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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及太空电离辐射,具体地说,涉及一种太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法。
技术介绍
1、太空电离辐射会对人体各个系统产生严重的不良影响,比如导致白内障、心血管病等,而且还可能会增加患癌风险,给人体健康带来重大的隐患。鉴于太空电离辐射的巨大危害,开发一些服用方便的抗辐射药物,可以增加人体细胞对太空电离辐射的抵抗力,减少或预防组织损伤,在一定程度上降低太空电离辐射的风险。然而,目前可用的抗辐射药物较少,且大部分药物还会产生较大的副作用。因此,在研究太空电离辐射对疾病影响的分子机制的基础之上,利用药物重定位方法筛选具有缓解太空电离辐射损伤潜力的药物,是迫切的现实需求。
技术实现思路
1、本专利技术的内容是提供一种太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其能够克服现有技术的某种或某些缺陷。
2、根据本专利技术的一种太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其包括以下步骤:
3、一、识别太空电离辐射关键分子,构建太空电离辐射关键分子网络;
4、二、对太空电离辐射与疾病之间的关系进行整体分析,识别与太空电离辐射相关的疾病;
5、三、对与太空电离辐射相关的疾病进行分类,并对每种类别的疾病进行统计检验,筛选出与太空电离辐射显著相关的疾病;
6、四、构建与太空电离辐射显著相关的疾病的分子网络;
7、五、根据分子网络中的差异表达基因,预测具有治疗效果的候选药物。
8、作为优选,步骤二中,使用mi
9、作为优选,步骤三中,使用医学主题词表mesh对筛选到的疾病进行分类,对每种疾病类别进行超几何检验,肿瘤和消化系统疾病是与太空电离辐射显著相关的。
10、作为优选,步骤四中,从太空电离辐射关键分子网络中,提取出与肿瘤显著相关的分子以及它们之间的互作关系,构建了太空电离辐射-肿瘤网络;
11、从太空电离辐射关键分子网络中,提取与消化系统疾病显著相关的分子以及它们之间的互作关系,构建太空电离辐射-消化系统疾病网络。
12、作为优选,步骤五中,具体为:
13、首先,将太空电离辐射关键分子中的差异表达基因作为太空电离辐射的表型分子特征;同时将药物处理之后细胞内基因表达的变化降序排列,作为药物分子特征;然后,计算每种药物的关联得分 connectivity score( cs),识别具有相反表达方向的表型分子特征和药物分子特征,预测具有缓解太空电离辐射损伤的候选药物; cs的计算公式如下:
14、;
15、其中,和分别表示太空电离辐射上调和下调基因的富集得分 enrichment score( es); es反应了太空电离辐射的表型分子特征(上调和下调基因)在药物分子特征中的富集情况,通过gsea方法计算获得。
16、如果太空电离辐射表型分子特征中的上调基因富集到药物分子特征的上半部分,下调基因富集到药物分子特征的下半部分,则这种药物可能会模拟太空电离辐射对人体的不良影响, cs > 0;如果表型分子特征在药物分子特征上随机分布,没有明显特征,则这种药物和太空电离辐射之间没有显著关系, cs = 0;而如果表型分子特征中的上调基因富集到药物分子特征的下半部分,下调基因富集到药物分子特征的上半部分,则这种药物可能会逆转太空电离辐射对人体的不良影响, cs < 0。
17、本专利技术探索了太空电离辐射影响的疾病及其分子机制,并且基于太空电离辐射关键分子,预测能够缓解太空电离辐射损伤的潜在候选药物,为选择抗辐射药物提供了更多新的候选。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:步骤二中,使用miR2Disease数据库研究与太空电离辐射关键分子中的微小核糖核酸miRNA相关的疾病,同时使用DisGeNET数据库研究与太空电离辐射关键分子中的基因和转录因子TF相关的疾病;对太空电离辐射关键分子基因集与数据库中的疾病基因集进行超几何检验,筛选出相关的疾病。
3.根据权利要求2所述的太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:步骤三中,使用医学主题词表MeSH对筛选到的疾病进行分类,对每种疾病类别进行超几何检验,肿瘤和消化系统疾病是与太空电离辐射显著相关的。
4.根据权利要求3所述的太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:步骤四中,从太空电离辐射关键分子网络中,提取出与肿瘤显著相关的分子以及它们之间的互作关系,构建了太空电离辐射-肿瘤网络;
5.根据权利要求4所述的太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:步骤五中,
...【技术特征摘要】
1.太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的太空电离辐射相关疾病预测及候选药物筛选方法,其特征在于:步骤二中,使用mir2disease数据库研究与太空电离辐射关键分子中的微小核糖核酸mirna相关的疾病,同时使用disgenet数据库研究与太空电离辐射关键分子中的基因和转录因子tf相关的疾病;对太空电离辐射关键分子基因集与数据库中的疾病基因集进行超几何检验,筛选出相关的疾病。
3.根据权利要求2所述的太空电离辐射相关...
【专利技术属性】
技术研发人员:袁梦琴,姜伟,刘海洲,张涛,
申请(专利权)人:福建医科大学附属第一医院,
类型:发明
国别省市:
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