【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
技术实现思路
【技术保护点】
1.一种用于迭代地改进培养过程中的至少一种培养输出的培养条件的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，包括迭代地测试不同的培养条件，直到：
3.根据权利要求1所述的方法，还包括测试新的培养条件，直到用户定义的参数空间的搜索被穷举。
4.根据权利要求1所述的方法，其中使用自动化代理来进行选择。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述自动化代理使用人工智能方法。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述人工智能方法选自强化学习、深度学习、Q学习和神经网络。
7.根据权利要求4所述的方法，其中所述自动化代理使用直接搜索方法(例如，Nelder-Mead方法、动态编程方法、下降单纯形方法、单纯形算法、线性回归、二分搜索树或随机游走)。
8.根据权利要求1所述的方法，在操作(b)之前，所述方法还包括：
9.根据权利要求1所述的方法，包括迭代操作(b)至少2、3、4、5、10、15、20、25、30、50或100(例如，在4与15之间)次迭代中的任何次数。
10.根据权利要求1所述的
11.根据权利要求1所述的方法，还包括：
12.根据权利要求1所述的方法，其中所述培养的体积在约50ml与约15L之间，例如在约500mL与约10L之间。
13.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出是比生长速率。
14.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出选自产物滴度、产物产量、比生产速率、体积生产速率。
15.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出选自生物质产量、比CO2生成速率、比O2消耗速率、有机酸谱、代谢物谱、副产物谱和生产经济学。
16.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出选自多肽(例如蛋白、酶、抗体)、是所述细胞中合成途径产物的有机分子(例如工业化学品诸如调味剂(例如香草醛))；香料(例如醛、香豆素、吲哚)、氨基酸、有机酸(例如柠檬酸、乳酸和乙酸)；醇(例如乙醇、异丙醇，酮诸如丙酮)；和脂肪酸(例如棕榈酸和油酸)。
17.根据权利要求13所述的方法，其中比速率被定义为每小时每种细菌的培养输出的变化速率。
18.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括古细菌、原核生物和/或真核生物。
19.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括真菌细胞(例如酵母(例如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、毕赤酵母属种(Pichia spp.)、克鲁维酵母属种(Kuyveromyces spp)或曲霉属种(Aspergillus spp)、红冬孢酵母属种(Rhodoporidiumspp)、解脂酵母属种(Lipolytica spp)、曲霉属种(Aspergillus spp)、脉孢菌属种(Neurospora spp)、木霉属种(Trichoderma spp)、假丝酵母菌属种(Candida spp)、青霉属(Penicillium))。
20.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括细菌细胞(例如，大肠杆菌(Escherichia coli)、芽孢杆菌属种(Bacillus spp)、梭菌属种(Clostridia spp)、链霉菌属种(Streptomyces spp)、假单胞菌属种(Pseudomonas spp)、罗尔斯通菌属种(Ralstoniaspp)、希瓦氏菌属种(Shewanella spp))。
21.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括昆虫细胞、动物细胞或植物细胞。
22.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括动物细胞(例如节肢动物(例如昆虫、虾、龙虾、螯虾和螃蟹)和脊索动物(例如鱼类、两栖动物、爬行动物、鸟类(例如鸡或火鸡)和哺乳动物(例如人类或非人类诸如牛科动物、羔羊、山羊、猪、马、犬、猫、灵长类动物))。
23.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括细胞系(例如CHO(中国仓鼠卵巢细胞)、BHK21(小仓鼠肾)、NS0、Sp2/0鼠细胞系、昆虫细胞(例如SP9、Sf9、sf21、S2)、烟草BY-2细胞、水稻(Oryza Sativa)和藻类细胞。
24.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出的测量是基于生长至稳态的细胞。
25.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出的测量是基于生长期间细胞的趋势线。
26.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量在扰动后1小时与24小时之间进行。
27.根据权利要...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于迭代地改进培养过程中的至少一种培养输出的培养条件的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，包括迭代地测试不同的培养条件，直到：
3.根据权利要求1所述的方法，还包括测试新的培养条件，直到用户定义的参数空间的搜索被穷举。
