【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物学及遗传育种领域，具体地说，涉及一种与山羊体尺体重性状相关的snp标记的应用。
技术介绍
1、融合蛋白核糖核蛋白ptb结合2（ribonucleoprotein，ptb-binding 2，phtf2）是一种重要的蛋白质，再多种细胞和组织中发挥关键作用。phtf2是一种与多聚嘧啶链结合蛋白（ptb，polypyrimidine tract-binding protein）结合的核糖核蛋白，参与rna的代谢过程，包括rna剪接和稳定性调控。phtf2具有三个rna之别基序，与raver1蛋白在序列同源性和整体结构域上相似。phtf2能够结合rna，并与多聚嘧啶链结合蛋白（ptb）相互作用。相关研究表明，phtf2在小鼠胚胎发育期间具有独特的时空表达模式。 phtf2在e8.5到e14.5时期的胚胎中均有表达，并且主要集中在神经上皮、脑部和背根神经节等部位。目前，已有研究人员利用全基因组数据对济宁青山羊与波尔山羊筛选与肉质和肌肉发育相关的选择信号，并对胸长肌进行转录组分析。结果表明，在济宁青山羊中发现了442个正向选择基因，其中有139个差异表达基因。同时，对两组基因进行go和kegg富集分析表明，包括 phtf2等多个候选基因和信号通路与肌肉发育相关。ianimal database数据库表明， phtf2基因在山羊内脏中的表达量最高，其次是在肌肉中的表达量最高。在大体尺体重与小体尺体重的山羊群体中进行选择信号分析，发现
2、山羊（ capra hircus）是世界上最重要的牲畜物种之一，大约在10500到9900年前被驯化。山羊为人民日常生活提供了肉、毛、奶和皮等一系列畜产品，在人类生产活动中发挥着重要的经济作用。中国有着悠久的山羊驯化历史和丰富的山羊品种资源。山羊是适应性最强和地理分布最广泛的家畜，在严寒的青藏高原、寒冷干燥的东北、高温高湿的南方、干燥炎热的沙漠和喀斯特山区都有不同品种的山羊分布。为了融入不同的环境和生态系统，山羊受到长期的自然选择和人工选择，并根据不同的自然环境和人类的定向选择，逐步形成具有不同外貌特征、体尺体重和不同遗传特性的品种。中国地方山羊品种具有性成熟早、适应性强、耐粗饲和肉质细嫩味美等特点，但存在初生重小、生长发育缓慢、体尺体重小和产肉率低等特点。地方山羊品种与引入品种杂交改良需要一个漫长的过程，需要引种杂交、级进杂交、横交固定及世代选育花费数十年的时间。
3、随着人民生活水平的提高以及养殖企业的集约化发展，市场对大体尺体重山羊品种的需求日益增长，这给养殖业带来了新的挑战。养殖者正在努力培育体尺体重更大、生长速度快的山羊，以满足消费者对高品质肉类的需求。山羊的体尺体重大小和肌肉发育是一个由基因、饲养管理和环境因素共同作用的复杂过程。有效提升体尺体重大小和肌肉发育，不仅能提高肉品质量，满足市场需求，还能提升养殖效率，带来更大的经济效益。近年来，分子标记辅助选择（molecular marker-assisted selection，mas）育种的发展使得dna分子标记技术在山羊遗传多样性研究中发挥了重要作用。为了更好地开发和利用优良品种的经济特性，以及保护和合理利用品种资源，开发山羊特异的分子标记是必要的。这些标记可以应用于大体尺体重山羊的选育，并为大体尺体重山羊的分子育种提供理论基础。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供与山羊体尺体重性状相关的snp标记（rs668652687）的应用。
2、为了实现本专利技术目的，第一方面，本专利技术提供与山羊体尺体重性状相关的snp标记（rs668652687）的以下任一应用：
3、（1）用于山羊体尺体重性状选育；
4、（2）用于具有大体尺体重性状山羊个体的早期预测；
5、（3）用于大体尺体重性状山羊品系的鉴定；
