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偏凸-柱穗山羊草双二倍体D基因组的SSR标记制造技术

技术编号:4346582 阅读:336 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本研究以双二倍体SDAU18、其亲本偏凸山羊草(DDMvMv)和柱穗山羊草(CCDD)以及两份粗山羊草Ae37(DD)和Ae44(DD)为材料,利用D基因组专化的258对SSR引物和11对EST-SSR引物对偏凸-柱穗山羊草双二倍体SDAU18中分别来自双亲的两个D基因组进行了鉴定。结果如下:在这269对引物中,有206对能在偏凸山羊草中扩增出带,出带率为76.6%,同时,有211对引物能在柱穗山羊草中扩增出带,出带率为78.4%;另外,在能在偏凸山羊草中扩增出带的206对引物中有181对引物扩出的带型能完全或部分体现在SDAU18的带型之中,并且,这181对引物覆盖了整个D基因组。

【技术实现步骤摘要】

偏凸-柱穗山羊草双二倍体D基因组的SSR标记,属于作物遗传育种学领域。
技术介绍
山羊草属是与小麦亲缘关系最为密切的属,全属有24个种,包括C、D、M、S和U等17个染色体组,蕴藏着许多抗病、抗虫、抗逆等有益基因,同时它在小麦进化中起着重要作用,并为小麦改良提供了一批优良基因。对山羊草属进行深入研究具有理论意义和应用价值。山羊草属均为一年生野生杂草,系禾本科、小麦族植物,全属包括11个二倍体种,7个四倍体种,2个六倍体种和2个兼有四倍体和六倍体的种,所有多倍体种均起源于不同二倍体的杂交和染色体加倍。经分类学、形态学、细胞学以及地理学等多方面的考证,将山羊草17个染色体组23种组合分为6个组24个种。山羊草属植物自然分布在西经10°至东经83°,北纬30°~49°的区域,主要以土耳其为中心,衍生在原苏联外高加索、伊朗、阿富汗、伊拉克、叙利亚等地中海沿岸国家。24个种分别具有各自相对独立的栖息地。中国的新疆和黄河流域是粗山羊草的主要分布地区,具有广泛的遗传多样性。
技术实现思路
偏凸山羊草(DDMVMV)和柱穗山羊草(CCDD)杂交F1经过染色体加倍获得了了它们的完全双二倍体SDAU18。本研究利用SSR技术对SDAU18中的两个分别来自不同亲本的D基因组进行了鉴定,为其在小麦遗传育种中的有效利用提供理论依据。本研究利用的实验材料为双二倍体SDAU18、其双亲偏凸山羊草和柱穗山羊草以及两份粗山羊草Ae37和Ae44。其中,偏凸山羊草、柱穗山羊草、粗山羊草引自中国农业科学院,SDAU18由国家小麦改良中心泰安分中心选育保存。结果与分析本研究利用普通小麦D染色体专化的258对SSR引物和11对EST-SSR引物,对SDAU18、其双亲偏凸山羊草和柱穗山羊草以及粗山羊草Ae37和Ae44之间的多态性进行了分析。获得的主要结果如下:偏凸山羊草和SDAU18的多态性表现绝大多数D组专化的SSR引物和EST引物都能在偏凸山羊草中扩增出带,出带率平均为76.6%。同时,从表1还可以看出绝大多数(平均为86.9%)能在偏凸山羊草中扩增出带的引物所产生的带型能完全(如图1引物Xgdm111-1D、Xwmc503-2D、图3引物Xgdm128-3D、Xgdm3-5D、BARC071-3D、Xgdm34-4D以及图5引物Xwmc503-2D、Xwmc552-3D扩增出的带型)或部分(如图1引物Xgwm337-1D、Xgdm107-2D和图2引物BARC183-6DS库增出的带型)体现在SDAU18的带型之中;前类引物有123对,后类引物有58对。柱穗山羊草和SDAU18的多态性表现绝大多数D组专化的SSR引物和EST引物都能在柱穗山羊草中扩增出带,出带率平均为78.4%。同时,从表2还可以看出多数(平均为56.0%)能在柱穗山羊草中扩增出-->带的引物所产生的带型能基本或部分体现在SDAU18的带型之中;前类引物有83对,后类引物有35对。-->本文档来自技高网...

【技术保护点】
本研究以双二倍体SDAU18、其亲本偏凸山羊草(DDMvMv)和柱穗山羊草(CCDD)以及两份粗山羊草Ae37(DD)和Ae44(DD)为材料,利用D基因组专化的258对SSR引物和11对EST-SSR引物对偏凸-柱穗山羊草双二倍体SDAU18中分别来自双亲的两个D基因组进行了鉴定,获得的主要结果如下:在这269对引物中,有206对能在偏凸山羊草中扩增出带,出带率为76.6%,同时,有211对引物能在柱穗山羊草中扩增出带,出带率为78.4%;另外,在能在偏凸山羊草中扩增出带的206对引物中有181对引物扩出的带型能完全或部分体现在SDAU18的带型之中,并且,这181对引物覆盖了整个D基因组,同时,在能在柱穗山羊草中扩增出带的211对引物中有118对引物扩出的带型能完全或部分体现在SDAU18的带型之中,并且这118对引物也覆盖了整个D基因组;此外,还有10对引物虽能同时在偏凸山羊草和柱穗山羊草中扩增出带,但这些谱带均未能在SDAU18的带型中体现出来;此外,还有5对引物能在SDAU18中扩增出双亲所没有的特征带,这说明SDAU18含有双亲的所有D染色体的遗传物质,同时也说明偏凸山羊草和柱穗山羊草的遗传物质在SDAU18中已发生了一定程度的结构性变化。...

【技术特征摘要】
1.本研究以双二倍体SDAU18、其亲本偏凸山羊草(DDMvMv)和柱穗山羊草(CCDD)以及两份粗山羊草Ae37(DD)和Ae44(DD)为材料,利用D基因组专化的258对SSR引物和11对EST-SSR引物对偏凸-柱穗山羊草双二倍体SDAU18中分别来自双亲的两个D基因组进行了鉴定,获得的主要结果如下:在这269对引物中,有206对能在偏凸山羊草中扩增出带,出带率为76.6%,同时,有211对引物能在柱穗山羊草中扩增出带,出带率为78.4%;另外,在能在偏凸山羊草中扩增出带的206对引物中有181对引物扩出的带型能完全或部分体现...

【专利技术属性】
技术研发人员:曹淑兰
申请(专利权)人:曹淑兰
类型:发明
国别省市:37[中国|山东]

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