【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、本公开涉及用于涉及核酸电泳分离的应用的组合物、试剂盒和方法，包括毛细管电泳应用，其中核酸样品用染料标记、大小分离并经受短串联重复(str)分析。
2、快速dna测试通常被理解为意指在数小时而不是数天内由样品产生dna谱并且需要有限的人为干预的方法。例如，执法部门可获得被捕个体的面颊拭子，并将样品插入到快速dna测试仪器中。目前，此类仪器在约两小时内提供dna谱。然后可将dna谱与dna谱数据库和/或与未解决的犯罪相关联的dna样品进行比较。快速dna测试还用于法医分析、人遗骸鉴定、犯罪现场调查以及在拘留所鉴定或排除嫌疑人。
3、快速dna仪器通常利用电泳基于大小分离样品内的dna，并基于str分型提供dna谱。用特定的引物靶向str基因座，然后扩增并用染料标记。通常，使用多种染料，每种染料对预期一旦大小分离就充分展开的特定基因座或基因座组具有特异性。这允许对不同染料通道之间分布的多个基因座进行等位基因分型。通过分析足够的基因座，等位基因的模式提供了对个体的高度准确的鉴定。在美国，例如，str分型程序通常分析组合dna索引系统(codis)的标准核心基因座，称为codis20(或先前codis13标准的核心基因座)。
4、快速dna应用是有益的，因为它们提供结果的相对速度。结果可在嫌疑人仍被拘留期间获得，从而降低了获得dna结果之后嫌疑人逃跑和无法联系到的风险。快速dna应用还降低了处理步骤的数目、处理样品的人数以及获得结果所需的位置转移的数目。这降低了样品污染或误操作的风险。<...
【技术保护点】
1.一种用于扩增样品内的一种或多种核酸的方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括鉴定所述STR区域的等位基因。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述组合物包含多组引物，每组引物被配置为靶向所述样品核酸的不同STR区域。
4.根据权利要求3所述的方法，所述方法还包括鉴定所述不同STR区域的所述等位基因。
5.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括基于所确定的等位基因鉴定个体。
6.根据权利要求5所述的方法，其中鉴定所述个体与法医和/或犯罪现场调查相关联。
7.根据权利要求6所述的方法，其中所述QS序列比所述STR区域短。
8.根据权利要求6所述的方法，其中所述QL序列比所述STR区域长。
9.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品是法医样品、犯罪现场样品、受害者样品或来自未鉴定的人遗骸的样品。
10.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品包括血液、骨骼、口腔材料、唾液、精液、尿液、粪便、皮肤细胞、触摸DNA或其组合。
11.根据权利要
12.根据权利要求1所述的方法，其中所述QS序列、所述QL序列或两者不含插入缺失。
13.根据权利要求1所述的方法，其中所述QS序列、所述QL序列或两者是多拷贝序列。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组QS引物的正向引物中的至少一些正向引物和/或反向引物中的至少一些反向引物包括可检测标记。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述一组QS引物中经标记的正向引物与未标记的正向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2，并且/或者其中所述一组QS引物中经标记的反向引物与未标记的反向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2。
16.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组QL引物的正向引物中的至少一些正向引物和/或反向引物中的至少一些反向引物包括可检测标记。
17.根据权利要求16所述的方法，其中所述一组QL引物中经标记的正向引物与未标记的正向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2，并且/或者其中所述一组QL引物中经标记的反向引物与未标记的反向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2。
18.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组QS引物选自SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:96。
19.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组QL引物选自SEQ ID NO:97至SEQ ID NO:192。
20.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括：
21.根据权利要求20所述的方法，其中当所述QS峰高度和所述QL峰高度两者均低于它们相应的预定阈值时，将所述样品标记为低核酸浓度。
22.根据权利要求20所述的方法，其中当所述QS峰高度不低于其阈值并且所述QL峰高度低于其阈值时，将所述样品标记为具有经降解的靶核酸和/或具有经抑制的扩增。
23.根据权利要求20所述的方法，其中当所述QS峰高度和所述QL峰高度两者均基本上为零时，将所述样品标记为缺乏靶核酸。
24.根据权利要求20所述的方法，其中所述组合物还包含：
25.根据权利要求24所述的方法，其中所述IQCS序列比所述STR区域短。
26.根据权利要求24所述的方法，其中所述IQCL序列比所述STR区域长。
27.根据权利要求24所述的方法，其中当所述QS峰高度不低于其阈值，所述QL峰高度低于其阈值，并且检测到所述IQCL序列时，将所述样品标记为具有经降解的靶核酸。
