【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学鉴定领域，具体涉及一种鉴定定安猪品种的snp位点组合及应用。
技术介绍
1、定安猪主要分布于海南定安县雷鸣、龙门等乡镇，是历经百年自然选育遗留的宝贵生猪种质资源，属海南猪四大类群之一，是海南省的特色品种猪之一。定安猪属脂肪性猪种，其具有耐高温、耐粗饲的优点，其肉质细腻，是海南省风味独特的知名品牌猪肉，已作为我国优质地方猪种入选至海南省畜禽遗传资源保护名录。
2、近年来受外来地方猪种对海南生猪市场的冲击及非洲猪瘟等因素的影响，纯种定安猪数量持续减少，开展定安猪特色遗传资源的研究，促进纯种定安猪的群体保护，对我国生猪种业的特色发展及种质资源库的多样性的维持具有重要意义。其中利用生物信息技术开展定安猪特色品种位点的挖掘，实现基因层面对定安猪独特遗传特征的精准鉴定，是海南定安猪的遗传资源精准保护的重要部分。
3、单核苷酸多态性（snp，single nucleotide polymorphism）是最常见的遗传变异形式之一，广泛存在于生物基因组中，也是在基因组中最常见的遗传标记。在生物群体的遗传关系分析、遗传结构分析、致病基因挖掘等多个方面均有重要的应用价值。
4、中国地方猪各品种在长期的选育中通常会在基因组中留下大量的选择印记，这些选择印记可作为该品种在基因组中独特的基因标记，应用于该品种的纯度鉴定。全基因组关联分析（genome wide association study，gwas）及选择信号分析是筛选差异位点的有效方法。两者相结合可进一步保障筛选群体间差异位点的可靠性。
技术实现思路
1、为了克服现有技术的不足和缺点，本专利技术的首要目的在于提供一种鉴定定安猪品种的snp位点组合。
2、本专利技术的另一目的在于提供上述鉴定定安猪品种的snp位点组合的应用。
3、本专利技术的再一目的在于提供一种快速鉴定定安纯种猪品种的方法。
4、本专利技术的目的通过下述技术方案实现：
5、一种鉴定定安猪品种的snp位点组合，包含53个snp位点，命名为snp位点1-53，所述的53个snp位点的物理位置基于猪的参考基因组sscrofa11.1进行序列对比而确定，所述的53个snp位点的位置及变异信息如下所示：
6、snp位点1位于1号染色体，其物理位置为34353526，突变类型为a/g；
7、snp位点2位于1号染色体，其物理位置为34355278，突变类型为a/c；
8、snp位点3位于1号染色体，其物理位置为63703594，突变类型为g/a；
9、snp位点4位于1号染色体，其物理位置为78237435，突变类型为a/g；
10、snp位点5位于1号染色体，其物理位置为126776991，突变类型为c/t；
11、snp位点6位于1号染色体，其物理位置为126816640，突变类型为t/c；
12、snp位点7位于1号染色体，其物理位置为226858077，突变类型为c/a；
13、snp位点8位于1号染色体，其物理位置为236235017，突变类型为a/c；
14、snp位点9位于1号染色体，其物理位置为236244731，突变类型为c/t；
15、snp位点10位于1号染色体，其物理位置为264711037，突变类型为c/a；
16、snp位点11位于2号染色体，其物理位置为1569508，突变类型为t/c；
17、snp位点12位于2号染色体，其物理位置为59443211，突变类型为g/a；
18、snp位点13位于2号染色体，其物理位置为62411060，突变类型为a/g；
19、snp位点14位于2号染色体，其物理位置为65269914，突变类型为t/c；
20、snp位点15位于2号染色体，其物理位置为72770530，突变类型为t/c；
21、snp位点16位于2号染色体，其物理位置为78142302，突变类型为a/g；
22、snp位点17位于2号染色体，其物理位置为78144554，突变类型为c/a；
23、snp位点18位于2号染色体，其物理位置为78175365，突变类型为g/c；
24、snp位点19位于2号染色体，其物理位置为95419435，突变类型为c/t；
25、snp位点20位于2号染色体，其物理位置为125112690，突变类型为a/g；
