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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息处理,尤其涉及一种碱基识别方法、装置、设备及存储介质。
技术介绍
1、dna测序是现代生命科学中最为基础的技术之一。dna测序技术所提供的高质量测序数据依赖于测序过程中准确的碱基识别。然而,所有的测序平台都存在着一定的碱基识别错误率,这些错误可能对下游的生物信息学分析结果产生影响,进而影响相应的研究结果的准确性。因而对于任何一个测序平台来说,降低错误率都是提升测序质量的关键。因此,如何提升碱基识别的准确率成为重要的研究方向。
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种碱基识别方法、装置、设备及存储介质,以提高碱基识别的准确率。
2、根据本专利技术的一方面,提供了碱基识别方法,包括:
3、获取测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息和第一测序信息之间的第一映射关系,其中,所述第一测序信息包括基于目标测序轮的第一初始碱基识别信息;
4、基于所述第一映射关系和待处理测序轮的第一测序信息,确定所述待处理测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息。
5、根据本专利技术的另一方面,提供了一种碱基识别装置,包括:
6、第一映射关系获取模块,获取测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息和第一测序信息之间的第一映射关系,其中,所述第一测序信息包括基于目标测序轮的第一初始碱基识别信息,且所述第一初始碱基识别信息包括连续a个测序轮的初始碱基识别信息,所述连续a个测序轮至少包括所述目标测序轮;
7、正误分类信息确定模块,用于
8、根据本专利技术的另一方面,提供了一种电子设备,电子设备包括:
9、至少一个处理器;以及
10、与至少一个处理器通信连接的存储器;其中,
11、存储器存储有可被至少一个处理器执行的计算机程序,计算机程序被至少一个处理器执行,以使至少一个处理器能够执行本专利技术任一实施例的方法。
12、根据本专利技术的另一方面,提供了一种计算机可读存储介质,计算机可读存储介质存储有计算机指令,计算机指令用于使处理器执行时实现本专利技术任一实施例的方法。
13、本专利技术实施例的技术方案,通过获取测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息和第一测序信息之间的第一映射关系,其中,所述第一测序信息包括基于目标测序轮的第一初始碱基识别信息;基于所述第一映射关系和待处理测序轮的第一测序信息,确定所述待处理测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息。由此,通过采用连续a个测序轮的碱基识别信息对待处理测序轮的碱基识别信息进行校准,特别是借助目标测序轮及其上下文序列的特征,可以显著降低测序错误率,有效降低高频错误带来的影响,提高碱基识别的准确度。
14、应当理解,本部分所描述的内容并非旨在标识本专利技术的实施例的关键或重要特征,也不用于限制本专利技术的范围。本专利技术的其它特征将通过以下的说明书而变得容易理解。
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1.一种碱基识别方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于所述第一映射关系和待处理测序轮的第一测序信息,确定所述待处理测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息,包括:
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述第一初始碱基识别信息包括连续a个测序轮的初始碱基识别信息,且所述连续a个测序轮至少包括所述指定测序轮;
4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于,所述第一映射关系通过预先构建的碱基识别结果正误分类模型训练获得;
5.根据权利要求1-4任一项所述的方法,其特征在于,所述碱基识别方法还包括:
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述第三测序信息还包括如下信息中的至少一种:
7.根据权利要求5-6任一项所述的方法,其特征在于,所述碱基识别方法还包括:
8.一种碱基识别装置,其特征在于,包括:
9.一种电子设备,其特征在于,所述电子设备包括:
10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机指
...【技术特征摘要】
1.一种碱基识别方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于所述第一映射关系和待处理测序轮的第一测序信息,确定所述待处理测序轮的初始碱基识别结果的正误分类信息,包括:
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述第一初始碱基识别信息包括连续a个测序轮的初始碱基识别信息,且所述连续a个测序轮至少包括所述指定测序轮;
4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于,所述第一映射关系通过预先构建的碱基识别结果正误分类模型训练获得;
5.根据权利要求1...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈巍月,
申请(专利权)人:深圳市真迈生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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