【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子标记，具体涉及一种与绵羊体尺性状相关的分子标记及其应用。
技术介绍
1、湖羊是我国特有的白色绵羊，属于羔皮、肉食兼用的粗毛羊，在我国的养羊业当中占有很重要的地位。因其具有生长发育快、繁殖率高等优点而被广为研究。羊体尺参数是衡量羊生长发育的主要指标，成年体尺与体重密切相关，不仅反映家畜的体格大小和体躯结构，而且对家畜的生产性能有很大影响，与其产肉量有显著的相关性(贺小云等.罗平黄山羊体尺性状与屠宰性能相关性分析.安徽农业科学.2021.49(19)：78-81)，因此可作为肉羊遗传选育的评判依据，反映肉羊的繁殖与选育水平和评估其生产性能的潜力。另外，体型优良的家畜具有生产性能好、繁殖率高、发病率低、寿命长等特点，根据体型选育优良品种可有效缩短育种年限(牛金玉.基于三维点云的奶牛体尺测量与体重预测方法研究.[硕士学位论文].2018.陕西:西北农林科技大学)。
2、vav1(vav鸟嘌呤核苷酸交换因子1)基因位于5号染色体，vav1蛋白最著名的功能是作为rho/racgtp酶的gdp/gtp交换因子(gef)，可激活导致肌动蛋白细胞骨架重排和转录改变的通路，该功能由酪氨酸磷酸化严格控制(p.crespo et al.phosphotyrosinedependent activation of rac-1 gdp/gtp exchange by the vav proto-oncogeneproduct,nature 385(6612)(1997)169–172.)。vav1仅在造血系统中表达，在造血系统
3、本专利技术通过对vav1基因进行测序和分析，探讨其不同基因型与绵羊180日龄体尺性状之间的关联，旨在为增加绵羊生长性能的遗传改良方面提供基因素材，加速自主知识产权的较大体型优质肉羊新品种的培育进程。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种与绵羊体尺性状相关的分子标记及其应用。该分子标记是通过扩增绵羊vav1基因的dna序列并测序，获得vav1基因的多态性位点，通过分析该多态性位点不同的基因型与绵羊180日龄体尺相关性，从而建立多态性位点的分子标记的检测方法，并可将该分子标记应用于增强绵羊生长性能选择体尺较大的优势羊群的培育养殖中。
2、为实现上述目的，本专利技术采用以下的技术方案为：
3、一种与绵羊体尺性状相关的分子标记，其核苷酸序列如seq id no.1所示，其中第150bp处的y是c或t，该突变导致分子标记的c/t多态性。
4、如上所述的分子标记在绵羊育种中的应用，育种为用于筛选体尺较大的绵羊，当多态性位点的基因型为ct型的绵羊，其体尺显著大于cc基因型的绵羊；育种过程中，可选择cc与tt基因型亲本进行交配，进而繁殖出ct基因型绵羊用于养殖，有助于扩大养殖效益。
5、一种用于检测上述与绵羊体尺性状相关的分子标记的引物对在绵羊育种中的应用，优选地，用于检测上述与绵羊体尺性状相关的分子标记的引物对序列如seq id no.2所示和seq id no.3所示，。
6、一种用于检测上述与绵羊体尺性状相关的分子标记的aqp引物对在绵羊育种中的应用，优选地，所述aqp引物对的序列如seq id no.4-6所示。
7、一种用于检测上述与绵羊体尺性状相关的分子标记的试剂盒在绵羊育种中的应用，优选地，所述试剂盒包括普通pcr引物对或aqp序列对，普通pcr引物对的核苷酸序列如seq id no.2所示和seq id no.3所示；所述aqp引物对的核苷酸序列如seq id no.4-6所示。
8、一种用于检测上述与绵羊体尺性状相关的分子标记的方法，其包括如下步骤：
9、1)使用上述的普通pcr引物对、aqp引物对或包含上述引物对的试剂盒，对绵羊基因组dna进行扩增；
10、2)对步骤1)获得的扩增产物的多态性位点进行分型鉴定。
11、其中，在步骤2)中，上述分型鉴定的方法包括但不限于直接测序法、荧光探针法、基因芯片法、高分辨率溶解曲线法。
12、进一步，优选地，采用普通pcr引物对进行扩增时，扩增产物采用直接测序法对多态性位点进行鉴定。
13、进一步，优选地，采用aqp引物对进行扩增时，利用c1000 touch thermal cycler仪器检测荧光信号并查看分型结果。
14、如上所述的方法在绵羊体尺性状检测中的应用，通过并分析多态性位点的类型，从而可以确定绵羊体尺的高低，进而筛选出高体尺型的绵羊；当多态性位点的基因型为ct型时，其体尺显著大于cc基因型。
15、如上所述的分子标记pcr引物对、aqp引物或试剂盒的检测方法在绵羊育种中的应用，通过利用上述的引物对或试剂盒对绵羊的基因组dna进行扩增和检测，确定待测样品的分子标记的基因型，从而可以从中选出高体尺型绵羊进行养殖，也可用于选育高体尺型的绵羊。
16、本专利技术的有益效果在于：
