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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物育种,尤其涉及一组茄子全基因组snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、茄子作为一种广泛种植的蔬菜作物,其品种选育对农业生产具有重要意义。传统的表型选择方法虽然在一定程度上有效,但存在诸多限制,如工作量大、育种周期长、精准度不足等。随着分子生物学技术的发展,分子设计育种技术为茄子育种提供了新的机遇。分子设计育种技术将实现对农艺性状的精确改良,显示出比其他育种手段更为突出的优越性,是今后作物育种技术发展的方向。
技术实现思路
1、本专利技术的目的之一在于提供一种snp分子标记组合在茄子品种真实性鉴定、品种身份鉴定、品种资源分类和/或指纹图谱构建中的应用,所述snp分子标记组合由360个snp标记组成,所述360个snp标记的snp位点信息参见具体实施方式中的表1,所述360个snp位点的物理位置是基于茄子全基因组序列比对确定的,其版本为eggplant genomeconsortiumv4.1。
2、优选地,包括将待测茄子样品的360个snp位点的基因型与目标品种的基因型进行比较,根据两者的基因型相似度判断待测茄子品种的真实性或品种身份。
3、更优选地,待测茄子品种的360个snp位点的基因型与目标品种的基因型相似度达到90%以上,则待测茄子样品与所述的目标品种属于同一品种。
4、本专利技术的目的之二在于提供一种snp分子标记引物组合,所述snp分子标记组合的核苷酸序列如seq id no.1-720所示。
5、本专利技
6、本专利技术的目的之四在于提供上述snp分子标记引物组合在茄子品种资源真实性和/或茄子品种身份鉴定中的应用。
7、本专利技术的目的之五在于提供上述snp分子标记引物组合在茄子指纹图谱构建中的应用。
8、本专利技术的目的之六在于提供一种用于茄子品种真实性鉴定、品种身份鉴定、品种资源分类和/或指纹图谱构建的产品,所述产品中含有上述snp分子标记引物组合。
9、优选地,所述产品为试剂盒。
10、与现有技术相比,本专利技术具有如下有益效果:
11、(1)与申请号为202210016550.7相比,本专利技术基于茄子全基因组开发的snp,均匀分布于茄子12条染色体上,覆盖面更广,密度更高。利用全基因组覆盖的snp分子标记,能够开展茄子种质资源dna指纹图谱及遗传多样性分析,表型关联分析,全基因组分子标记辅助育种,品种真实性鉴定及种子纯度鉴定,茄子分子设计育种等多种应用,解决重要经济性状形成与调控、作物对环境的响应机制及优质丰产生理基础等科学问题。该技术体系稳定性好,操作简单,很好的解决了之前全基因组分子标记成本过高的问题。
12、(2)茄子全基因组snp分子标记是高效育种技术体系,通过一次扩增反应(多重pcr),可实现360个snp位点的同时检测,效果好,成本低。本专利技术的技术方案能够实现茄子分子设计育种的流程化、信息化,大幅度提高我国茄子育种效率,缩短育种周期,促进农业发展。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种SNP分子标记组合在茄子品种真实性鉴定、品种身份鉴定、品种资源分类和/或指纹图谱构建中的应用,其特征在于,所述SNP分子标记组合由360个SNP标记组成,所述360个SNP标记的SNP位点信息如下:
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,包括将待测茄子样品的360个SNP位点的基因型与目标品种的基因型进行比较,根据两者的基因型相似度判断待测茄子品种的真实性或品种身份。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,待测茄子品种的360个SNP位点的基因型与目标品种的基因型相似度达到90%以上,则待测茄子样品与所述的目标品种属于同一品种。
4.一种SNP分子标记引物组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合的核苷酸序列如SEQID NO.1-720所示。
5.权利要求4中所述的SNP分子标记引物组合在茄子品种资源分类中的应用。
6.权利要求4中所述的SNP分子标记引物组合在茄子品种资源真实性和/或茄子品种身份鉴定中的应用。
7.权利要求4中所述的SNP分子标记引物组合在茄子指纹图谱构建中的应用。
< ...【技术特征摘要】
1.一种snp分子标记组合在茄子品种真实性鉴定、品种身份鉴定、品种资源分类和/或指纹图谱构建中的应用,其特征在于,所述snp分子标记组合由360个snp标记组成,所述360个snp标记的snp位点信息如下:
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,包括将待测茄子样品的360个snp位点的基因型与目标品种的基因型进行比较,根据两者的基因型相似度判断待测茄子品种的真实性或品种身份。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,待测茄子品种的360个snp位点的基因型与目标品种的基因型相似度达到90%以上,则待测茄子样品与所述的目标品种属于同一品种。
4.一种snp分子标记引...
【专利技术属性】
技术研发人员:王本启,张敏,谈杰,黄树苹,张洪源,陈霞,陈蓉,潜宗伟,王俊良,
申请(专利权)人:武汉市农业科学院,
类型:发明
国别省市:
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