【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子遗传育种领域，特别是涉及一种与绵羊发情性状相关的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、绵羊的季节性繁殖已成为限制母羊生产力、制约羊肉均衡供应的主要瓶颈，造成这种原因究其本质是绵羊繁殖力相对低下，解决繁殖力低下的最根本途径是增加产羔数与缩短母羊产羔间隔。然而绵羊的季节性繁殖特性决定了很难通过传统的育种技术措施来缩短母羊的产羔间隔。因此，利用现代分子生物学技术来研究和比较绵羊季节性发情和常年发情的行为，寻找影响绵羊季节性发情的关键基因，深入挖掘与常年发情相关联的分子标记成为关键。
2、哺乳动物与鸟类的繁殖活动主要受下丘脑-垂体-性腺轴(hypothalamic-pituitary-gonadal，hpga)系统调控。hpga影响动物季节性繁殖活动的方式是通过光照的周期变化引起褪黑激素(melatonin，mel)分泌水平发生改变继而引起hpga系统中一系列生殖激素分泌水平发生变化来实现的。最新研究表明，在介导mel对下丘脑神经内分泌调控的过程中存在一条逆向调控通路-促甲状腺激素(thyroid-stimulating hormone，tsh)/促甲状腺激素受体(thyroid-stimulating hormone receptor，tshr)逆向信号通路。该通路区别于传统的观点是mel无需通过作用于下丘脑释放神经信号传递至垂体，而是首先作用于垂体，由垂体释放tsh进而调节下丘脑生殖激素的合成与释放，最终达到对繁殖活动的调控。在该逆向调控通路中，tshr基因作为tsh的靶向作用受体在介导tsh分泌等生
3、专利技术人在实验前期通过rt-pcr方法克隆获得绵羊tshr基因完整编码区序列的基础上，对序列的峰值进行分析发现在其编码区第10外显子区域481bp处均出现了套峰，为了验证突变的准确性，专利技术人对其中的481bp处突变位点进行了多态性分析，结果表明，481bp处确实存在突变，该突变的发生是由于t碱基置换为c碱基形成的，为同义突变，未导致编码区氨基酸序列发生改变。t等位基因、c等位基因分别与常年发情、季节性繁殖性状密切相关(p<0.01)。如果对tshr基因外显子区域的其他snp做进一步研究，找到与季节性繁殖性状其他相关的候选分子标记，将为今后绵羊的联合辅助育种提供一定的理论支撑。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种与绵羊发情性状相关的snp分子标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题。本专利技术提供的snp位点和snp分子标记能够准确区分季节性发情绵羊和常年发情绵羊。
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供snp位点在鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊中的应用，所述snp位点位于绵羊tshr基因第10外显子的295bp处，其多态性为g/t。
4、进一步优选的，所述绵羊tshr基因的版本号为kj010775。
5、本专利技术提供了一种与绵羊发情性状相关的snp分子标记，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.3所示，且该核苷酸序列第181位有一个g/t碱基突变。
6、优选的，所述绵羊发情性状包括常年发情和季节性发情。
7、本专利技术提供了用于检测上述的snp分子标记的引物组，所述引物组包括核苷酸序列如seq id no.1所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.2所示的下游引物。
8、本专利技术提供了一种上述的snp分子标记的检测试剂或检测试剂盒，包含上述的引物组。
9、本专利技术提供了上述的snp分子标记、上述的引物组或上所述的检测试剂或检测试剂盒在鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊中的应用。
10、本专利技术提供了一种鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊的方法，包括以下步骤：
11、以待测绵羊样品基因组为模板，利用上述的引物组对所述模板进行pcr扩增，根据扩增结果进行基因型分型。
12、优选的，若基因分型结果为tt，则判定待测绵羊为常年发情绵羊品种；若基因分型结果为gg，则判定待测绵羊为季节性发情绵羊品种。
13、本专利技术提供了上述的snp分子标记或上述的引物组或上所述的检测试剂或检测试剂盒在筛选季节性发情绵羊或常年发情绵羊中的应用。
14、本专利技术提供了上述的snp分子标记或上述的引物组或上所述的检测试剂或检测试剂盒在绵羊育种中的应用。
15、本专利技术公开了以下技术效果：
16、本专利技术选择绵羊tshr基因第10外显子t295g为候选多态位点，利用pcr-sscp技术检测该位点的多态性及其在不同繁殖特性的绵羊群体中的分布，为今后常年发情绵羊品种培育提供一定的理论依据。而且本专利技术对其与常年发情和季节性繁殖绵羊群体的繁殖表型相关性进行了分析，结果表明，等位基因g/t比值与绵羊的繁殖特性密切相关，季节性繁殖的中国美利奴羊等位基因g/t比值高达3.48，而非季节性繁殖的多浪羊g/t比值仅为0.222，两类繁殖特性不同的绵羊品种g/t比值存在极显著差异(p<0.01)。由此可见，绵羊tshr基因第10外显子t295g位点以及含有该位点的snp分子标记可作为一个良好的分子标记。
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1.SNP位点在鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊中的应用，其特征在于，所述SNP位点位于绵羊TSHR基因第10外显子的295bp处，其多态性为G/T。
2.一种与绵羊发情性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，且该核苷酸序列第181位有一个G/T碱基突变。
3.根据权利要求2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述绵羊发情性状包括常年发情和季节性发情。
4.用于检测权利要求2或3所述的SNP分子标记的引物组，其特征在于，所述引物组包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的上游引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的下游引物。
5.一种权利要求2或3所述的SNP分子标记的检测试剂或检测试剂盒，其特征在于，包含权利要求4所述的引物组。
6.权利要求2或3所述的SNP分子标记、权利要求4所述的引物组或权利要求5所述的检测试剂或检测试剂盒在鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊中的应用。
7.一种鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊的方法，其特征在于，包括以下步骤
8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，若基因分型结果为TT，则判定待测绵羊为常年发情绵羊品种；若基因分型结果为GG，则判定待测绵羊为季节性发情绵羊品种。
9.权利要求2或3所述的SNP分子标记或权利要求4所述的引物组或权利要求5所述的检测试剂或检测试剂盒在筛选季节性发情绵羊或常年发情绵羊中的应用。
10.权利要求2或3所述的SNP分子标记或权利要求4所述的引物组或权利要求5所述的检测试剂或检测试剂盒在绵羊育种中的应用。
...【技术特征摘要】
1.snp位点在鉴定季节性发情绵羊和常年发情绵羊中的应用，其特征在于，所述snp位点位于绵羊tshr基因第10外显子的295bp处，其多态性为g/t。
2.一种与绵羊发情性状相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.3所示，且该核苷酸序列第181位有一个g/t碱基突变。
3.根据权利要求2所述的snp分子标记，其特征在于，所述绵羊发情性状包括常年发情和季节性发情。
4.用于检测权利要求2或3所述的snp分子标记的引物组，其特征在于，所述引物组包括核苷酸序列如seq id no.1所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.2所示的下游引物。
5.一种权利要求2或3所述的snp分子标记的检测试剂或检测试剂盒，其特征在于，包含权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：高磊，张译元，杨井泉，杨杨，沈敏，赵赓，
申请(专利权)人：新疆农垦科学院，
类型：发明
国别省市：
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