【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及植物分子标记，更具体的说是涉及一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合及其应用。
技术介绍
1、茄子(solanum melongena l.)属于茄科茄属，是世界重要的蔬菜作物之一。我国是茄子生产大国，茄子种植面积和总产量均居于世界第一位。近年来，我国茄子产业规模稳步增长，到2021年我国茄子种植面积80.4万公顷，总产量3745.9万吨。我国栽培茄子历史悠久，栽培茄子形态多样，按果实的形态可分为圆茄类、长茄类和卵(矮)茄类。
2、在生产上，我国茄子品种繁多，品种的优质与保护是产业持续发展的核心。因此，开发能够鉴定不同茄子品种的分子标记，构建茄子品种的分子身份证，对品种真实性鉴别、种质资源分类鉴定以及分子育种具有重要的实际应用价值。
3、分子标记(molecular markers)是根据个体或群体间的核苷酸序列差异作为遗传标记，可从dna水平直观地反映生物的多样性。分子标记在植物遗传育种中应用非常广泛，主要包括限制性内切酶片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism，rflp)、简单序列重复(simple sequence repeats，ssr)、单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism，snp)和插入缺失(insertion-deletion，indel)等类型。然而，rflp和ssr标记数目有限且检测难度较大，snp标记虽然精准，但开发和检测成本高，而indel标记在普通琼脂糖凝胶中难以区
4、因此，提供一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合及其应用是本领域技术人员亟需解决的问题。
技术实现思路
1、有鉴于此，本专利技术提供了一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合及其应用。
2、为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
3、一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合，所述结构变异分子标记包括分别位于茄子1-12号染色体上的12个结构变异分子标记，分别命名为sv_1_3、sv_2_1、sv_3_7、sv_4_1、sv_5_2、sv_6_4、sv_7_8、sv_8_3、sv_9_1、sv_10_4、sv_11_2、sv_12_2；对应的引物组合序列依次如seq id no.1和2、3和4、5和6、7和8、9和10、11和12、13和14、15和16、17和18、19和20、21和22、23和24所示。
4、进一步，一种鉴定茄子品种的方法，包括以下步骤：
5、(1)提取待测茄子品种的基因组dna；
6、(2)利用所述的引物组合对步骤(1)得到的基因组dna进行pcr扩增，得到12份pcr扩增产物；
7、(3)将步骤(2)获得的pcr扩增产物分别进行琼脂糖凝胶电泳观察带型；
8、(4)根据电泳带型分别对12份pcr扩增产物进行赋值并依次排列，组合成品种编码，所述品种编码作为所述茄子品种的分子身份证。
9、进一步，步骤(2)所述pcr扩增的反应体系为：2×pcr mix 10μl、dna 1μl、上游引物1μl、下游引物1μl，补充去离子水至20μl。
10、进一步，步骤(2)所述pcr扩增的反应程序为：94℃3min；94℃30sec，56℃30sec，72℃30sec，共35个循环；72℃5min；4℃保存。
11、进一步，步骤(4)中，通过以下方法进行赋值：
12、当扩增产物中仅含a带时赋值0，仅含b带时赋值1，含有a带和b带时赋值2，既不含a带又不含b带时赋值x；
13、其中，标记sv_1_3引物对的扩增产物对应的a带大小为245bp，b带大小为612bp；
14、标记sv_2_1引物对的扩增产物对应的a带大小为274bp，b带大小为678bp；
15、标记sv_3_7引物对的扩增产物对应的a带大小为227bp，b带大小为323bp；
16、标记sv_4_1引物对的扩增产物对应的a带大小为209bp，b带大小为287bp；
17、标记sv_5_2引物对的扩增产物对应的a带大小为229bp，b带大小为666bp；
18、标记sv_6_4引物对的扩增产物对应的a带大小为444bp，b带大小为617bp；
19、标记sv_7_8引物对的扩增产物对应的a带大小为260bp，b带大小为500bp；
