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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,特别涉及一种高效区分多个烟草品种的snp标记法。
技术介绍
1、在种质资源鉴定、烟草育种、烤烟生产中都有烟草品种区分的需求。烟草品种区分主要是采用形态学鉴定、生理生化指标分析、分子标记技术等。通过在田间大量种植进行烟草品种的独特性、均匀性和稳定性(dus)测试,存在周期长、难度大、劳动强度高、易受环境影响等问题;生理生化指标分析一般需要专业的仪器设备和专业人员,且可用的指标有限,在品种间多态性不佳;ssr分子标记技术因具有多态性高、共显性、可稳定遗传优点被应用于作物品种鉴定,但存在数量有限、检测通量不高、环境不友好等缺点,已不足能满足如今大规模的检测要求。snp分子标记是第三代分子,是通过检测snp位点的变异情况来确定个体之间的遗传差异,具有高度稳定性和高通量检测的优势,已被广泛的应用于水稻、小麦、玉米、大豆等作物的品种真实性鉴定和纯度检测。
技术实现思路
1、本专利技术所要解决的技术问题是提供一种高效区分多个烟草品种的snp标记法,其能区分7种云南代表性烟草品种,可结合自动化的仪器实现高通量低成本的检测,适用于烟草品种的分子辅助育种、烤烟的品种鉴定、烟叶的真实性鉴别等应用场景。
2、本专利技术所要解决的技术问题是通过以下技术方案来实现的:
3、一种高效区分多个烟草品种的snp标记,snp标记为8个,所述8个snp标记信息如下:
4、
5、优选地,上述技术方案中,每个标记包括3条引物,分别为等位基因特异性引物x、y以及通用引物c,在其中两条特异性引物的5'端分别连接fam和hex荧光接头序列。
6、优选地,上述技术方案中,所述引物序列如下:
7、nt901740_k01的引物序列如seq id no.1-3所示;
8、nt901749_k01的引物序列如seq id no.4-6所示;
9、nt901754_k01的引物序列如seq id no.7-9所示;
10、nt901758_k01的引物序列如seq id no.10-12所示;
11、nt901766_k01的引物序列如seq id no.13-15所示;
12、nt901767_k01的引物序列如seq id no.16-18所示;
13、nt901775_k01的引物序列如seq id no.19-21所示;
14、nt901776_k01的引物序列如seq id no.22-24所示。
15、一种用于高效区分多个烟草品种的试剂盒,所述试剂盒中包含引物组。
16、优选地,上述技术方案中,还包含:用于dna提取的试剂、用于pcr扩增的反应体系以及用于基因型分型检测的kasp反应试剂。
17、一种分子标记或引物组或试剂盒的以下任一种应用:
18、(1)在鉴定烟草品种资源中的应用;
19、(2)在构建烟草品种dna指纹图谱中的应用;
20、(3)在烟草品种的分子辅助育种中的应用;
21、(4)在烟叶的真实性鉴别中的应用;
22、(5)在烟草的品种溯源中的应用。
23、一种鉴定多个烟草品种的方法,所述方法包括以下步骤:
24、(1)提取待测烟草样品的dna;
25、(2)使用引物组进行pcr扩增,利用扫描仪对扩增产物进行荧光检测,根据荧光检测结果确定样品的基因型。
26、优选地,上述技术方案中,如果样品pcr产物只检测到特异性引物x对应荧光信号,则检测位点的基因型为等位基因x;如果只检测到特异性引物y对应荧光信号,则检测位点基因型为等位基y;如果同时检测到两种荧光信号,则检测位点基因型为杂合型。
27、本专利技术上述技术方案,具有如下有益效果:
28、本专利技术提供一套高效鉴别7种云南烟草品种的snp分子标记。该分子标记应用kasp技术原理进行基因分型,特异性好,成本低廉,操作简便,搭配自动化仪器可以实现自动化的高通量检测。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种高效区分多个烟草品种的SNP标记,其特征在于,SNP标记为8个,所述8个SNP标记信息如下:
2.一种用于高效区分烟草品种的SNP标记的KASP引物组,其特征在于,每个标记包括3条引物,分别为等位基因特异性引物X、Y以及通用引物C,在其中两条特异性引物的5'端分别连接FAM和HEX荧光接头序列。
3.根据权利要求2所述的用于高效区分烟草品种的SNP标记的KASP引物组,其特征在于,所述引物序列如下:
4.一种用于高效区分多个烟草品种的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含权利要求2-3任一所述的引物组。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包含:用于DNA提取的试剂、用于PCR扩增的反应体系以及用于基因型分型检测的KASP反应试剂。
6.根据权利要求1所述的分子标记或根据权利要求2-3任一所述的引物组或根据权利要求4-5任一所述的试剂盒的以下任一种应用:
7.一种鉴定多个烟草品种的方法,其特征在于,包括以下步骤:
8.根据权利要求7所述的鉴定多个烟草品种的方法,其特征在于,如果样品
...【技术特征摘要】
1.一种高效区分多个烟草品种的snp标记,其特征在于,snp标记为8个,所述8个snp标记信息如下:
2.一种用于高效区分烟草品种的snp标记的kasp引物组,其特征在于,每个标记包括3条引物,分别为等位基因特异性引物x、y以及通用引物c,在其中两条特异性引物的5'端分别连接fam和hex荧光接头序列。
3.根据权利要求2所述的用于高效区分烟草品种的snp标记的kasp引物组,其特征在于,所述引物序列如下:
4.一种用于高效区分多个烟草品种的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含权利要求2-3任一所述的引物组。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,...
【专利技术属性】
技术研发人员:曾婉俐,向海英,高茜,钱颖颖,李雪梅,米其利,王萝萍,许力,王昆淼,
申请(专利权)人:云南中烟工业有限责任公司,
类型:发明
国别省市:
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