【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本公开大体涉及用于访问抗体产品信息以及鉴定并获得相关抗体产品的在线或其他电子系统。
技术介绍
1、抗体产品被分类并提供以帮助许多领域中的研究者，该领域包括例如细胞分析、基因组学、蛋白质组学、药物发现、生物防御、环境诊断、表观遗传学和干细胞研究。现有的在线或其他电子目录容易提供产品可用性和价格信息。然而，没有以足够容易消化和比较大量抗体产品的形式提供其他重要的产品信息。
技术实现思路
1、作为抗体产品的消费者，科学家和研究人员通常需要分析关于特定产品的特性的信息，而不仅仅是可用性和价格。科学家还可能对确定与他们的研究领域相关的所有产品(例如，可用于研究靶蛋白内感兴趣的特定氨基酸领域的所有产品)的可用性感兴趣。
2、然而，使用目前可用的系统，发现在特定实验中使用的正确抗体产品是耗时且麻烦的。关于用于产生抗体产品的抗原或免疫原的信息对于鉴定用于特定目的的最佳抗体产品是关键的。然而，当前系统没有足够的工具来提供这种信息。这样的信息通常被隐藏在产品描述中，并且科学家和研究人员必须通过多个产品描述逐个地手动解析以确定抗原或免疫原信息。这些搜索的耗时方面是复杂的，因为必须从每种抗体产品的详细描述审阅基于文本的信息，并且不能容易地在产品之间比较该信息。
3、因此，需要一种与抗体产品相关的大量氨基酸序列数据的智能、定制且用户友好的视觉表示，该视觉表示易于由科学家和研究人员访问、解释和比较。
4、本专利技术的实施方案涉及用于抗体产品的交互式用户界面。该界面使得能够对
5、某些实施方案可以提供以下技术优点中的一个或多个技术优点。从以紧凑视觉格式呈现细节获得了优点和效率。所公开的实施方案通过使用用户友好信息图，提供了在审阅、分析、评估和比较对应于抗体产品的免疫原或抗原信息方面的显著改进，该用户友好信息图传达每种产品的氨基酸序列信息，否则难以消化、分析或可视化抗体产品，并且尤其是难以在抗体产品之间进行比较。信息图以有组织且紧凑的格式提供，一目了然地传达先前隐藏和混乱的信息。用户界面实施方案的视觉交互元素还促进有效地搜索和鉴定相关抗体产品。以这种方式，免疫原或抗原信息的复杂性被转化为简单易理解的视觉格式，提供高度直观的界面，其中高级特征(例如氨基酸序列信息)易于辨别的界面。
6、本文描述了用于交互式用户界面的各种计算机实现的系统、方法和制品，该交互式用户界面用于生成计算机实现的交互式图形用户界面，该计算机实现的交互式图形用户界面用于利用对免疫原或抗原信息的视觉评估来促进发现适当的抗体产品，该计算机实现的系统、方法和制品可改进确定针对关于上述各种挑战的特定实验的正确抗体产品。
7、根据以下说明书以及附图，本专利技术主题的各个目的、特征、方面和优点将变得更加明显，在附图中，相似的附图标记代表相似的部件。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种用于生成计算机实现的交互式图形用户界面的方法，所述计算机实现的交互式图形用户界面用于利用对序列信息的视觉评估来促进发现适当的抗体产品，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括相对于感兴趣的序列氨基酸序列区域指示符显示的表位指示符。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述序列信息图包括代表给定靶蛋白的氨基酸序列范围的基层、代表所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符的第二层和代表表位的第三层。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括与所述给定靶蛋白的所述氨基酸序列范围内的数据点相关的视觉元素。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述视觉元素包括以下中的至少一者：代表特定数据点的第一视觉指示符、代表两个数据点之间的间隔的第二视觉指示符、代表估计的数据点的第三视觉指示符、代表包括至少一个估计的数据点的估计的间隔的第四视觉指示符。
6.根据权利要求1所述的方法，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符代表以下中的至少一者：特定氨基酸序列值、氨基酸序列值范围
7.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括检测指示与所述感兴趣的氨基酸序列区域相关的边界元素的移动的输入，其中所述边界元素代表氨基酸边界值。
8.根据权利要求7所述的方法，所述方法还包括通过排除具有在所述氨基酸边界值之外的至少一个氨基酸序列范围值的抗体产品而响应于所述输入更新所述图形用户界面内的所述抗体产品列表。