20、标记sv_8_3引物对的扩增产物对应的a带大小为319bp，b带大小为662bp；
21、标记sv_9_1引物对的扩增产物对应的a带大小为318bp，b带大小为855bp；
22、标记sv_10_4引物对的扩增产物对应的a带大小为470bp，b带大小为885bp；
23、标记sv_11_2引物对的扩增产物对应的a带大小为250bp，b带大小为426bp；
24、标记sv_12_2引物对的扩增产物对应的a带大小为345bp，b带大小为923bp。
25、进一步，所述的引物组合在茄子品种育种中的应用。
26、进一步，所述的引物组合在茄子品种鉴定中的应用。
27、进一步，所述的引物组合在构建茄子分子身份证中的应用。
28、进一步，一种用于茄子品种鉴定的试剂盒，包括所述的引物组合。
29、进一步，所述的试剂盒在构建茄子分子身份证中的应用。
30、经由上述的技术方案可知，与现有技术相比，本专利技术公开提供了一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合及其应用，本专利技术基于大片段的结构变异，在茄子基因组的1-12号染色体上各开发了1个分子标记，每个位点可产生3种基因型，总计312＝531441种基因型，以此用于构建茄子分子身份证，可有效辨别品种真实性，追溯品种来源，在茄子种质资源分类鉴定、分子育种等方面具有重要应用价值。本专利技术开发的分子标记采用普通琼脂糖凝胶即可完成检测，操作简便，成本低廉，检测效率高。
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1.一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合，其特征在于，所述结构变异分子标记包括分别位于茄子1-12号染色体上的12个结构变异分子标记，分别命名为SV_1_3、SV_2_1、SV_3_7、SV_4_1、SV_5_2、SV_6_4、SV_7_8、SV_8_3、SV_9_1、SV_10_4、SV_11_2、SV_12_2；对应的引物组合序列依次如SEQ ID NO.1和2、3和4、5和6、7和8、9和10、11和12、13和14、15和16、17和18、19和20、21和22、23和24所示。
2.一种鉴定茄子品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：
3.根据权利要求2所述的一种鉴定茄子品种的方法，其特征在于，步骤(2)所述PCR扩增的反应体系为：2×PCR Mix 10μL、DNA 1μL、上游引物1μL、下游引物1μL，补充去离子水至20μL。
4.根据权利要求2所述的一种鉴定茄子品种的方法，其特征在于，步骤(2)所述PCR扩增的反应程序为：94℃3min；94℃30sec，56℃30sec，72℃30sec，共35个循环；72℃5mi
5.根据权利要求2所述的一种鉴定茄子品种的方法，其特征在于，步骤(4)中，通过以下方法进行赋值：
6.权利要求1所述的引物组合在茄子品种育种中的应用。
7.权利要求1所述的引物组合在茄子品种鉴定中的应用。
8.权利要求1所述的引物组合在构建茄子分子身份证中的应用。
9.一种用于茄子品种鉴定的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述的引物组合。
10.权利要求9所述的试剂盒在构建茄子分子身份证中的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定茄子品种的结构变异分子标记的引物组合，其特征在于，所述结构变异分子标记包括分别位于茄子1-12号染色体上的12个结构变异分子标记，分别命名为sv_1_3、sv_2_1、sv_3_7、sv_4_1、sv_5_2、sv_6_4、sv_7_8、sv_8_3、sv_9_1、sv_10_4、sv_11_2、sv_12_2；对应的引物组合序列依次如seq id no.1和2、3和4、5和6、7和8、9和10、11和12、13和14、15和16、17和18、19和20、21和22、23和24所示。
2.一种鉴定茄子品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：
3.根据权利要求2所述的一种鉴定茄子品种的方法，其特征在于，步骤(2)所述pcr扩增的反应体系为：2×pcr mix 10μl、dna 1μl、上游引物1μ...
【专利技术属性】
技术研发人员：张磊，侯文倩，张洪永，曾丽倩，徐涛，
申请(专利权)人：江苏师范大学，
类型：发明
国别省市：
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