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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,具体涉及一种用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物及其应用。
技术介绍
1、肺腺癌是全球最常见的肺癌亚型,约占所有肺癌病例的40%。随着诊断、手术、放疗、免疫治疗和分子治疗的进步,肺腺癌患者的临床结果显著改善。然而,肺腺癌患者的5年生存率仍处于较低水平。且肺腺癌的发现大多在晚期,患者在进行根治性手术之后仍然有肿瘤复发的现象。目前,肺腺癌诊断手段包括影像学检查,肺癌细胞学或组织学、痰液细胞学和血清学肿瘤标志物等,但都对复发监测及预后判定敏感性及特异性欠佳,往往存在滞后性且不能在多种标本中应用。即使是近年新兴的液体活检技术,就现阶段而言缺乏标准化的检测方法、成本高昂以及临界水平的不确定性等问题,限制了其在常规临床实践中的广泛使用。因此,有必要提供一种有效、简单的能够准确评估复发风险及预后判定的生物标志物。
2、肺腺癌发生发展及复发转移是一个多因素和多基因变异的累积过程。dna甲基化作为最常见的表观遗传修饰之一,在肺腺癌发生和进展中起重要作用,广泛参与肺腺癌诸多生物学过程调控,贯穿于肿瘤发生发展的全过程。因此,生物标志物具体的甲基化位点在肺腺癌的临床应用也越来越受关注,但总体而言,dna甲基化标志物在肺腺癌复发监测及预后判定中的探索仍需进一步深入研究。
3、有报道富含半胱氨酸和酪氨酸1(cyyr1)参与人星形胶质细胞中胆固醇稳态和淀粉样病变,但在肺腺癌在内的肿瘤中的作用依旧未知。
技术实现思路
1、有鉴于此,本专利技术的目的在于提供cyyr1基因作为
2、为了实现上述目的,本专利技术提供了如下技术方案:
3、本专利技术提供了一种用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物,所述标志物为cyyr1基因,其核苷酸序列如seq id no.1所示,所述cyyr1基因在肺腺癌组织中的表达水平明显低于对应的癌旁组织,且所述cyyr1基因的表达水平与肺腺癌的预后效果正相关,与肺腺癌的复发风险负相关,可以通过检测cyyr1基因的表达水平进行肺腺癌诊断和肺腺癌的预后判断、复发风险评估和监测。
4、进一步地,所述标志物为cyyr1基因的启动子cpg聚集区域,其核苷酸序列如seqid no.2所示,所述cyyr1基因的启动子cpg聚集区域的甲基化水平在肺腺癌组织中明显高于癌旁组织,且所述cyyr1基因的启动子cpg聚集区域的甲基化水平与肺腺癌的预后效果负相关,与肺腺癌的复发风险正相关,可以通过检测所述cyyr1基因的启动子cpg聚集区域的甲基化水平进行肺腺癌诊断和肺腺癌的预后判断、复发风险评估和监测。
5、本专利技术还提供了实时定量pcr法检测cyyr1基因表达的特异性引物,所述引物为:
6、上游引物seq id no.3:5’-ccacgccctactgttgctcc-3’;
7、下游引物seq id no.4:5’-tcatgcacatgcagatgcatat-3’。
8、本专利技术还提供了核酸飞行质谱法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化的特异性引物,所述引物序列为:
9、上游引物seq id no.5:5’-aggaagagaggaaatgtgagtttgggtggttaag-3’;
10、下游引物seq id no.6:5’-cagtaatacgactcactatagggagaaggctcattacctaaaaaaccttccaaaaa-3’。
11、本专利技术还提供了msp法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的特异性引物,所述引物包括:
12、启动子甲基化状态的特异性引物:
13、上游引物seq id no.7:5’-cgtttgagcgtagtggggc-3’;
14、下游引物seq id no.8:5’-tcccgaaccaacgactacg-3’;
15、启动子非甲基化状态的特异性引物:
16、上游引物seq id no.9:5’-tgtgtttgagtgtagtggggt-3’;
17、下游引物seq id no.10:5’-catcccaaaccaacaactaca-3’。
18、本专利技术还提供了上述肺腺癌诊断、预后评估的标志物、上述实时定量pcr法检测cyyr1基因表达的特异性引物、上述核酸飞行质谱法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化的特异性引物、上述msp法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的特异性引物在制备肺腺癌诊断、预后评估的产品中的应用。
19、一种用于肺腺癌诊断、预后评估的试剂盒,所述试剂盒包括用于检测cyyr1基因表达水平的试剂、用于检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的试剂中的至少之一。
20、进一步地,所述用于检测cyyr1基因表达水平的试剂包括实时定量pcr法检测cyyr1基因表达的特异性引物,所述引物为:
21、上游引物seq id no.3:5’-ccacgccctactgttgctcc-3’;
22、下游引物seq id no.4:5’-tcatgcacatgcagatgcatat-3’。
23、进一步地,所述用于检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的试剂包括核酸飞行质谱法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化的特异性引物、msp法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的特异性引物中的至少之一。
24、进一步地,核酸飞行质谱法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化的特异性引物为:
25、上游引物seq id no.5:5’-aggaagagaggaaatgtgagtttgggtggttaag-3’;