4.根据权利要求1所述的方法，其中使用自动化代理来进行选择。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述自动化代理使用人工智能方法。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述人工智能方法选自强化学习、深度学习、q学习和神经网络。
7.根据权利要求4所述的方法，其中所述自动化代理使用直接搜索方法(例如，nelder-mead方法、动态编程方法、下降单纯形方法、单纯形算法、线性回归、二分搜索树或随机游走)。
8.根据权利要求1所述的方法，在操作(b)之前，所述方法还包括：
9.根据权利要求1所述的方法，包括迭代操作(b)至少2、3、4、5、10、15、20、25、30、50或100(例如，在4与15之间)次迭代中的任何次数。
10.根据权利要求1所述的方法，其中所述培养输出包括加权评分，所述加权评分包括多于一个不同的培养输出。
11.根据权利要求1所述的方法，还包括：
12.根据权利要求1所述的方法，其中所述培养的体积在约50ml与约15l之间，例如在约500ml与约10l之间。
13.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出是比生长速率。
14.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出选自产物滴度、产物产量、比生产速率、体积生产速率。
15.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出选自生物质产量、比co2生成速率、比o2消耗速率、有机酸谱、代谢物谱、副产物谱和生产经济学。
16.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出选自多肽(例如蛋白、酶、抗体)、是所述细胞中合成途径产物的有机分子(例如工业化学品诸如调味剂(例如香草醛))；香料(例如醛、香豆素、吲哚)、氨基酸、有机酸(例如柠檬酸、乳酸和乙酸)；醇(例如乙醇、异丙醇，酮诸如丙酮)；和脂肪酸(例如棕榈酸和油酸)。
17.根据权利要求13所述的方法，其中比速率被定义为每小时每种细菌的培养输出的变化速率。
18.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括古细菌、原核生物和/或真核生物。
19.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括真菌细胞(例如酵母(例如酿酒酵母(saccharomyces cerevisiae)、毕赤酵母属种(pichia spp.)、克鲁维酵母属种(kuyveromyces spp)或曲霉属种(aspergillus spp)、红冬孢酵母属种(rhodoporidiumspp)、解脂酵母属种(lipolytica spp)、曲霉属种(aspergillus spp)、脉孢菌属种(neurospora spp)、木霉属种(trichoderma spp)、假丝酵母菌属种(candida spp)、青霉属(penicillium))。
20.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括细菌细胞(例如，大肠杆菌(escherichia coli)、芽孢杆菌属种(bacillus spp)、梭菌属种(clostridia spp)、链霉菌属种(streptomyces spp)、假单胞菌属种(pseudomonas spp)、罗尔斯通菌属种(ralstoniaspp)、希瓦氏菌属种(shewanella spp))。
21.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括昆虫细胞、动物细胞或植物细胞。
22.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括动物细胞(例如节肢动物(例如昆虫、虾、龙虾、螯虾和螃蟹)和脊索动物(例如鱼类、两栖动物、爬行动物、鸟类(例如鸡或火鸡)和哺乳动物(例如人类或非人类诸如牛科动物、羔羊、山羊、猪、马、犬、猫、灵长类动物))。
23.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞包括细胞系(例如cho(中国仓鼠卵巢细胞)、bhk21(小仓鼠肾)、ns0、sp2/0鼠细胞系、昆虫细胞(例如sp9、sf9、sf21、s2)、烟草by-2细胞、水稻(oryza sativa)和藻类细胞。
24.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出的测量是基于生长至稳态的细胞。
25.根据权利要求1所述的方法，其中培养输出的测量是基于生长期间细胞的趋势线。
26.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量在扰动后1小时与24小时之间进行。
27.根据权利要求1所述的方法，其中培养在恒浊器或恒化器中进行。
28.根据权利要求1所述的方法，其中所述培养参数中的一个或更多个包括温度、ph、溶解氧、碳补料速率和氮补料速率中的一个或更多个。
29.根据权利要求1所述的方法，其中一个或更多个培养参数包括营养物的浓度。
30.根据权利要求1所述的方法，其中一个或更多个培养参数包括以下的浓度：金属(例如铁、锌、钴、铜、镍、锰、钼酸盐、亚硒酸盐和其他过渡金属)、维生素(例如烟酸、吡哆醇、核黄素、泛酸盐、氨基苯甲酸、硫胺素、生物素、氰钴胺素、叶酸)、诱导物、盐、氮保留速率、通气速率、氧气喷射速率、二氧化碳保留速率、磷酸盐、硫酸盐、氯化物、乙酸盐、柠檬酸盐和其他阴离子盐、镁、钙、钠、钾、铵和其他阳离子...
【专利技术属性】
技术研发人员：莎诺·霍尔，王鸥巍，布莱恩·李，查尔斯·埃姆里奇，
申请(专利权)人：宝威基因解决方案公司，
类型：发明
国别省市：
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