9.根据权利要求7所述的方法，其中所述边界元素包括在视觉上位于代表所述氨基酸序列范围的值的间隔上的滑块。
10.根据权利要求9所述的方法，其中所述滑块在所述间隔上的定位指示在所述抗体产品列表中包括的抗体产品的所述氨基酸序列范围中的边界值。
11.根据权利要求9所述的方法，其中将所述滑块从第一定位移动到第二定位指示从第一边界值到第二边界值的改变。
12.根据权利要求9所述的方法，其中将所述滑块从第一定位移动到第二定位指示所述氨基酸序列范围的长度的变化。
13.根据权利要求1所述的方法，其中显示还包括沿着所述给定靶蛋白的所述氨基酸序列范围的视觉表示比对所述多个序列信息图中的每个序列信息图。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述序列信息图使得能够基于序列大小、序列位置和序列重叠中的至少一者对序列进行视觉评估。
15.根据权利要求1所述的方法，其中所述序列信息包括免疫原信息、抗原信息和表位信息中的一者或多者。
16.根据权利要求1所述的方法，其中生成所述序列信息图还包括生成包括所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符的所述序列信息图的三维模型。
17.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括生成代表所述多个序列信息图的多维蛋白质模型。
18.根据权利要求17所述的方法，所述方法还包括将所述多个序列信息图中的每个序列信息图在视觉上区分为多维模型的层。
19.根据权利要求18所述的方法，所述方法还包括相对于每一层的对应的氨基酸序列沿着所述多维模型在视觉上比对每一层。
20.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括生成多维蛋白质模型，所述多维蛋白质模型包括至少一个水平的蛋白质结构的视觉表示。
21.根据权利要求20所述的方法，其中所述至少一个水平的蛋白质结构包括一级蛋白质结构、二级蛋白质结构、三级蛋白质结构和四级蛋白质结构中的一者。
22.根据权利要求20所述的方法，所述方法还包括将所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符定位在所述至少一个水平的蛋白质结构上。
23.一种非暂态计算机可读介质，所述非暂态计算机可读介质包括存储一个或多个指令的存储器，所述指令在由至少一个计算设备的一个或多个处理器执行时，执行用于生成计算机实现的交互式图形用户界面的一个或多个步骤，所述计算机实现的交互式图形用户界面用于利用对序列信息的视觉评估来促进发现适当的抗体产品，所述生成计算机实现的交互式图形用户界面的一个或多个步骤通过以下进行：
24.根据权利要求23所述的非暂态计算机可读介质，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括相对于感兴趣的序列氨基酸序列区域指示符显示的表位指示符。
25.根据权利要求24所述的非暂态计算机可读介质，其中所述序列信息图包括代表给定靶蛋白的氨基酸序列范围的基层、代表所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符的第二层和代表表位的第三层。
26.根据权利要求25所述的非暂态计...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于生成计算机实现的交互式图形用户界面的方法，所述计算机实现的交互式图形用户界面用于利用对序列信息的视觉评估来促进发现适当的抗体产品，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括相对于感兴趣的序列氨基酸序列区域指示符显示的表位指示符。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述序列信息图包括代表给定靶蛋白的氨基酸序列范围的基层、代表所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符的第二层和代表表位的第三层。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括与所述给定靶蛋白的所述氨基酸序列范围内的数据点相关的视觉元素。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述视觉元素包括以下中的至少一者：代表特定数据点的第一视觉指示符、代表两个数据点之间的间隔的第二视觉指示符、代表估计的数据点的第三视觉指示符、代表包括至少一个估计的数据点的估计的间隔的第四视觉指示符。
