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DNA混合分型免拆分比对排序方法技术

技术编号:42810492 阅读:12 留言:0更新日期:2024-09-24 20:52
本发明专利技术涉及刑事侦察、人员调查等场合对DNA样本与数据库数据进行比对筛选的技术,具体是一种DNA混合分型免拆分比对排序方法。该方法依次经过以下步骤:步骤一,将需要比对的DNA混合分型与人员DNA数据库进行比对,获得随机排序的比中人员队列;步骤二,对队列中的人员DNA分型,分别计算其在人员DNA数据库中各个基因座等位基因分型的被包含概率PBI;步骤三,计算比中队列中每个人员DNA分型的联合被包含概率CPBI,将CPBI数值按照由低到高的顺序排序,排序越靠前,则被比中人员的可靠性越高。本发明专利技术解决了混合DNA分型免拆分比对结果队列可靠性排序的问题,提高了筛选效率,同时避免了拆分导致的数据漏比问题。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及刑事侦察、人员调查等场合对dna样本与数据库数据进行比对筛选的技术,具体是一种dna混合分型免拆分比对排序方法。


技术介绍

1、随着公安刑事科学技术的发展和物证、检材性质的改变,检出的常染色体dna-str混合分型(以下简称混合dna)占比已经超过50%,其中蕴含了很多有关犯罪嫌疑人的dna线索,但是对其实际运用却存在较多困难。

2、多年来混合dna利用方法还是围绕拆分方法进行,但是混合dna的拆分会遇到没有已知样本提供参照,峰面积不严格成比例,等位基因缺失,stutter峰与真实等位基因峰互相叠加等等不可控的因素,导致工作繁琐、数据漏比等问题。传统的钟摆查询系统、图形挖掘拆分,以及新出现的各类智能拆分工具,并未明显优于人工拆分且操作流程复杂,没有形成大规模的运用。

3、如果将混合dna样本不拆分直接与现有的dna数据库进行比对,数据库反馈的比中人员数量很大,可能数以千计,而真正的dna提供者可能只有2-3个,使得甄别的工作量巨大。


技术实现思路

1、本专利技术所要解决的技术问题是,提供一种排序方法,能够将混合dna分型免拆分比对后数据库反馈的比中队列中的人员,按照可靠性大小进行排序,从而能够高效的找出真正的dna提供者。

2、本专利技术的dna混合分型免拆分比对排序方法依次经过以下步骤:

3、步骤一,将需要比对的dna混合分型与人员dna数据库进行比对,获得随机排序的比中人员队列;

4、步骤二,对步骤一获得队列中的人员dna分型,分别计算其在人员dna数据库中各个基因座等位基因分型的被包含概率pbi,计算方法是:

5、当该人员分型在某基因座等位基因为纯合子时,被包含概率的计算公式为:

6、pbi=1-(1-pa)n;

7、当该人员分型在某基因座等位基因为杂合子时,被包含概率的计算公式为:

8、pbi=1-[(1-pa)n+(1-pb)n-(1-pa-pb)n];

9、式中pa、pb为被比中人员dna分型的等位基因的频率,n为混合分型在某基因座的等位基因个数;

10、步骤三,计算比中队列中每个人员dna分型的联合被包含概率cpbi(combinedprobability of being included),方法是将比中队列中每个人员dna分型的各个基因座的被包含概率pbi相乘,得到联合被包含概率:式中m为比中基因座数量;

11、步骤四,将cpbi数值按照由低到高的顺序排序,排序越靠前,则被比中人员的可靠性越高。

12、进一步的,步骤1中人员dna数据库中,选择的用于数据比对的基因座数量为10-30个,优选为12-23个。

13、本专利技术利用优化的算法,解决了混合dna分型免拆分比对结果队列可靠性排序的问题,便于筛选出真正的dna提供者,提高了筛选效率。同时该方法避免了拆分导致的数据漏比问题,比中结果为全量数据,可以与其他技术方法获得的数据进行交叉比对,充分发挥大数据的优势,避免工作疏漏的发生。

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种DNA混合分型免拆分比对排序方法,其特征是:依次经过以下步骤,

2.根据权利要求1所述的DNA混合分型免拆分比对排序方法,其特征是:步骤1中人员DNA数据库中,选择的用于数据比对的基因座数量为10-30个。

3.根据权利要求2所述的DNA混合分型免拆分比对排序方法,其特征是:选择的用于数据比对的基因座数量为12-23个。

【技术特征摘要】

1.一种dna混合分型免拆分比对排序方法,其特征是:依次经过以下步骤,

2.根据权利要求1所述的dna混合分型免拆分比对排序方法,其特征是:步骤1中人员dna数据库中...

【专利技术属性】
技术研发人员:王禹
申请(专利权)人:王禹
类型:发明
国别省市:

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