28.根据权利要求24所述的方法，其中当所述QS峰高度不低于其阈值，所述QL峰高度低于其阈值，并且未检测到所述IQCL序列时，将所述样品标记为具有经抑制的扩增。
29.根据权利要求1所述的方法，其中所述组合物还包含DNA聚合酶和脱氧核糖核苷酸三磷酸(dNTP)分子，并且其中使所述混合物经受扩增条件包括进行聚合酶链式反应(PCR)。
30.根据权利要求29所述的方法，其中所述DNA聚合酶是热稳定DNA聚合酶。
31.根据权利要求30所述的方法，其中所述DNA聚合酶是Taq DNA聚合酶，其突变体、变体或衍生物。
32.根据权利要求29所述的方法，其中所述核苷酸选自dTTP、dATP、dCTP、dGTP、7-脱氮-dGTP或dUTP。
33.根据权利要求29所述的方法，所述组合物还包含一种或多种缓冲液和一种或...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于扩增样品内的一种或多种核酸的方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括鉴定所述str区域的等位基因。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述组合物包含多组引物，每组引物被配置为靶向所述样品核酸的不同str区域。
4.根据权利要求3所述的方法，所述方法还包括鉴定所述不同str区域的所述等位基因。
5.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括基于所确定的等位基因鉴定个体。
6.根据权利要求5所述的方法，其中鉴定所述个体与法医和/或犯罪现场调查相关联。
7.根据权利要求6所述的方法，其中所述qs序列比所述str区域短。
8.根据权利要求6所述的方法，其中所述ql序列比所述str区域长。
9.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品是法医样品、犯罪现场样品、受害者样品或来自未鉴定的人遗骸的样品。
10.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品包括血液、骨骼、口腔材料、唾液、精液、尿液、粪便、皮肤细胞、触摸dna或其组合。
11.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品包括人基因组dna。
12.根据权利要求1所述的方法，其中所述qs序列、所述ql序列或两者不含插入缺失。
13.根据权利要求1所述的方法，其中所述qs序列、所述ql序列或两者是多拷贝序列。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组qs引物的正向引物中的至少一些正向引物和/或反向引物中的至少一些反向引物包括可检测标记。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述一组qs引物中经标记的正向引物与未标记的正向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2，并且/或者其中所述一组qs引物中经标记的反向引物与未标记的反向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2。
16.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组ql引物的正向引物中的至少一些正向引物和/或反向引物中的至少一些反向引物包括可检测标记。
17.根据权利要求16所述的方法，其中所述一组ql引物中经标记的正向引物与未标记的正向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2，并且/或者其中所述一组ql引物中经标记的反向引物与未标记的反向引物的比例为约1:1至约1:5，诸如约1:2。
18.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组qs引物选自seq id no:1至seq id no:96。
19.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组ql引物选自seq id no:97至seq id no:192。
20.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括：
21.根据权利要求20所述的方法，其中当所述qs峰高度和所述ql峰高度两者均低于它们相应的预定阈值时，将所述样品标记为低核酸浓度。
22.根据权利要求20所述的方法，其中当所述qs峰高度不低于其阈值并且所述ql峰高度低于其阈值时，将所述样品标记为具有经降解的靶核酸和/或具有经抑制的扩增。
23.根据权利要求20所述的方法，其中当所述qs峰高度和所述ql峰高度两者均基本上为零时，将所述样品标记为缺乏靶核酸。
24.根据权利要求20所述的方法，其中所述组合物还包含：
25.根据权利要求24所述的方法，其中所述iqcs序列比所述str区域短。
26.根据权利要求24所述的方法，其中所述iqcl序列比所述str区域长。
27.根据权利要求24所述的方法，其中当所述qs峰高度不低于其阈值，所述ql峰高度低于其阈值，并且检测到所述iqcl序列时，将所述样品标记为具有经降解的靶核酸。
28.根据权利要求24所述的方法，其中当所述qs峰高度不低于其阈值，所述ql峰高度低于其阈值，并且未检测到所述iqcl序列时，将所述样品标记为具有经抑制的扩增。
29.根据权利要求1所述的方法，其中所述组合物还包含dna聚合酶和脱氧核糖核苷酸三磷酸(dntp)分子，并且其中使所述混合物经受扩增条件包括进行聚合酶链式反应(pcr)。
30.根据权利要求29所述的方法，其中所述dna聚合酶是热稳定dna聚...
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