【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学，具体涉及一种基于结缕草基因组序列开发的ssr标记引物及其应用。
技术介绍
1、结缕草(zoysia willd.)，为禾本科，属于多年生草本植物。不同的结缕草种质资源在环境适应性、抗逆性、饲用性能等特性上差异明显。我国结缕草分布范围较广，适应性强，可在荒漠以及盐碱地等环境中生长，是世界上公认的优良的暖季型草坪草。
2、搞清楚物种的遗传多样性及遗传背景是合理保护利用该资源的前提，分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是研究物质遗传多样性及遗传背景的强大工具。虽然rapd、issr、srap等分子标记技术已在结缕草遗传多样性、遗传连锁图谱和遗传背景等方面得到了一些应用，但有关结缕草特异引物的报道较少，导致在研究结缕草遗传多样性和结缕草遗传背景上的困难较大，育种进程缓慢。因此，丰富结缕草特异引物库已成为当务之急。
3、简单重复序列(ssr，simple sequence repeat)又称为微卫星dna，是以2～6个核苷酸为基本单位的串联重复序列组成的dna片段，长度大多为100～200个碱基对，具有分布广泛，多态性丰富，重复性好，共显性遗传等特点，已被广泛应用于种质资源遗传多样性及遗传背景研究、品种鉴定、分子标记辅助育种等方面，是分子标记辅助育种首选标记之一。基因组测序(dna-seq)技术是利用高通量测序技术对组织或者细胞中的dna进行深度测序的技术，是一种在基因组水平上高通量、低成本分析基因表达差异的有效手段，高效率、高通量、低成本地获得大量的转录本信息的主
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种基于结缕草基因组序列开发的ssr标记引物和对结缕草亲缘关系的研究方法和品种的鉴定方法。
2、本专利技术提供了一种鉴定结缕草的ssr标记组合，所述ssr标记组合包括ssr01、ssr02、ssr03、ssr04、ssr05、ssr06、ssr07、ssr08、ssr09、ssr10、ssr11、ssr12、ssr13、ssr14、ssr15、ssr16、ssr17、ssr18、ssr19、ssr20、ssr21、ssr22、ssr23、ssr24、ssr25、ssr26、ssr27、ssr28、ssr29、ssr30、ssr31、ssr32、ssr33、ssr34、ssr35、ssr36、ssr37、ssr38和ssr39；
3、所述ssr01的重复单元为gcc，重复次数为5；
4、所述ssr02的重复单元为gga，重复次数为6；
5、所述ssr03的重复单元为gag，重复次数为6；
6、所述ssr04的重复单元为cct，重复次数为5；
7、所述ssr05的重复单元为ggt，重复次数为7；
8、所述ssr06的重复单元为gcg，重复次数为10；
9、所述ssr07的重复单元为gaa，重复次数为5；
10、所述ssr08的重复单元为gga，重复次数为7；
11、所述ssr09的重复单元为tgt，重复次数为7；
12、所述ssr10的重复单元为ctc，重复次数为8；
13、所述ssr11的重复单元为gag，重复次数为5；
14、所述ssr12的重复单元为ttc，重复次数为5；
15、所述ssr13的重复单元为cgc，重复次数为5；
16、所述ssr14的重复单元为tca，重复次数为8；
17、所述ssr15的重复单元为ggc，重复次数为7；
18、所述ssr16的重复单元为gcg，重复次数为7；
19、所述ssr17的重复单元为cgc，重复次数为5；
20、所述ssr18的重复单元为ctg，重复次数为7；
21、所述ssr19的重复单元为gca，重复次数为6；
22、所述ssr20的重复单元为ct，重复次数为22；
23、所述ssr21的重复单元为gag，重复次数为7；
24、所述ssr22的重复单元为agc，重复次数为5；
25、所述ssr23的重复单元为cca，重复次数为6；
26、所述ssr24的重复单元为ggc，重复次数为6；
27、所述ssr25的重复单元为gcg，重复次数为8；
28、所述ssr26的重复单元为tgc，重复次数为5；
29、所述ssr27的重复单元为cct，重复次数为5；
30、所述ssr28的重复单元为tc，重复次数为8；
31、所述ssr29的重复单元为gtg，重复次数为6；
32、所述ssr30的重复单元为gcc，重复次数为5；
33、所述ssr31的重复单元为gac，重复次数为7；
34、所述ssr32的重复单元为ccg，重复次数为5；
35、所述ssr33的重复单元为tac，重复次数为8；
36、所述ssr34的重复单元为cgg，重复次数为6；
37、所述ssr35的重复单元为tcagc，重复次数为5；
38、所述ssr36的重复单元为cctcag，重复次数为5；
39、所述ssr37的重复单元为tga，重复次数为5；
40、所述ssr38的重复单元为cgg，重复次数为5；
41、所述ssr39的重复单元为agg，重复次数为5。
