；第33号位点，其位于2号染色体第2185183473bp上，变异类型为t/a；第34号位点，其位于2号染色体第2186374217bp上，变异类型为c/t；第35号位点，其位于3号染色体第37077949bp上，变异类型为c/a；第36号位点，其位于3号染色体第39467662bp上，变异类型为a/g；第37号位点，其位于3号染色体第323482912bp上，变异类型为g/a；第38号位点，其位于3号染色体第333226223bp上，变异类型为g/a；第39号位点，其位于3号染色体第333957544bp上，变异类型为a/g；第40号位点，其位于3号染色体第334035592bp上，变异类型为a/g；第41号位点，其位于3号染色体第344675912bp上，变异类型为c/t；第42号位点，其位于3号染色体第349598945bp上，变异类型为a/g；第43号位点，其位于3号染色体第349967597bp上，变异类型为a/g；第44号位点，其位于3号染色体第350712941bp上，变异类型为g/t；第45号位点，其位于3号染色体第355447906bp上，变异类型为a/g；第46号位点，其位于3号染色体第356509055bp上，变异类型为c/t；第47号位点，其位于3号染色体第357193563bp上，变异类型为t/c；第48号位点，其位于3号染色体第363014229bp上，变异类型为g/a；第49号位点，其位于3号染色体第364932466bp上，变异类型为g/a；第50号位点，其位于3号染色体第368304699bp上，变异类型为c/t；第51号位点，其位于3本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于构建椰子SNP指纹图谱的SNP位点组合，其特征在于，所述SNP位点组合包括位于染色体Chr01～Chr16上的260个SNP位点。
2.根据权利要求1所述的用于构建椰子SNP指纹图谱的SNP位点组合，所述SNP位点包括：
3.一种椰子DNA指纹图谱，其特征在于，利用权利要求1或2所述的SNP位点组合构建而成。
4.权利要求1或2所述的SNP位点组合在构建椰子DNA指纹图谱中的应用。
5.权利要求1或2所述的SNP位点组合在椰子种质资源分类鉴定方面的应用。
6.一种利用权利要求1或2所述的SNP位点组合鉴定椰子种质的方法，其特征在于，包括如下步骤：
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述椰子样品为椰子新鲜叶片。
【技术特征摘要】
1.一种用于构建椰子snp指纹图谱的snp位点组合，其特征在于，所述snp位点组合包括位于染色体chr01～chr16上的260个snp位点。
2.根据权利要求1所述的用于构建椰子snp指纹图谱的snp位点组合，所述snp位点包括：
3.一种椰子dna指纹图谱，其特征在于，利用权利要求1或2所述的snp位点组合构建而成。
...【专利技术属性】
技术研发人员：杨壮，罗杰，肖勇，穆治华，刘振寰，夏薇，刘贤青，
申请(专利权)人：海南大学，
类型：发明
国别省市：
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