【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物学检测，尤其涉及一种与藏绵羊氧化应激相关的snp分子标记及其检测引物和应用。
技术介绍
1、藏绵羊是青藏高原高寒牧区草原畜牧业的重要组成部分。青藏高原地区的特点为：海拔高、气压低、紫外线强、缺氧等。由于青藏高原地区环境恶劣，会引起藏绵羊的一系列非特异性反应，主要为免疫应激、冷应激与氧化应激，其中主要为氧化应激。藏绵羊受到应激原刺激后，破坏了体内氧化系统和抗氧化系统的动态平衡，活性氧(ros)和丙二醛(mda)含量增高，抗氧化物含量减少，机体将受到氧化损伤，从而影响藏绵羊的生长性能和繁殖性能。
2、活性氧(ros)和丙二醛(mda)是检测氧化应激反应中的重要指标，通过检测活性氧(ros)和丙二醛(mda)的含量，来评估藏绵羊的氧化应激能力和健康状况。通过检测抗氧化应激的指标，能及时发现藏绵羊的氧化应激反应能力，并采取一定的措施来提高其氧化应激能力，使其更好的适应青藏高原恶劣的环境条件，为藏绵羊的辅助育种提供依据。
3、分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是dna水平遗传多态性的直接的反映。分子标记技术可从基因层面寻找基因中的变异位点，通过其与性状间的关联分析发现基因与性状间的关系，进行早期选择，从而提高选种效率和准确性，可以从根本上提高藏绵羊的氧化应激能力，具有广阔的应用价值。
4、因此，分子标记为人们在分子水平研究藏绵羊的氧化应激能力的遗传机理奠定了基础，筛选相应的分子标记以便于更高效的用于藏绵羊的育种中，是本领域的一个重要问题。现有技术中研究与藏
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种与藏绵羊氧化应激相关的snp分子标记及其检测引物和应用。
2、为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：
3、本专利技术提供了一种与藏绵羊氧化应激能力有关的snp分子标记，所述snp分子标记位于国际绵羊基因组oar_v4.0版本第9号染色体上第90792275个碱基处，突变碱基为a或g。
4、优选的，突变碱基为a的藏绵羊的基因型为aa或ag；
5、突变碱基为g的藏绵羊的基因型为gg；
6、所述gg基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标ros、mda显著高于aa和ag基因型个体；
7、所述ag基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标ros、mda显著高于aa基因型个体。
8、本专利技术还提供了所述的snp分子标记用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择中的应用。
9、本专利技术还提供了所述的snp分子标记在藏绵羊辅助育种中的应用。
10、本专利技术还提供了扩增所述的snp的引物对，所述引物对如seq id no.2～3所示。
11、本专利技术还提供了所述的引物对在制备非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的产品中的应用。
12、本专利技术还提供了所述的引物对在制备藏绵羊辅助育种的产品中的应用。
13、本专利技术还提供了一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的方法，包括如下步骤：
14、(1)提取藏绵羊基因组dna；
15、(2)以步骤(1)得到的藏绵羊基因组dna为模板，利用所述的引物对进行扩增，得到扩增产物；
16、(3)对所述的扩增产物进行基因型分析，得到不同基因型的藏绵羊；将藏绵羊的基因型与抗氧化应激指标关联；
17、所述抗氧化应激指标包括活性氧和/或丙二醛。
18、优选的，步骤(2)所述的扩增的体系为：金牌mix(green)22μl，上、下游引物各1μl，模板dna 1μl；
19、步骤(2)所述的扩增的程序为：98℃2min；98℃10s，57.5℃10s，72℃10s，共40个循环；72℃延伸2min。
20、本专利技术还提供了一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择和/或藏绵羊辅助育种的试剂盒，包括检测所述的snp分子标记的试剂或所述的引物对。
21、与现有技术相比，本专利技术具有如下的有益效果：
22、本专利技术提供了一种与藏绵羊氧化应激相关的snp分子标记及其检测引物和应用，本专利技术所述的snp分子标记位于国际绵羊参考基因组oar_v4.0版本第9号染色体上第90792275个碱基处；变异类型为a/g，命名为g90792275a>g，存在三个基因型，当所述的第9号染色体上第90792275个碱基为a时，基因型为aa或ag；当所述的第9号染色体上第90792275个碱基为g时，基因型为gg；通过不同基因型与抗氧化应激指标ros、mda含量的关联分析，发现所述gg基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标ros、mda显著高于aa和ag基因型个体(p<0.05)，ag基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标ros、mda显著高于aa基因型个体(p<0.05)。通过检测藏绵羊第9号染色体上第90792275个核苷酸位点的碱基，能够判断藏绵羊个体的抗氧化应激指标ros、mda含量，本专利技术为用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择提供了新的snp分子标记资源，为筛选抗氧化应激能力强的藏绵羊提供依据，为藏绵羊的辅助育种提供新方向。
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1.一种与藏绵羊氧化应激能力有关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第9号染色体上第90792275个碱基处，突变碱基为A或G。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，突变碱基为A的藏绵羊的基因型为AA或AG；
3.权利要求1或2所述的SNP分子标记用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择中的应用。
4.权利要求1或2所述的SNP分子标记在藏绵羊辅助育种中的应用。
5.扩增权利要求1或2所述的SNP的引物对，其特征在于，所述引物对如SEQ ID NO.2～3所示。
6.权利要求5所述的引物对在制备非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的产品中的应用。
7.权利要求5所述的引物对在制备藏绵羊辅助育种的产品中的应用。
8.一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的方法，其特征在于，包括如下步骤：
9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤(2)所述的扩增的体系为：金牌Mix(green)22μL，上、
10.一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择和/或藏绵羊辅助育种的试剂盒，其特征在于，包括检测权利要求1或2所述的SNP分子标记的试剂或权利要求5所述的引物对。
...【技术特征摘要】
1.一种与藏绵羊氧化应激能力有关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记位于国际绵羊基因组oar_v4.0版本第9号染色体上第90792275个碱基处，突变碱基为a或g。
2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其特征在于，突变碱基为a的藏绵羊的基因型为aa或ag；
3.权利要求1或2所述的snp分子标记用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择中的应用。
4.权利要求1或2所述的snp分子标记在藏绵羊辅助育种中的应用。
5.扩增权利要求1或2所述的snp的引物对，其特征在于，所述引物对如seq id no.2～3所示。
6.权...
【专利技术属性】
技术研发人员：巴桑吉巴，格桑加措，
申请(专利权)人：西藏自治区农牧科学院，
类型：发明
国别省市：
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