6.根据权利要求1所述的方法，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符代表以下中的至少一者：特定氨基酸序列值、氨基酸序列值范围、氨基酸序列起始值、氨基酸序列终止值和氨基酸序列中间值。
7.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括检测指示与所述感兴趣的氨基酸序列区域相关的边界元素的移动的输入，其中所述边界元素代表氨基酸边界值。
8.根据权利要求7所述的方法，所述方法还包括通过排除具有在所述氨基酸边界值之外的至少一个氨基酸序列范围值的抗体产品而响应于所述输入更新所述图形用户界面内的所述抗体产品列表。
9.根据权利要求7所述的方法，其中所述边界元素包括在视觉上位于代表所述氨基酸序列范围的值的间隔上的滑块。
10.根据权利要求9所述的方法，其中所述滑块在所述间隔上的定位指示在所述抗体产品列表中包括的抗体产品的所述氨基酸序列范围中的边界值。
11.根据权利要求9所述的方法，其中将所述滑块从第一定位移动到第二定位指示从第一边界值到第二边界值的改变。
12.根据权利要求9所述的方法，其中将所述滑块从第一定位移动到第二定位指示所述氨基酸序列范围的长度的变化。
13.根据权利要求1所述的方法，其中显示还包括沿着所述给定靶蛋白的所述氨基酸序列范围的视觉表示比对所述多个序列信息图中的每个序列信息图。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述序列信息图使得能够基于序列大小、序列位置和序列重叠中的至少一者对序列进行视觉评估。
15.根据权利要求1所述的方法，其中所述序列信息包括免疫原信息、抗原信息和表位信息中的一者或多者。
16.根据权利要求1所述的方法，其中生成所述序列信息图还包括生成包括所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符的所述序列信息图的三维模型。
17.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括生成代表所述多个序列信息图的多维蛋白质模型。
18.根据权利要求17所述的方法，所述方法还包括将所述多个序列信息图中的每个序列信息图在视觉上区分为多维模型的层。
19.根据权利要求18所述的方法，所述方法还包括相对于每一层的对应的氨基酸序列沿着所述多维模型在视觉上比对每一层。
20.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括生成多维蛋白质模型，所述多维蛋白质模型包括至少一个水平的蛋白质结构的视觉表示。
21.根据权利要求20所述的方法，其中所述至少一个水平的蛋白质结构包括一级蛋白质结构、二级蛋白质结构、三级蛋白质结构和四级蛋白质结构中的一者。
22.根据权利要求20所述的方法，所述方法还包括将所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符定位在所述至少一个水平的蛋白质结构上。
23.一种非暂态计算机可读介质，所述非暂态计算机可读介质包括存储一个或多个指令的存储器，所述指令在由至少一个计算设备的一个或多个处理器执行时，执行用于生成计算机实现的交互式图形用户界面的一个或多个步骤，所述计算机实现的交互式图形用户界面用于利用对序列信息的视觉评估来促进发现适当的抗体产品，所述生成计算机实现的交互式图形用户界面的一个或多个步骤通过以下进行：
24.根据权利要求23所述的非暂态计算机可读介质，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括相对于感兴趣的序列氨基酸序列区域指示符显示的表位指示符。
25.根据权利要求24所述的非暂态计算机可读介质，其中所述序列信息图包括代表给定靶蛋白的氨基酸序列范围的基层、代表所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符的第二层和代表表位的第三层。
26.根据权利要求25所述的非暂态计算机可读介质，其中所述感兴趣的氨基酸序列区域指示符包括与所述给定靶蛋白的所述氨基酸序列范围内的数据点相关的视觉元素。
27.根据权利要求26所述的非暂态计算机可读介质，其中所述视觉元素包括以下中的至少一者：代表特定数据点的第一视觉指示符、代表两个数据点之间的间隔的第二视觉指示符、代表估计的...
【专利技术属性】
技术研发人员：B·约翰逊，R·萨缪逊，M·罗索，
申请(专利权)人：皮尔斯生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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