17、本专利技术提供了与绵羊体尺性状相关的分子标记及其c/t的多态性位点，通过检测该多态性位点的基因型来有效鉴别是否为能繁殖较大体尺型的绵羊亲本，以及是否为较大体尺型的绵羊，为快速增长型绵羊的筛选提供有效的检测手段。
18、本专利技术通过对分子标记及该多态性位点基因型的检测，选择cc与tt亲本，从而培育出ct基因型绵羊，也可用于选留基因为ct绵羊作为高效益绵羊用于养殖，用以提高绵羊体尺，有助于提高羊养殖业的经济效益。
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1.一种与绵羊体尺性状相关的分子标记，其特征在于，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中第150bp处的Y是C或T，该突变导致分子标记的C/T多态性。
2.权利要求1所述的分子标记在育种中以及选养的应用，其特征在于，育种为用于筛选体尺较大的绵羊，当多态性位点的基因型为CT型的绵羊，其体尺显著大于CC基因型的绵羊。
3.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的引物在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示和SEQ IDNO.3所示。
4.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的AQP引物对在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，所述AQP引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.4-6所示。
5.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的试剂盒在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，所述试剂盒包括普通PCR引物对或AQP序列对，普通PCR引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示和SEQ ID NO.3所示；所述AQP引物的核苷
6.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的方法，其特征在于，其包括如下步骤：
7.如权利要求6所述的方法，其特征在于，采用序列如SEQ ID NO.2所示和SEQ ID NO.3所示的普通PCR引物对进行扩增时，扩增产物采用直接测序法对多态性位点进行鉴定。
8.如权利要求6所述的方法，其特征在于，采用序列如SEQ ID NO.4-6所示的AQP引物对进行扩增时，利用C1000 TouchTM Thermal Cycler仪器检测荧光信号并查看分型结果。
9.权利要求6-8中任一项所述方法在筛选绵羊大体尺性状检测中的应用，其特征在于，当分子标记的多态性位点的基因型为CT型时，其体尺显著高于CC基因型。
10.权利要求6-8中任一项所述方法在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，用于指导选择CC和TT基因型的绵羊亲本进行交配，进而繁殖出CT基因型较大体尺绵羊进行养殖。
...【技术特征摘要】
1.一种与绵羊体尺性状相关的分子标记，其特征在于，其核苷酸序列如seq id no.1所示，其中第150bp处的y是c或t，该突变导致分子标记的c/t多态性。
2.权利要求1所述的分子标记在育种中以及选养的应用，其特征在于，育种为用于筛选体尺较大的绵羊，当多态性位点的基因型为ct型的绵羊，其体尺显著大于cc基因型的绵羊。
3.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的引物在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，所述引物的核苷酸序列如seq id no.2所示和seq idno.3所示。
4.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的aqp引物对在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，所述aqp引物对的核苷酸序列如seq id no.4-6所示。
5.一种用于检测权利要求1所述的与绵羊体尺性状相关的分子标记的试剂盒在绵羊育种以及选养中的应用，其特征在于，所述试剂盒包括普通pcr引物对或aqp序列对，普通pcr引物对的核苷酸序列如seq id no.2所示和...
【专利技术属性】
技术研发人员：王维民，冯炼君，田慧彬，张煜坤，黄凯，徐丹，
申请(专利权)人：兰州大学，
类型：发明
国别省市：
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