【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及猪育种改良，尤其涉及一种基于abhd4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法。
技术介绍
1、繁殖性状、肉质性状、胴体性状以及生长性状是猪的主要经济性状，这些主要经济性状的遗传改良直接关系生猪的养殖成本及养殖效率。生长性状及酮体性状一直是遗传改良的重点，猪生长的性状通常用生长速度、饲料转化率、日采食量、100kg背膘厚度等来表示，这些性状的遗传系数中等，是可以通过遗传选择来改善的。胴体性状以胴体重、屠宰率、胴体长度、胴体瘦肉率、脂肪率等表示，这些性状大多是高度遗传性状。在漫长的育种改良过程中，传统的育种方式弊端逐渐显现，例如一些遗传力较低的性状，依据传统的育种方式进行改良的收效甚微。随着现代生物技术的发展，新的遗传育种改良方式开始出现。
2、利用现代生物技术进行分子辅助标记选择是目前常用的育种方法，而有效的分子标记是分子育种的前提和保障。对目的性状功能基因snp分子遗传标记的检测，能提高育种过程中基因组选择的准确性。因此，通过鉴定猪重要经济性状功能基因可为后续猪育种实际工作提供更多理论依据。
3、现阶段，猪的全基因组关联分析(gwas)、高通量测序等实施以来，检测到的候选基因和功能位点很多，但是可以应用的、真正有效应的主效基因和关键致因突变并不多。
技术实现思路
1、为解决
技术介绍
中所提出的技术问题，本专利技术提供一种评估大白猪背膘及眼肌面积的方法。
2、本专利技术采用以下技术方案实现：一种基于abhd4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积
3、位于abhd4基因第9外显子区的g.76405883a>g位点；
4、位于abhd4基因第9外显子区的g.76405942t>c位点；
5、位于abhd4基因第9外显子区的g.76405956g>a位点；
6、位于abhd4基因第9外显子区的g.76406109a>g位点；
7、位于abhd4基因下游调控区的g.76432041c>t位点；
8、具体地，位于abhd4基因第9外显子区的g.76405942t>c位点，所述大白猪的背膘从大到小，对应的基因型排序依次为：tt基因型、cc基因型、tc基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：tt基因型、tc基因型、cc基因型。
9、具体地，所述位于abhd4基因第9外显子区的g.76405956g>a位点，所述大白猪的背膘从大到小，对应的基因型排序依次为：gg基因型、ag基因型、aa基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：gg基因型、ag基因型、aa基因型。
10、具体地，位于abhd4基因第9外显子区的g.76406109a>g位点，所述大白猪的背膘从大到小，对应的基因型排序依次为：aa基因型、ga基因型、gg基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：aa基因型、ga基因型、gg基因型
11、具体地，位于abhd4基因下游调控区的g.76432041c>t位点，所述大白猪的背膘从大到小，对应的基因型排序依次为：cc基因型、ct基因型、tt基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：cc基因型、ct基因型、tt基因型。
12、一种引物对组合，用于检测大白猪的snp分子标记，其中:
13、检测位于abhd4基因第9外显子区的g.76405883a>g位点，其正向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.1所示，其反向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.2所示；
14、检测位于abhd4基因第9外显子区的g.76405942t>c位点，其正向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.3所示，其反向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.4所示；
15、检测位于abhd4基因第9外显子区的g.76405956g>a位点，其正向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.5所示，其反向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.6所示；
16、检测位于abhd4基因第9外显子区的g.76406109a>g位点，其正向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.7所示，其反向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.8所示；
17、检测位于abhd4基因下游调控区的g.76432041c>t位点，其正向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.9所示，其反向引物的核苷酸序列为序列表seq id no.10所示。
18、一种试剂盒，其包含上述的引物对组合。
19、相比现有技术，本专利技术的有益效果在于：
20、本方案以大白猪以及长白猪为试验群体，测定100kg体重日龄、100kg背膘厚、100kg眼肌面积三个性状的表型，采集耳组织并提取基因组dna，针对abhd4基因全覆盖外显子区、基因上游及下游调控区2000-3000bp设计引物，通过混池测序，共检测abhd4基因的5个snp位点。利用飞行时间质谱方法对筛选出的5个snp位点进行基因分型，并对snp位点与三个性状进行关联分析以及基因型之间的两两比较。
21、本方案提出的评估方法以及用到的snp分子标记为猪的生长性状的育种、改良提供了良好的理论支撑和有效的指导意见。
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1.一种基于ABHD4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，确定所述大白猪的SNP分子标记，判读所述SNP分子标记是否为如下SNP分子标记中的一种，具体为：
2.如权利要求1所述的一种基于ABHD4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，位于ABHD4基因第9外显子区的g.76405942T>C位点，所述大白猪的背膘厚度从大到小，对应的基因型排序依次为：TT基因型、CC基因型、TC基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：TT基因型、TC基因型、CC基因型。
3.如权利要求1所述的一种基于ABHD4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，所述位于ABHD4基因第9外显子区的g.76405956G>A位点，所述大白猪的背膘厚度从大到小，对应的基因型排序依次为：GG基因型、AG基因型、AA基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：GG基因型、AG基因型、AA基因型。
4.如权利要求1所述的一种基于ABHD4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，位于ABH
5.如权利要求1所述的一种基于ABHD4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，位于ABHD4基因下游调控区的g.76432041C>T位点，所述大白猪的背膘厚度从大到小，对应的基因型排序依次为：CC基因型、CT基因型、TT基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：CC基因型、CT基因型、TT基因型。
6.一种引物对组合，其特征在于，用于检测大白猪的SNP分子标记，其中:
7.一种试剂盒，其特征在于，其包含如权利要求6所述的引物对组合。
8.如权利要求6所述的引物对组合在如下任一项中的应用：鉴定大白猪眼肌面积性状、提高大白猪眼肌面积、鉴定大白猪背膘厚度性状、提高大白猪背膘厚度性状、大白猪遗传育种。
...【技术特征摘要】
1.一种基于abhd4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，确定所述大白猪的snp分子标记，判读所述snp分子标记是否为如下snp分子标记中的一种，具体为：
2.如权利要求1所述的一种基于abhd4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，位于abhd4基因第9外显子区的g.76405942t>c位点，所述大白猪的背膘厚度从大到小，对应的基因型排序依次为：tt基因型、cc基因型、tc基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：tt基因型、tc基因型、cc基因型。
3.如权利要求1所述的一种基于abhd4基因的评估大白猪背膘及眼肌面积的方法，其特征在于，所述位于abhd4基因第9外显子区的g.76405956g>a位点，所述大白猪的背膘厚度从大到小，对应的基因型排序依次为：gg基因型、ag基因型、aa基因型；所述大白猪的眼肌面积从大到小，对应的基因型排序依次为：gg基因型、ag基因型、aa基因型。
4.如权利要求1所述的一种基于abhd4基因的评估大白猪背膘及眼肌面...
【专利技术属性】
技术研发人员：史丽莎，郑先瑞，殷宗俊，张晓东，丁月云，马淑雅，李文玺，
申请(专利权)人：安徽农业大学，
类型：发明
国别省市：
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