26、snp位点21位于2号染色体，其物理位置为132247545，突变类型为g/a；
27、snp位点22位于3号染色体，其物理位置为131466475，突变类型为t/c；
28、snp位点23位于4号染色体，其物理位置为29593079，突变类型为t/g；
29、snp位点24位于4号染色体，其物理位置为29594502，突变类型为c/a；
30、snp位点25位于4号染色体，其物理位置为29601230，突变类型为a/c；
31、snp位点26位于4号染色体，其物理位置为29605058，突变类型为t/c；
32、snp位点27位于4号染色体，其物理位置为29638456，突变类型为c/a；
33、snp位点28位于4号染色体，其物理位置为29901127，突变类型为a/g；
34、snp位点29位于5号染色体，其物理位置为1965872，突变类型为a/c；
35、snp位点30位于6号染色体，其物理位置为144225798，突变类型为g/a；
36、snp位点31位于8号染色体，其物理位置为45952780，突变类型为c/t；
37、snp位点32位于8号染色体，其物理位置为53146129，突变类型为a/g；
38、snp位点33位于8号染色体，其物理位置为113435311，突变类型为t/g；
39、snp位点34位于9号染色体，其物理位置为7865891，突变类型为t/c；
40、snp位点35位于10号染色体，其物理位置为6251171，突变类型为c/t；
41、snp位点36位于12号染色体，其物理位置为5189400，突变类型为t/c；
42、snp位点37位于13号染色体，其物理位置为37675655，突变类型为c/t；
43、snp位点38位于13号染色体，其物理位置为38684319，突变类型为a/g；
44、snp位点39位于13号染色体，其物理位置为76623007，突变类型为a/g；
45、snp位点40位于13号染色体，其物理位置为77372992，突变类型为t/c；
46、snp位点41位于13号染色体，其物理位置为78021287，突变类型为本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种鉴定定安猪品种的SNP位点组合，其特征在于包含53个SNP位点，命名为SNP位点1-53，所述的53个SNP位点的物理位置基于猪的参考基因组Sscrofa11.1进行序列对比而确定，所述的53个SNP位点的位置及变异信息如下所示：
2.权利要求1所述的SNP位点组合在鉴定定安猪品种中的应用。
3.一种检测权利要求1所述的SNP位点组合的产品在鉴定定安猪品种中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：
5.一种鉴定定安猪品种的分子探针组合，其特征在于所述的分子探针组合靶向权利要求1所述的SNP位点组合，用于检测权利要求1所述的SNP位点组合。
6.一种鉴定定安猪品种的基因芯片，其特征在于所述的基因芯片负载有权利要求5所述的分子探针组合。
7.一种快速鉴定定安猪品种的方法，其特征在于包含如下步骤：
8.根据权利要求7所述的快速鉴定定安猪品种的方法，其特征在于：
9.根据权利要求7所述的快速鉴定定安猪品种的方法，其特征在于：
10.根据权利要求7所述的快速鉴定定
...【技术特征摘要】
1.一种鉴定定安猪品种的snp位点组合，其特征在于包含53个snp位点，命名为snp位点1-53，所述的53个snp位点的物理位置基于猪的参考基因组sscrofa11.1进行序列对比而确定，所述的53个snp位点的位置及变异信息如下所示：
2.权利要求1所述的snp位点组合在鉴定定安猪品种中的应用。
3.一种检测权利要求1所述的snp位点组合的产品在鉴定定安猪品种中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：
5.一种鉴定定安猪品种的分子探针组合，其特...
【专利技术属性】
技术研发人员：辛文水，李梦雨，周身娉，李新建，王振宇，段栋栋，韩锦仪，符云桃，
申请(专利权)人：海南省农业科学院三亚研究院海南省实验动物研究中心，
类型：发明
国别省市：
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