【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学，更具体地，本专利技术涉及一种基于illumina测序平台快速检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组、试剂盒和方法。
技术介绍
1、一碳单位是指氨基酸在分解代谢过程中产生的只含有一个碳原子的有机基团，也是核苷酸合成以及甲基化反应的重要底物。由于这些基团在生物体内不能以游离的形式存在，通常由其载体四氢叶酸携带来参加代谢反应，统称为一碳代谢。一碳单位在核酸生物合成中有重要作用，是核酸(嘧啶、嘌呤)合成代谢的重要前体，并通过腺苷甲硫氨酸参与dna、rna、蛋白质、脂、神经递质等的甲基化反应和谷胱甘肽的合成，对细胞表观遗传和氧化还原状态有重要影响。一碳单位代谢通路是人体内一种重要的代谢途径，它参与了多种生物化学反应，包括dna合成、氨基酸代谢、转化甲基化反应等等。一些研究表明，一碳单位代谢通路相关基因的变异可能会导致多种疾病的发生，例如自闭症、心血管疾病、神经系统疾病、癌症等等。因此，对这些基因进行检测可以帮助人们及早发现潜在的疾病风险，采取相应的预防措施。
2、一碳单位代谢通路相关基因检测是一种基因检测技术，用于检测与一碳单位代谢通路相关的基因变异情况。该技术可以帮助人们了解自身的基因变异情况，从而预测个体在一碳单位代谢通路中的代谢能力和相关疾病的风险。一碳单位代谢通路相关基因检测技术的应用非常广泛。例如，对于一些有家族遗传病史的人群，进行一碳单位代谢通路相关基因检测可以有效地预测患病风险，从而采取相应的预防措施。此外，对于一些高危人群，如吸烟者、酗酒者、高胆固醇人群等，也可以通过检测一碳单位代
3、目前应用较为广泛的基因检测技术主要分为三大类：pcr、fish、基因测序。这三类技术共同构成了基因检测基础，大部分基因检测项目都有赖于这三项基础技术开展。此外，基因芯片技术应用范围也较广。与pcr和fish技术相比，基因测序技术可直接读取dna分子的30亿个碱基序列，具有高通量、数据量大的特点。其中二代基因测序是当下基因检测最热门的技术。二代测序技术是一种高通量的dna测序技术，它可以同时测序多个dna序列，极大地提高了检测效率和准确性。在一碳单位代谢通路相关基因检测中，采用二代测序技术可以快速、精准地测定多个基因的变异情况。这种技术的优势在于可以同时检测多个基因，减少了检测时间和成本，提高了检测效率和准确性。
技术实现思路
1、基于此，本专利技术的目的在于提供一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组、试剂盒和方法，采用本专利技术的引物组，可以同时检测一碳单位代谢通路相关13个基因的30个snp位点。
2、实现上述专利技术目的的技术方案包括如下。
3、本专利技术的第一方面，提供了一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组，包括如表1所示30对引物中的一对或几对。
4、本专利技术的第二方面，提供了一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，包括上述引物组。
5、本专利技术的第三方面，提供了一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，包括以下步骤：以待测外周血样本的dna为模板，利用上述试剂盒进行多重pcr扩增。
6、本专利技术具有以下有益效果：
7、本专利技术通过对一碳单位代谢通路相关13个基因的目标基因区域的设计，筛选优化了一套引物组，利用这套引物组，进行多重pcr扩增，采用多重扩增捕获法构建文库，二代测序平台(illumina)进行上机测序，可以同时快速检测13个一碳单位代谢通路相关基因共30个多态性位点的基因分型。
8、本专利技术的检测方法快速简便，从核酸提取到报告发放仅需3天，整个检测流程可搭配自动化，通量高，成本低，适用于大批量的多基因筛查，为患者的疾病诊断及治疗提供基因意见参考。
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1.一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组，其特征在于，包括：
2.一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组。
3.根据权利要求2所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，其特征在于，所述引物组中，
4.根据权利要求2或3所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括PCR Master Mix、DMSO、和/或接头。
5.一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，包括以下步骤：以待测外周血样本的DNA为模板，利用权利要求2～4任一项所述的试剂盒进行多重PCR扩增。
6.根据权利要求5所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，所述多重PCR扩增中，第一次PCR扩增的反应体系为：PCRMaster Mix 25±2μL、DMSO 4±0.1μL、引物混合物5±0.1μL、DNA模板100ng，加水至50μL；反应程序为：95℃,5min；95℃10s、60℃30
7.根据权利要求6所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，所述引物混合物中，
8.根据权利要求5所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，所述多重PCR扩增中，第二次PCR扩增的反应体系为：PCR Master Mix 25±2μL、第一轮PCR扩增产物22.5±0.5μL、2.5±0.1μM接头2.5±0.1μL，总体积50μL；反应程序为：95℃,10min；95℃30s、65℃90s，10times。
9.根据权利要求5～8任一项所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，还包括测定文库浓度、测序和生物信息学分析的步骤。
10.根据权利要求9所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，所述文库浓度为10～100ng/μL，优选为50～100ng/μL，更优选为100ng/μL。
...【技术特征摘要】
1.一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组，其特征在于，包括：
2.一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的引物组。
3.根据权利要求2所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，其特征在于，所述引物组中，
4.根据权利要求2或3所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括pcr master mix、dmso、和/或接头。
5.一种检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，包括以下步骤：以待测外周血样本的dna为模板，利用权利要求2～4任一项所述的试剂盒进行多重pcr扩增。
6.根据权利要求5所述的检测一碳单位代谢通路相关基因多态性的方法，其特征在于，所述多重pcr扩增中，第一次pcr扩增的反应体系为：pcrmaster mix 25±2μl、dmso 4±0.1μl、引物混合物5±0.1μl、dna模板100ng，加水至...
【专利技术属性】
技术研发人员：李露，郭慈琳，胡昌明，王华文，甘立佳，
申请(专利权)人：广州金域医学检验中心有限公司，
类型：发明
国别省市：
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