System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme及其应用制造技术_技高网

一种识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme及其应用制造技术

技术编号:43307901 阅读:0 留言:0更新日期:2024-11-12 16:24
本发明专利技术涉及病源性微生物检测技术领域,具体公开了一种识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme及其应用,包括DVh<subgt;1</subgt;、DVh<subgt;3</subgt;两条DNAzyme脱氧核糖核苷酸序列,DNAzyme序列的在3’端上有标记淬灭集团,本发明专利技术通过SELEX技术筛选得到的DNAzyme制备成双DNAzyme体系从而能更高特异性、高灵敏度识别哈维氏弧菌,并且DNAzyme的热化学稳定性高、易于合成和修饰、成本低廉,不仅方便与核酸扩增等信号放大手段配合,也易使用各种信号转导机制集成到荧光等分析报告系统中。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及病源性微生物检测,具体为一种识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme及其应用。


技术介绍

1、近年来,由于人类对海洋资源的不断开发,导致海洋环境变得复杂,各种海洋微生物大量繁殖,尤其是海洋致病菌,因其数量庞大且分布范围较广,造成水生动物感染及水环境污染事件频发,水产动物大面积死亡,给水产养殖业造成巨大的经济损失。水产品的质量无法得到保障。被感染的水产品通过食物链进入到人体,极易引起食物中毒,其中弧菌病是影响多种水产养殖动物尤其是海水养殖鱼类、贝类和甲壳类最常见的细菌性疾病之一。

2、哈维氏弧菌是一种弯曲杆状、嗜盐的革兰氏阴性菌,广泛分布在海洋、河口水生生态系统中,是一种感染海水鱼类、贝类和甲壳类的主要致病菌。随着中国水产养殖品种的增多,该病原菌感染的宿主范围也在逐渐扩大。鱼类感染后一般会出现鳞片脱落和肌肉坏死、血管炎、感染性坏死性肠炎、眼部病变等症状,还会导致虾类出现对虾烂鳃病、红体病、发光弧菌病及贝类的皱纹盘鲍脓疱病、肌肉萎缩症,方斑东风螺肿吻症等,其流行面积广,死亡率较高,给水产养殖业造成巨大经济损失。同时,哈维氏弧菌也是一种新兴的食源性病原体,感染后致使人类患有急性肠胃炎、感染伤口发炎,甚至会导致皮下组织和肌肉坏死。对水产品质量安全以及人类健康造成严重威胁。目前对哈维氏弧菌的治疗尚无有效手段,主要依赖于抗生素,因此哈维氏弧菌的早期检测对于预防和控制尤为重要。国内外对哈维氏弧菌的检测方法有很多:传统的微生物培养法步骤繁琐、检测周期长。

3、脱氧核酶(deoxyribozymes,dnazymes)是通过指数富集的配体进化技术(selex)体外筛选被分离出来的,通常由一条底物链和一条酶链组成,这两条dna链通过碱基配对进行部分互补杂交,形成一个双链系统。目的靶标的存在激活了dna酶的活性,底物链上的核苷酸(ra)被裂解,dnazyme可以通过构象变化和级联反应完成信号的传导和放大,使其在作为生物传感器时可以进行高灵敏的检测。此外,dnazyme还具有良好的稳定性、易于修饰和制备等优势,为开发灵敏、高效的现场检测方法提供了理想的分子工具。最早报道的dnazyme是在1994年,breaker和joyce利用selex技术体外筛选技术,首次从大量随机dna序列中获得了可以在特定位点切割核糖核酸(rna)的脱氧核糖核酸(dna)序列,并证实了它能催化依赖pb2+的rna磷酸酯的裂解反应,之后zn2+、cu2+、uo22+、cd2+和hg2+等金属离子的dnazyme也陆续被筛选了出来,并获得了良好的结果。随着研究的不断深入,基于dnazyme的微生物检测受到关注。

4、在2020年,keerthana setlem报道了基于双适配-dnazyme的比色法用于检测复杂样品中的afb1。该实验用dnazyme连接适配体检测apta磁珠捕获的afb1,具有较高的稳定性和特异性。基于此,本专利技术设计了一种双dnazyme生物传感器用于检测哈维氏弧菌。该方法利用selex技术筛选出能特异性识别哈维氏弧菌的dnazyme,优化其反应条件,并应用所获得特异性高、灵敏度好的dnazyme来制备生物传感器,为水产致病菌哈维氏弧菌的检测提供简单、快速的方法。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是针对现有技术的缺陷,提供一种识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme及其应用,以解决上述
技术介绍
提出的问题。

2、为实现上述目的,本专利技术提供如下技术方案:一种识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme及其应用,包括dvh1、dvh3两条dnazyme脱氧核糖核苷酸序列:

3、所述dvh1为:5’-gcccccgtaatgtcatgtagccgcaggcgccatcatg ttgcaccctaagggattgcatctgtagcgtagtgtcg-3’;

4、所述dvh3为:5’-gcccccgtaatgtcaaggtcccgcaggggctttcacttcgtccctgtatgtttcgcatctgtagcgtagtgtcg-3’。

5、作为本专利技术的一种优选技术方案,所述dnazyme序列的在3’端上有标记淬灭集团。

6、一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme的筛选方法,其特征在于:采用磁珠selex法筛选dnazyme;

7、具体步骤如下:

8、步骤1:实验所用的文库和引物由自己设计并于上海生工合成;

9、步骤2:将用于实验过程的哈维氏弧菌及其他反筛菌在lb液体培养基中进行培养,检测菌悬液的od值;

10、步骤3:将步骤2所得菌悬液分装于1.5ml无菌ep管离心,保留上清液(胞外产物),-20℃储存备用;

11、步骤4:将中心区域含有40个随机碱基和两端分别有20个固定碱基数的初始文库与引物通过pcr反应进行连接,引入ra切割位点和生物素标签,切胶回收dna;

12、步骤5:将步骤4所得pcr产物和链霉亲和素包被的磁珠在30℃下连接30min;

13、步骤6:连接结束后磁性分离弃去上清,磁珠用亲和素反应缓冲液清洗三次;

14、步骤7:用0.2m的naoh洗涤磁珠两次,磁性分离以制备单链;

15、步骤8:超纯水清洗磁珠3次,使ph值接近于中性;

16、步骤9:将等体积的哈维氏弧菌胞外产物与2×筛选缓冲液混合,30℃孵育1h,发生切割反应,磁性分离,醇沉法回收上清液;

17、步骤10:以步骤9所得产物为模板,加入带有生物素的引物进行pcr扩增,用于下一轮筛选;

18、步骤11:将第九轮所得的pcr产物高通量测序并进行dna序列分析;

19、步骤12:候选dnazyme活性及性质检测;

20、步骤13:准备洁净的96孔板板盖,用海藻糖及普鲁兰多糖固定dnazyme复合物。

21、作为本专利技术的一种优选技术方案,在dna序列的5’端标记生物素;

22、步骤2中所使用的哈维氏弧菌的od600=1.0;

23、dna与磁珠结合,切割反应,醇沉回收均在1.5ml无菌ep管中进行;

24、使用超微量紫外分光光度计(q5000,美国)检测dna浓度。

25、作为本专利技术的一种优选技术方案,使用全波长多功能微孔板检测仪(m1000pro,瑞士)检测dnazyme切割荧光强度。

26、作为本专利技术的一种优选技术方案,dnazyme筛选过程中使用的磁珠直径为0.5μm。

27、一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme体系在水产品检测中的应用。

28、一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme在制备能够快速检测哈维氏弧菌的生物传感器中的应用。

29、一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的试剂盒,所述试剂盒含有双dnazyme。

30、与现有技术相比,本专利技术的有益效果是:本发本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme,其特征在于:包括DVh1、DVh3两条DNAzyme脱氧核糖核苷酸序列:

2.根据权利要求1所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme,其特征在于:所述DNAzyme序列的在3’端上有标记淬灭集团。

3.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme的筛选方法,其特征在于:采用磁珠SELEX法筛选DNAzyme。

4.根据权利要求3所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme的筛选方法,其特征在于:具体步骤如下:

5.根据权利要求4所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme的筛选方法,其特征在于:在DNA序列的5’端标记生物素;

6.根据权利要求4所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme的筛选方法,其特征在于:使用全波长多功能微孔板检测仪检测DNAzyme切割荧光强度。

7.根据权利要求4所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme的筛选方法,其特征在于:DNAzyme筛选过程中使用的磁珠直径为0.5μm。

8.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme体系在水产品检测中的应用。

9.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双DNAzyme在制备能够快速检测哈维氏弧菌的生物传感器中的应用。

10.一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有权利要求1-2任一项所述的双DNAzyme。

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【技术特征摘要】

1.一种能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme,其特征在于:包括dvh1、dvh3两条dnazyme脱氧核糖核苷酸序列:

2.根据权利要求1所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme,其特征在于:所述dnazyme序列的在3’端上有标记淬灭集团。

3.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme的筛选方法,其特征在于:采用磁珠selex法筛选dnazyme。

4.根据权利要求3所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme的筛选方法,其特征在于:具体步骤如下:

5.根据权利要求4所述的能特异性识别、检测哈维氏弧菌的双dnazyme的筛选方法,其特征在于:在dna序列的5’端标记生物素;

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【专利技术属性】
技术研发人员:王淑军李思盈张帅吕明生章均哲
申请(专利权)人:江苏海洋大学
类型:发明
国别省市:

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