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用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型及试剂盒制造技术

技术编号:42793629 阅读:20 留言:0更新日期:2024-09-21 00:49
本发明专利技术涉及一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型及试剂盒,所述蛋白质乳酸化模型,包括八个基因表达量范围指标,八个基因分别为ABCG8、ALDOC、CFH、GCK、HMOX1、MVK、PRKACB和SPP1;所述模型的评分S的计算公式如下:S=(‑1.213×ABCG8表达量)+(‑0.002×ALDOC表达量)+(0.007×CFH表达量)+(0.054×GCK表达量)+(0.001×HMOX1表达量)+(‑0.017×MVK表达量)+(‑0.008×PRKACB表达量)+(0.001×SPP1表达量);当S>0,则患者为高风险;当S<0,则患者为低风险。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医药,尤其涉及一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型及试剂盒


技术介绍

1、胶质瘤是指起源于脑神经胶质细胞的肿瘤,是最常见的原发性颅内恶性肿瘤。胶质瘤占所有原发性中枢神经系统肿瘤的40%~60%,约占中枢神经系统恶性肿瘤的81%。胶质瘤具有高致病率、高致残率和高复发率的特征。胶质瘤的成人年发病率为5~8/10万,5年病死率在全身肿瘤中仅次于胰腺癌和肺癌。

2、根据2021版世界卫生组织(world health organization,who)中枢神经系统肿瘤分类的内容,胶质瘤的诊断需要包含组织病理学诊断和基因特征。胶质瘤分为who i-iv级,其中,who i级胶质瘤为良性肿瘤,who ii、iii级为低级别胶质瘤(lower grade glioma,lgg),who iv级为高级别胶质瘤。其中,who iv级胶质瘤是恶性程度最高的胶质瘤类型,根据“组织病理+分子特征”的整合诊断模式,who iv级胶质瘤包括idh(isocitratedehydrogenase,异柠檬酸脱氢酶)突变型星形细胞瘤、idh野生型胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,gbm)、h3g34弥漫性大脑半球胶质瘤和h3k27变异型弥漫性中线胶质瘤。

3、目前,针对胶质瘤的首选治疗方案是手术切除,同时应进行术后辅助放、化疗。然而,尽管对于胶质瘤的诊断和治疗手段在不断的提高和完善,胶质瘤患者的预后仍然不尽人意。特别是对于who iv级胶质瘤患者而言,根据标准治疗方案接受治疗后中位生存期也仅有15个月。传统胶质瘤靶向治疗手段效果不佳的一个很重要的原因在于忽视了肿瘤细胞同其微环境组分的交互改造。近年来,越来越多的研究开始关注恶性肿瘤细胞与其所在微环境组分间的相互调控与相互适应。

4、肿瘤微环境的形成和调控基质是复杂和多样化的,其中,蛋白质翻译后修饰作为蛋白质层面上的修饰调节途径,近年来被研究人员所重视,并进行了大量的深入研究。蛋白质翻译后修饰(post-translational modification,ptm)是指在蛋白质的一个或多个氨基酸残基上通过添加或移除特定的基团进而调节蛋白质活性、定位、表达以及与其他细胞分子相互作用的一种调控方式。蛋白质翻译后修饰可以影响各种细胞功能,如细胞信号转导、细胞增殖迁移、细胞程序性死亡等生物学过程,是肿瘤中研究较为热门的领域之一。蛋白质乳酸化(lactylation)是于2019年首次提出的一种新型蛋白质翻译后修饰类型,其基本过程将乳酸基结合到氨基酸残基上,从而改变蛋白质的结构和功能。乳酸是细胞内糖酵解代谢途径中的重要代谢产物,也是细胞能量的重要来源。近年来,越来越多的研究发现,乳酸可以作为一种重要的信号分子,参与到细胞内通路、细胞代谢途径、免疫反应和细胞间通讯等重要生物学过程中。其中,warburg效应是导致细胞内乳酸堆积的重要因素。warburg效应是指细胞在充足的有氧环境下,依旧摄入大量的葡萄糖并进行糖酵解代谢途径,并因此生成大量的乳酸,这在肿瘤细胞中十分常见。乳酸在细胞内积累,并通过激活细胞膜上的转运蛋白输出到细胞外环境,最终形成酸性肿瘤微环境,促进肿瘤细胞的增殖。由于肿瘤细胞中warburg效应较为明显,导致肿瘤细胞内乳酸水平较正常细胞内明显升高,因此,肿瘤中的蛋白质乳酸化可能是异常的。

5、患者的预后往往与肿瘤微环境的复杂程度密切相关,胶质瘤便存在这样的情况。胶质瘤中的微环境呈现酸性,这使得胶质瘤细胞在细胞增殖、细胞侵袭、耐药抵抗方面都有很大的异质性。一方面,酸性微环境可能促进胶质瘤细胞的转移和侵袭,增加肿瘤的恶性程度。酸性环境可以激活一些相关的信号通路,如转移相关的蛋白质,在促进肿瘤细胞迁移和侵袭中起到重要作用。另一方面,这是因为酸性环境可能影响药物的扩散和转运,导致化疗药物难以进入肿瘤细胞内部。同时,酸性环境可以增加肿瘤细胞的dna修复能力,减少放疗对肿瘤细胞的杀伤作用,从而降低治疗效果。此外,酸性微环境可能影响免疫细胞的功能,减弱免疫系统对肿瘤的识别和清除能力。这可能导致肿瘤细胞免疫逃逸,使其更难受到免疫系统的攻击。