26、下游引物seq id no.6:5’-cagtaatacgactcactatagggagaaggctcattacctaaaaaaccttccaaaaa-3’。
27、进一步地,所述msp法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的特异性引物包括:
28、启动子甲基化状态的特异性引物:
29、上游引物seq id no.7:5’-cgtttgagcgtagtggggc-3’;
30、下游引物seq id no.8:5’-tcccgaaccaacgactacg-3’;
31、启动子非甲基化状态的特异性引物:
32、上游引物seq id no.9:5’-tgtgtttgagtgtagtggggt-3’;
33、下游引物seq id no.10:5’-catcccaaaccaacaactaca-3’。
34、本专利技术的专利技术过程及思路为:
35、专利技术人利用tcga在线数据库和实验室收集的配对肺腺癌和癌旁样本检测结果,进行了cyyr1在肺腺癌本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物为CYYR1基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述CYYR1基因在肺腺癌组织中的表达水平明显低于对应的癌旁组织,且所述CYYR1基因的表达水平与肺腺癌的预后效果正相关,与肺腺癌的复发风险负相关,可以通过检测CYYR1基因的表达水平进行肺腺癌诊断和肺腺癌的预后判断、复发风险评估和监测。
2.根据权利要求1所述的用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物为CYYR1基因的启动子CpG聚集区域,其核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,所述CYYR1基因的启动子CpG聚集区域的甲基化水平在肺腺癌组织中明显高于癌旁组织,且所述CYYR1基因的启动子CpG聚集区域的甲基化水平与肺腺癌的预后效果负相关,与肺腺癌的复发风险正相关,可以通过检测所述CYYR1基因的启动子CpG聚集区域的甲基化水平进行肺腺癌诊断和肺腺癌的预后判断、复发风险评估和监测。
3.实时定量PCR法检测CYYR1基因表达的特异性引物,其特征在于,所述引物为:
4.核酸飞行质谱法检测CYYR1基因的启
5.MSP法检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化水平的特异性引物,其特征在于,所述引物包括:
6.权利要求1-2任一项所述的用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物、权利要求3所述的实时定量PCR法检测CYYR1基因表达的特异性引物、权利要求4所述的核酸飞行质谱法检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化的特异性引物、权利要求5所述的MSP法检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化水平的特异性引物在制备肺腺癌诊断、预后评估的产品中的应用。
7.一种用于肺腺癌诊断、预后评估的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括用于检测CYYR1基因表达水平的试剂、用于检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化水平的试剂中的至少之一。
8.根据权利要求7所述的用于肺腺癌诊断、预后评估的试剂盒,其特征在于,所述用于检测CYYR1基因表达水平的试剂包括实时定量PCR法检测CYYR1基因表达的特异性引物,所述引物为:
9.根据权利要求7所述的用于肺腺癌诊断、预后评估的试剂盒,其特征在于,所述用于检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化水平的试剂包括核酸飞行质谱法检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化的特异性引物、MSP法检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化水平的特异性引物中的至少之一。
10.根据权利要求9所述的用于肺腺癌诊断、预后评估的试剂盒,其特征在于,核酸飞行质谱法检测CYYR1基因的启动子CpG聚集区域甲基化的特异性引物为:
...【技术特征摘要】
1.一种用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物为cyyr1基因,其核苷酸序列如seq id no.1所示,所述cyyr1基因在肺腺癌组织中的表达水平明显低于对应的癌旁组织,且所述cyyr1基因的表达水平与肺腺癌的预后效果正相关,与肺腺癌的复发风险负相关,可以通过检测cyyr1基因的表达水平进行肺腺癌诊断和肺腺癌的预后判断、复发风险评估和监测。
2.根据权利要求1所述的用于肺腺癌诊断、预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物为cyyr1基因的启动子cpg聚集区域,其核苷酸序列如seq id no.2所示,所述cyyr1基因的启动子cpg聚集区域的甲基化水平在肺腺癌组织中明显高于癌旁组织,且所述cyyr1基因的启动子cpg聚集区域的甲基化水平与肺腺癌的预后效果负相关,与肺腺癌的复发风险正相关,可以通过检测所述cyyr1基因的启动子cpg聚集区域的甲基化水平进行肺腺癌诊断和肺腺癌的预后判断、复发风险评估和监测。
3.实时定量pcr法检测cyyr1基因表达的特异性引物,其特征在于,所述引物为:
4.核酸飞行质谱法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化的特异性引物,其特征在于,所述引物序列为:
5.msp法检测cyyr1基因的启动子cpg聚集区域甲基化水平的特异性引物,其特征在于,所述引物包括:
6.权利要...
【专利技术属性】
技术研发人员:向廷秀,代丰升,李力力,徐粲,荣欢,向欣妮,
申请(专利权)人:重庆大学附属肿瘤医院,
类型:发明
国别省市:
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