System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 猪SLC22A1基因第七外显子中的分子标记、引物、试剂盒、方法及应用技术_技高网

猪SLC22A1基因第七外显子中的分子标记、引物、试剂盒、方法及应用技术

技术编号:42852457 阅读:1 留言:0更新日期:2024-09-27 17:20
本申请涉及猪SLC22A1基因第七外显子中的分子标记、引物、试剂盒、方法及应用。该分子标记包括猪基因组第1号染色体第7351159bp处发生单核苷酸C>T突变形成的核苷酸序列。利用引物对包含该单核苷酸突变位点的目的序列进行PCR扩增,能够快速鉴别SLC22A1基因的多态性,从而检测猪肉品质的差异,以为猪肉品种的选育提供指导。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及猪育种,具体涉及猪slc22a1基因第七外显子中的分子标记、引物、试剂盒、方法及应用。


技术介绍

1、在过去的几十年里,养猪企业注重生长速率、瘦肉率、饲料转化率等相关生长品质,主要从数量上满足消费者的需求。然而,猪生长品质与猪肉品质往往呈负相关性,在提高生长品质的同时也必然使肉品质下降。然而,人们更加追求肉质的口感与风味。因此、肉品质的改良也成为各养殖企业的重点研究工作。

2、随着基因组学、分子生物学和生物信息学等学科的发展,高通量测序技术、基因分型技术和基因编辑技术等的广泛应用,以及猪全基因组测序及单倍型计划的实施和完成,极大地推动了猪重大育种价值基因的鉴定。用于辅助选择的分子标记包括蛋白质标记,微卫星标记,单核苷酸多态性(snp)标记等。snp标记是指基因组上单个核苷酸变异引起的dna序列的多态性,它具有数量多、准确性高、多态性高等特点,在育种实践中可以利用snp对某些优良基因进行定位,并结合表型确定标记与特定品质之间的关联性,还可以将分子标记在群体中进行验证并应用在分子育种上。


技术实现思路

1、solute carrierfamily 22member 1,简称slc22a1基因,编码的slc22a1(有机阳离子转运蛋白1)是一种多特异性膜转运蛋白,是人肝脏中表达最丰富的转运蛋白之一,该转运蛋白在调节肝脏能量状态和脂质含量方面起着关键作用,介导肝细胞对维生素b1、阳离子药物和外源性物质的摄取。而有关该基因在猪肉品质中的研究还未见报道。

2、而本申请通过硒都黑猪肉品质资源群体gwas分析,发现slc22a1基因区域存在与猪肉品质显著相关信号位点。因此,本申请根据slc22a1基因在第七外显子上的单核苷酸突变位点设计特异性引物并进行扩增,根据扩增产物的多态性检测结果来区分猪个体间的肉质差异。利用该分子标记设计引物,对包含该snp位点的核苷酸序列进行pcr扩增,能够在较短的时间内鉴别slc22a1基因的多态性,从而检测猪肉品质的差异,以为猪肉品种的选育提供指导。另外,本申请提供的引物能够特异性扩增slc22a1的基因内含子包含的snp位点序列,检测方法成本低。只需要通过pcr扩增的方法即可检测,不需要进行大量的群体规模采样与测定即可进行比较不同猪只之间肉质的差异。

3、为此,本申请实施例至少公开了以下技术方案:

4、(1):猪肉品质的分子标记,包括猪slc22a1基因第七外显子7351159bp处发生单核苷酸突变c>t形成的核苷酸序列。

5、(2):猪肉品质的分子标记引物,包括如seq id no:3所示的dna分子和如seq idno:4所示的dna分子。

6、(3):一种核酸分子,由(2)所述的分子标记引物经pcr扩增而成,所述核酸分子的基因型与所述猪肉品质关联。

7、(4):一种试剂盒,包括(2)所述的分子标记引物以及其他pcr扩增所需试剂。

8、(5):猪肉品质的检测方法,包括:

9、获取待测猪基因组dna;

10、通过(2)所述的分子标记引物进行pcr扩增;

11、根据扩增产物的核苷酸序列检测猪第1号染色体7351159bp处的基因型;

12、根据所述基因型确定所述猪肉品质。

13、(6):,包括(5)所述检测方法的猪筛选方法。

14、(7):(1)所述的分子标记、(2)所述的分子标记引物、(3)所述的核酸分子或(4)所述的试剂盒的应用,所述应用选自如下任一:

15、1)所述猪肉品质的检测与分析,所述猪肉品质选自肌肉色值l24、滴水损失48h和肌内脂肪的至少一种;

16、2)猪的筛选与育种。

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【技术保护点】

1.猪肉品质的分子标记,包括猪基因组第1号染色体第7351159bp处发生单核苷酸C>T突变形成的核苷酸序列。

2.根据权利要求1所述的分子标记,所述分子标记还包括SLC22A1基因第七外显子核苷酸序列的137bp处发生C>T形成的核苷酸序列。

3.根据权利要求1所述的分子标记,TT基因型个体肌肉色值L24显著高于CC基因型个体;

4.猪肉品质的分子标记引物,包括如SEQ ID NO:3所示的DNA分子和如SEQ ID NO:4所示的DNA分子。

5.一种核酸分子,由如权利要求4所述的分子标记引物经PCR扩增而成,所述核酸分子的基因型与所述猪肉品质关联。

6.根据权利要求5所述的核酸分子,如SEQ ID NO:1和/或2所示。

7.一种试剂盒,包括如权利要求4所述的分子标记引物以及其他PCR扩增所需试剂。

8.猪肉品质的检测方法,包括:

9.猪的筛选方法,包括如权利要求8所述的检测方法。

10.权利要求1~3任一所述的分子标记、权利要求4所述的分子标记引物、权利要求5~6任一所述的核酸分子或权利要求7所述的试剂盒的应用,所述应用选自如下任一:

...

【技术特征摘要】

1.猪肉品质的分子标记,包括猪基因组第1号染色体第7351159bp处发生单核苷酸c>t突变形成的核苷酸序列。

2.根据权利要求1所述的分子标记,所述分子标记还包括slc22a1基因第七外显子核苷酸序列的137bp处发生c>t形成的核苷酸序列。

3.根据权利要求1所述的分子标记,tt基因型个体肌肉色值l24显著高于cc基因型个体;

4.猪肉品质的分子标记引物,包括如seq id no:3所示的dna分子和如seq id no:4所示的dna分子。

5.一种核酸分子,由如权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:吴俊静梅书棋彭先文李梓芃徐忠张宇冯越乔木周佳伟孙华李良华赵海忠宋忠旭彭明月
申请(专利权)人:湖北省农业科学院畜牧兽医研究所
类型:发明
国别省市:

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