6、目前,还没有关于用于胶质瘤中蛋白质乳酸化预后评价和免疫治疗效果预测模型的试剂盒。


技术实现思路

1、鉴于上述的分析,本专利技术实施例旨在提供一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型及试剂盒,用以至少解决上述问题之一。

2、一方面,本专利技术提供了一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型,包括八个基因表达量范围指标,八个基因分别为abcg8、aldoc、cfh、gck、hmox1、mvk、prkacb和spp1;

3、所述模型的评分s的计算公式如下:

4、s=(-1.213×abcg8表达量)+(-0.002×aldoc表达量)+(0.007×cfh表达量)+(0.054×gck表达量)+(0.001×hmox1表达量)+(-0.017×mvk表达量)+(-0.008×prkacb表达量)+(0.001×spp1表达量);

5、当s>0,则患者为高风险;

6、当s<0,则患者为低风险。

7、进一步地,高风险组患者的生存期低于低风险组患者的生存期;

8、高风险组患者的免疫治疗效果低于低风险组患者的免疫治疗效果。

9、进一步地,高风险组内,s的绝对值越大,患者的预后恢复效果越差,免疫治疗效果越差;

10、低风险组内,s的绝对值越大,患者的预后恢复效果越好,免疫治疗效果越佳。

11、另一方面,本专利技术提供了一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化试剂盒,至少能够通过所述蛋白质乳酸化试剂盒能够构建上述的蛋白质乳酸化模型。

12、进一步地,所述的蛋白质乳酸化试剂盒包括八个基因abcg8、aldoc、cfh、gck、hmox1、mvk、prkacb和spp1的上下游引物,以备用于测定胶质瘤组织中蛋白质乳酸化的八个基因abcg8、aldoc、cfh、gck、hmox1、mvk、prkacb和spp1表达量。

13、进一步地,所述的蛋白质乳酸化试剂盒还包括内参基因的上下游引物,以备测定胶质瘤组织中蛋白质乳酸化的表达量;

14、所述内参基因被配置为能够根据其表达量得到八个基因abcg8、aldoc、cfh、gck、hmox1、mvk、prkacb和spp1表达量的相对表达量。

15、进一步地,所述内参基因为gapdh。

16、进一步地,所述的蛋白质乳酸化试剂盒还包括:

17、rna提取试剂,包括trizol、异丙醇、氯仿、无水乙醇;

18、荧光聚合酶链式反应体系,包括pcr缓冲液、荧光染料、dntps、无rna酶、水。

19、进一步地,所述荧光染料为sybr green i。

20、进一步地,所述蛋白质乳酸化试剂盒的使用方法包括以下步骤:

21、步骤一:获取患者本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型,其特征在于,包括八个基因表达量范围指标,八个基因分别为ABCG8、ALDOC、CFH、GCK、HMOX1、MVK、PRKACB和SPP1;

2.根据权利要求1所述的蛋白质乳酸化模型,其特征在于,高风险组患者的生存期低于低风险组患者的生存期;

3.根据权利要求2所述的的蛋白质乳酸化模型,其特征在于,

4.一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,至少能够通过所述蛋白质乳酸化试剂盒能够构建如权利要求1至3任一所述的蛋白质乳酸化模型。

5.根据权利要求4所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,包括八个基因ABCG8、ALDOC、CFH、GCK、HMOX1、MVK、PRKACB和SPP1的上下游引物,以备用于测定胶质瘤组织中蛋白质乳酸化的八个基因ABCG8、ALDOC、CFH、GCK、HMOX1、MVK、PRKACB和SPP1表达量。

6.根据权利要求5所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,还包括内参基因的上下游引物,以备测定胶质瘤组织中蛋白质乳酸化的表达量;

>7.根据权利要求6所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,所述内参基因为GAPDH。

8.根据权利要求6所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,还包括:

9.根据权利要求8所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,所述荧光染料为SYBRGreen I。

10.根据权利要求9所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,所述蛋白质乳酸化试剂盒的使用方法包括以下步骤:

...

【技术特征摘要】

1.一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化模型,其特征在于,包括八个基因表达量范围指标,八个基因分别为abcg8、aldoc、cfh、gck、hmox1、mvk、prkacb和spp1;

2.根据权利要求1所述的蛋白质乳酸化模型,其特征在于,高风险组患者的生存期低于低风险组患者的生存期;

3.根据权利要求2所述的的蛋白质乳酸化模型,其特征在于,

4.一种用于胶质瘤预后评价的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,至少能够通过所述蛋白质乳酸化试剂盒能够构建如权利要求1至3任一所述的蛋白质乳酸化模型。

5.根据权利要求4所述的蛋白质乳酸化试剂盒,其特征在于,包括八个基因abcg8、aldoc、cfh、gck、hmox1、mvk、prkacb和spp1...

【专利技术属性】
技术研发人员:耿子昂魏宇魁吴虎猛
申请(专利权)人:耿子昂
类型:发明
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