6、（4）用于山羊品种的遗传改良；
7、（5）用于 phtf2基因分型。
8、本专利技术中，与山羊体尺体重性状相关的snp标记含有如seq id no:1所示序列的第183位的多态性为c/t的核苷酸序列（n为c或t）；具有所述多态性的位点的基因型为tt，对应于小体尺体重性状，具有所述多态性的位点的基因型为cc或ct，对应于大体尺体重性状。
9、所述 phtf2基因在ncbi上的参考序列编号为enschig00000013812。
10、第二方面，本专利技术提供用于扩增所述snp标记的引物，优选包括如seq id no:2-3所示的引物。
11、第三方面，本专利技术提供含有所述引物的试剂或试剂盒。
12、第四方面，本专利技术提供所述引物或含有所述引物的试剂或试剂盒的以下任一应用：
13、（1）用于山羊体尺体重性状选育；
14、（2）用于具有大体尺体重性状山羊个体的早期预测；
15、（3）用于大体尺体重性状山羊品系的鉴定；
16、（4）用于山羊品种的遗传改良；
17、（5）用于 phtf2基因分型。
18、第五方面，本专利技术提供一种山羊体尺体重性状选育方法，包括如下步骤：
19、1）对山羊检测与山羊体尺体重性状相关的snp标记；
20、2）选留步骤1）中基因型为cc或ct的个体作为留种山羊，淘汰tt基因型种山羊。
21、第六方面，本专利技术提供一种培育具有大体尺体重性状山羊品系的方法，包括如下步骤：
22、1）对山羊检测与山羊体尺体重性状相关的snp标记；
23、2）选留步骤1）中基因型为cc或ct的个体，作为留种山羊，并对该留种公、母山羊进行配种；
24、3）对步骤2）中配种出生的山羊检测所述snp标记，保留基因型为cc或ct的个体，淘汰tt基因型个体，再进行繁育，获得具有大体重性状的山羊品系。
25、第七方面，本专利技术提供一种山羊的遗传改良方法，包括如下步骤：
26、1）检测种山羊中与山羊体尺体重性状相关的snp标记；
27、2）选留步骤1）中基因型为cc或ct的个体，淘汰tt基因型个体；
28、3）以步骤2）中基因型为cc或ct的个体作为种山羊，进行繁育，在后代中继续选留基因型为cc或ct的种山羊个体，淘汰tt基因型个体；以逐代提高后代山羊群体中等位基因c的频率，从而降低后代种山羊的小体重的比例。
29、第八方面，本专利技术提供一种筛选大体尺体重性状羔羊的方法，包括如下步骤：
30、1本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.与山羊体尺体重性状相关的SNP标记的以下任一应用：
2.用于扩增与山羊体尺体重性状相关的SNP标记的引物的以下任一应用：
3.含有用于扩增与山羊体尺体重性状相关的SNP标记的引物的试剂或试剂盒的以下任一应用：
4.根据权利要求2或3所述的应用，其特征在于，所述引物如SEQ ID NO:2-3所示。
5.山羊体尺体重性状选育方法，其特征在于，包括如下步骤：
6.培育具有大体尺体重性状山羊品系的方法，其特征在于，包括如下步骤：
7.山羊的遗传改良方法，其特征在于，包括如下步骤：
8.筛选大体尺体重性状羔羊的方法，其特征在于，包括如下步骤：
【技术特征摘要】
1.与山羊体尺体重性状相关的snp标记的以下任一应用：
2.用于扩增与山羊体尺体重性状相关的snp标记的引物的以下任一应用：
3.含有用于扩增与山羊体尺体重性状相关的snp标记的引物的试剂或试剂盒的以下任一应用：
4.根据权利要求2或3所述的应用，其特征在于，所述引物如seq ...
【专利技术属性】
技术研发人员：蒋琳，龚颖，任千姿，苏鹏，王真勍，李业芳，浦亚斌，
申请(专利权)人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：
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