【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因工程领域，具体涉及一种检测甜玉米籽粒gamma-生育三烯酚含量的zmhppd1基因及其应用。
技术介绍
1、甜玉米是一种水果和蔬菜兼用农作物，是微量营养素摄入的重要膳食来源。所有维生素e化合物的结构仅在2,3-二氢苯并呋喃环上的位置和甲基取代基数量上有所不同，但它们的生物活性却有着巨大的差异。维生素e包括8种脂溶性异构体(包括生育酚和生育三烯酚)，其中gamma-生育三烯酚在8种维生素e组分中含量最高，约占整个维生素e含量的38％，是gamma-生育三烯酚含量的3倍。研究表明尽管生育酚和生育三烯酚在结构上相似，但两者在生物学功能存在巨大差异。与生育酚相比，生育三烯酚具有更强的抗氧化、抑制脂质氧化。同时具有降低胆固醇，抗肿瘤等生理功能。对甜玉米种子而言，gamma-生育三烯酚的这些生理功能不仅可以保证甜玉米种子的正常发育，也增加了甜玉米的营养和附加值。通过遗传育种手段，提高甜玉米籽粒组织中gamma-生育三烯酚的含量具有重要意义。
2、基于基因组和群体遗传学的方法为解析维生素e合成的遗传基础提供了重要机会。甜玉米群体丰富的遗传变异为关键基因的利用提供了有利条件。为在作物中有针对性地操纵生育酚和生育三烯酚的水平和种类创造了条件。前期研究中，对玉米籽粒中生育酚和生育三烯酚含量的连锁和关联分析为维生素e合成和代谢的遗传调控提供了大量重要信息。然而，大多数影响生育酚组成的主要数量性状遗传位点通常指向vte4，即vte4是玉米中维生素e合成的关键位点,对于其他位点的研究较少，然而，除vte4，其他用于高生育酚和
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种检测甜玉米籽粒gamma-生育三烯酚含量的zmhppd1基因及其应用。
2、本专利技术通过以下技术方案实现：
3、甜玉米基因组5号染色体上zmhppd1基因位点的应用，所述甜玉米基因组为基因组b73，v4版本，id为zm00001d015356，所述位点为甜玉米基因组5号染色体86086906位置的indel位点，多态性为-/tagaacaagg；所述位点与zmhppd1基因表达正相关进而影响gamma-生育三烯酚含量。
4、进一步地，当包含所述位点的甜玉米籽粒中zmhppd1基因提高表达时，鉴定为甜玉米的gamma-生育三烯酚含量增加；当所述甜玉米籽粒中zmhppd1基因降低表达时，鉴定为甜玉米的gamma-生育三烯酚含量降低。
5、在另外一个方面，一种变异位点检测引物组，所述检测位点引物组包括如seq idno：1所示的正向引物；如seq id no：2所示的正向引物；
6、在另外一个方面，一种检测甜玉米的高gamma-生育三烯酚含量的试剂盒，包括所述的变异位点检测引物组。
7、在另外一个方面，一种高gamma-生育三烯酚含量甜玉米的筛选方法，包括以下步骤：在分子标记辅助选择育种mas早期，基于所述的引物组合，对甜玉米基因组5号染色体位于86086906位置的indel位点的基因型进行鉴定，选择具有变异位点的基因型的甜玉米进行育种和种植。
8、本专利技术采用上述技术方案与现有技术相比，最大的特点在于：
9、与现有技术相比，本专利技术具有如下效果：
10、1、本专利技术利用关联分析技术，新挖掘和鉴定了甜玉米籽粒中控制gamma-生育三烯酚含量相关的indel位点和相关的zmhppd1基因。补充和丰富了甜玉米籽粒gamma-生育三烯酚含量分子鉴定的遗传位点。
11、2、本专利技术基于4-羟基苯基丙酮酸双加氧酶基因(zmhppd1)位点开发的基于琼脂糖凝胶电泳技术的分子标记。可以快速完成基因型检测，具有成本低，操作简便，适合高通量检测。该位点将极大地促进高gamma-生育三烯酚含量的甜玉米生物强化育种。
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1.甜玉米基因组5号染色体上Zmhppd1基因位点的应用，所述甜玉米基因组为基因组B73，v4版本，ID为Zm00001d015356，其特征在于：所述位点为甜玉米基因组5号染色体的86086906位置的InDel位点，多态性为-/TAGAACAAGG；所述位点与Zmhppd1基因表达相关进而影响gamma-生育三烯酚含量。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：当包含所述位点的基因型为“-”时，甜玉米籽粒中Zmhppd1基因提高表达时，鉴定为甜玉米的gamma-生育三烯酚含量增加；当所述位点的基因型为“TAGAACAAGG”时，甜玉米籽粒中Zmhppd1基因降低表达时，鉴定为甜玉米的gamma-生育三烯酚含量降低。
3.一种变异位点检测引物组，其特征在于：所述检测位点引物组包括如SEQ ID NO：1所示的正向引物；如SEQ ID NO：2所示的正向引物。
4.一种检测甜玉米的高gamma-生育三烯酚含量的试剂盒，其特征在于：包括权利要求3所述的变异位点检测引物组。
5.一种高gamma-生育三烯酚含量甜玉米的筛选方法，其特征
...【技术特征摘要】
1.甜玉米基因组5号染色体上zmhppd1基因位点的应用，所述甜玉米基因组为基因组b73，v4版本，id为zm00001d015356，其特征在于：所述位点为甜玉米基因组5号染色体的86086906位置的indel位点，多态性为-/tagaacaagg；所述位点与zmhppd1基因表达相关进而影响gamma-生育三烯酚含量。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：当包含所述位点的基因型为“-”时，甜玉米籽粒中zmhppd1基因提高表达时，鉴定为甜玉米的gamma-生育三烯酚含量增加；当所...
【专利技术属性】
技术研发人员：李坤，祁喜涛，文天祥，李高科，刘浩，朱文广，谢利华，于永涛，胡建广，
申请(专利权)人：广东省农业科学院作物研究所，
类型：发明
国别省市：
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