【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物学领域，尤其涉及一种与鸡体重以及屠体重性状相关的snp分子标记及其应用，具体涉及与鸡六周龄体重，八周龄体重，十周龄体重，十二周龄体重，屠体重，左侧腿肌重和肝脏重相关的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、近年来，我国鸡肉产量持续增长，仅次于美国，提高肌肉产量、改善鸡肉品质，成为育种科学家长期以来不断探索的工作。经典育种方法为农业动物生产性状改良做出了很大贡献，随着基因组工作的不断推进和遗传标记的广泛开发，育种科学家可以根据特定的遗传标记，选择具有良好产量和质量特征的鸡进行繁殖，从而逐步提高整个鸡群的产量和质量水平。
2、snp(single nucleotide polymorphism，单核苷酸多态性)是遗传学中常见的遗传变异形式之一。snp具有量大、高频率、低突变率等优点，在遗传研究和分子选择育种中发挥着重要的作用。但目前肉鸡分子育种实践中仍然缺少功能明确、效应显著的分子标记。因此，挖掘效应大的、准确的分子标记是当前的研究重点。进一步，如果能够找到与鸡目标性状相关的snp分子标记，并最终解析该位点的分子机制，将极大促进鸡的遗传改良，为家禽育种领域带来突破性进展。
技术实现思路
1、针对现有技术中存在的不足，本专利技术目的是提供一种与鸡屠体重性状相关的snp分子标记及其应用，具体涉及与鸡六周龄体重，八周龄体重，十周龄体重，十二周龄体重，屠体重，左侧腿肌重和肝脏重相关的snp分子标记及其应用，利用重测序技术对845只鸡杂交群体个体进行测序，进行g
2、本专利技术记载技术方案的研究开发由以下项目提供资助：高产新基因挖掘与育种价值评价，项目编号2023zd0406805。
3、为解决上述技术问题，本专利技术提供的技术方案是：
4、一种与鸡多个生长性状相关的snp分子标记，
5、所述snp分子标记位于基因组grcg6a 104的chr4：75892495，所述snp位点的等位基因为t和c；包含tt、cc和tc三种基因型；
6、经济性状为鸡六周龄体重，八周龄体重，十周龄体重，十二周龄体重，屠体重，左侧腿肌重和肝脏重；
7、高体重鸡中t为优势等位基因，低体重鸡中c为优势等位基因。
8、优选的，
9、所述snp分子标记位于seq id no.1所示的核苷酸序列中第101位碱基。seq idno.1(chr4:75892395-75892595)
10、gtacaacaaagttaattctatggttacataatcagtaactataactgcagtgaacactgtatgctgctgcacattcaatccttgat
11、aatctgcacttaagctctgcagtagacctggcttcctgaaatgcagcaggtggggtattctgctgcttaaagtttcctttaatag
12、gagcaagggggtgcaggtactttactgcct
13、上述的snp分子标记在鸡的六周龄体重，八周龄体重，十周龄体重，十二周龄体重，屠体重，左侧腿肌重和肝脏重性状检测中的应用。
14、上述的应用，包括以下步骤：
15、(1)检测样品鸡在所述snp位点的基因型；
16、(2)选择t/t基因型的样品鸡进行优势品系的选育。
17、优选的，
18、所述步骤(1)可采用直接测序，或先扩增含所述snp分子标记的基因片段再检测。
19、扩增的具体步骤为：取杂交群体样本的血液组织使用北京天根生物科技有限公司总dna提取试剂盒进行dna的提取，提取完成的dna用nanodrop 2000分光光度计检测提取的dna的od值即od260/od280和od260/od230比值确定dna的浓度和纯度，并用琼脂糖凝胶电泳检测dna的完整性。以杂交群体样本的基因组为模板，使用oligo7软件对其序列的设计相应的引物，使用诺唯赞2×taq master mix进行序列扩增，反应体系如下：95℃，预变型3min；95℃，变型15s，60℃，退火15s，72℃，延伸15s，30个循环；72℃，彻底延伸5min。最后使用琼脂糖凝胶电泳检测产物片段大小。
20、扩增含上述snp位点片段的引物对，所述引物对序列如seq id no.2和seq idno.3所示。
21、引物对序列为：
22、f:gtacaacaaagttaattcta(seq id no.2)
23、r:aggcagtaaagtacctgca(seq id no.3)
24、上述的snp分子标记在标记辅助选择育种中的应用，
25、选择基因型为t/t的鸡种进行选育。
26、本专利技术的有益效果是：
27、本专利技术提供一种与鸡多个生长性状相关的snp分子标记及其应用，通过对845只鸡的snp位点chr4：75892495进行基因分型，对该位点在低体重鸡种及高体重鸡种中进行snp频率分析，发现高体重鸡中t为优势等位基因，低体重鸡中c为优势等位基因,在体重较低的群体中，通过选择等位基因t的个体，可以提高群体的体重，该位点作为snp分子标记应用于优良鸡种的选育，能够早期、快速、低成本、有效的预测体重高低与否，在鸡种改良方面具有广阔的应用前景，并能够取得优异的经济价值。
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1.一种与鸡多个生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于，
2.根据权利要求1所述的与鸡多个生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于，
3.权利要求1所述的SNP分子标记在鸡的六周龄体重，八周龄体重，十周龄体重，十二周龄体重，屠体重，左侧腿肌重和肝脏重性状检测中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，
6.扩增含权利要求1所述SNP位点片段的引物对，其特征在于，
7.权利要求1所述的SNP分子标记在标记辅助选择育种中的应用，其特征在于，
【技术特征摘要】
1.一种与鸡多个生长性状相关的snp分子标记，其特征在于，
2.根据权利要求1所述的与鸡多个生长性状相关的snp分子标记，其特征在于，
3.权利要求1所述的snp分子标记在鸡的六周龄体重，八周龄体重，十周龄体重，十二周龄体重，屠体重，左侧腿肌重和肝脏重性状检测中的应用...
【专利技术属性】
技术研发人员：王宇哲，朱晓宁，胡晓湘，瞿浩，舒鼎铭，罗成龙，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：
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