42、本专利技术还提供了一组用于扩增上述技术方案所述ssr标记组合的引物组合，包括zj-ssr01、zj-ssr02、zj-ssr03、zj-ssr04、zj-ssr05、zj-ssr06、zj-ssr07、zj-ssr08、zj-ssr09、zj-ssr10、zj-ssr11、zj-ssr12、zj-ssr13、zj-ssr14、zj-ssr15、zj-ssr16、zj-ssr17、zj-ssr18、zj-ssr19、zj-ssr20、zj-ssr21、zj-ssr22、zj-ssr23、zj-ssr24、zj-ssr25、zj-ssr26、zj-ssr27、zj-ssr28、zj-ssr29、zj-ssr30、zj-ssr31、zj-ssr32、zj-ssr33、zj-ssr34、zj-ssr35、zj-ssr36、zj-ssr37、zj-ssr38和zj-ssr39；
43、所述zj-ssr01包括zj-ssr01-f和zj-ssr01-r，所述zj-ssr01-f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述zj-ssr01-r的核苷酸序列如seq id no.2所示；
44、所述zj-ssr02包括zj-ssr02-f和zj-ssr02-r，所述zj-ssr02-f的核苷酸序列如seq id no.3所示，所述zj-本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种鉴定结缕草的SSR标记组合，其特征在于，所述SSR标记组合包括SSR01、SSR02、SSR03、SSR04、SSR05、SSR06、SSR07、SSR08、SSR09、SSR10、SSR11、SSR12、SSR13、SSR14、SSR15、SSR16、SSR17、SSR18、SSR19、SSR20、SSR21、SSR22、SSR23、SSR24、SSR25、SSR26、SSR27、SSR28、SSR29、SSR30、SSR31、SSR32、SSR33、SSR34、SSR35、SSR36、SSR37、SSR38和SSR39；
2.一组用于扩增权利要求1所述SSR标记组合的引物组合，其特征在于，包括Zj-SSR01、Zj-SSR02、Zj-SSR03、Zj-SSR04、Zj-SSR05、Zj-SSR06、Zj-SSR07、Zj-SSR08、Zj-SSR09、Zj-SSR10、Zj-SSR11、Zj-SSR12、Zj-SSR13、Zj-SSR14、Zj-SSR15、Zj-SSR16、Zj-SSR17、Zj-SSR18、Zj-SSR19、Zj-SSR20、Zj-SS
3.权利要求1所述SSR标记组合或权利要求2所述引物组合在鉴定和/或区分结缕草品种中的应用。
4.一种结缕草品种的鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：
5.一种鉴定结缕草品种的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2所述的引物组合。
6.一种结缕草基因组芯片，其特征在于，所述结缕草基因组芯片含有权利要求1所述SSR标记组合。
7.权利要求1所述SSR标记组合或权利要求2所述引物组合或权利要求5所述试剂盒或权利要求6所述的结缕草基因组芯片在结缕草的亲缘关系分析中的应用。
8.权利要求1所述SSR标记组合或权利要求2所述引物组合或权利要求5所述试剂盒或权利要求6所述的结缕草基因组芯片在结缕草的母系溯源中的应用。
9.权利要求1所述SSR标记组合或权利要求2所述引物组合或权利要求5所述试剂盒或权利要求6所述的结缕草基因组芯片在结缕草遗传谱系分析和/或遗传图谱构建中的应用。
10.权利要求1所述SSR标记组合或权利要求2所述引物组合或权利要求5所述试剂盒或权利要求6所述的结缕草基因组芯片在结缕草种质资源的保护和/或辅助育种中的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种鉴定结缕草的ssr标记组合，其特征在于，所述ssr标记组合包括ssr01、ssr02、ssr03、ssr04、ssr05、ssr06、ssr07、ssr08、ssr09、ssr10、ssr11、ssr12、ssr13、ssr14、ssr15、ssr16、ssr17、ssr18、ssr19、ssr20、ssr21、ssr22、ssr23、ssr24、ssr25、ssr26、ssr27、ssr28、ssr29、ssr30、ssr31、ssr32、ssr33、ssr34、ssr35、ssr36、ssr37、ssr38和ssr39；
2.一组用于扩增权利要求1所述ssr标记组合的引物组合，其特征在于，包括zj-ssr01、zj-ssr02、zj-ssr03、zj-ssr04、zj-ssr05、zj-ssr06、zj-ssr07、zj-ssr08、zj-ssr09、zj-ssr10、zj-ssr11、zj-ssr12、zj-ssr13、zj-ssr14、zj-ssr15、zj-ssr16、zj-ssr17、zj-ssr18、zj-ssr19、zj-ssr20、zj-ssr21、zj-ssr22、zj-ssr23、zj-ssr24、zj-ssr25、zj-ssr26、zj-ssr27、zj-ssr28、zj-ssr29、zj-ssr30、zj-ssr31、z...
【专利技术属性】
技术研发人员：郭海林，刘梦娇，孔维一，刘恬，沈泽宇，李书桐，李建建，
申请(专利权)人：江苏省中国科学院植物研究所，
类型：发明
国别省市：
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