【技术实现步骤摘要】
本专利技术公开了一种利用agrn基因启动子区遗传标记检测牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状的方法，尤其涉及一种通过agrn基因启动子区域的snps作为牛肉质和胴体性状分子标记的检测方法，属于选育牛胴体和肉质性状。
技术介绍
1、标记辅助选择（mas）因效率高，且不受环境和其他因素影响而被广泛应用于肉牛早期选育。肉牛分子育种是利用分子生物学技术对肉牛进行遗传改良的一种方法，随着生物技术的快速发展，肉牛分子育种取得了显著的成果。单核苷酸多态性（snps）是遗传多态性研究中最常用的标记形式之一。snp分子标记是一种基于dna变异的遗传标记，其在基因组中广泛分布，具有高通量、低成本、易于自动化等优点。分析snp位点与牛肉品质性状的相关性，可作为肉牛的遗传改良的科学依据和主要技术手段。通过检测肉牛个体基因组中的特定snp位点，可以预测其重要生产性能、抗病力等性状，从而实现对优秀个体的选择和繁殖。与传统选择育种方法相比，分子辅助选择具有更高的准确性和效率，有助于加快肉牛遗传改良的进程。
2、agrn编码集聚蛋白，集聚蛋白是一种硫酸乙酰肝素蛋白多糖，有效参与神经肌肉接头的形成和维持。具体而言，集聚蛋白是突触前结构稳定和突触后膜上乙酰胆碱受体（achrs）精确聚集的关键介质。此外，集聚蛋白还充当复杂的 agrin-lrp4-musk 信号级联的增强剂，后者是突触通讯的关键调节剂。已有研究表明agrn变异与神经和神经肌肉疾病有关，包括先天性肌无力综合征与肌肉减少症等。因此，利用筛查snp的方式探究agrn基因启动子在不同牛体内的遗传多态性，
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种argn基因启动子区标记检测牛胴体和肉质性状的方法，利用argn基因启动子snp作为选育肉牛胴体及肉质性状的方法，为促进牛肉用性能的早期选育工作，并加快建立遗传资源优良的肉牛种群奠定基础。
2、本专利技术提供一种argn基因启动子区分子标记作为牛肉质和胴体性状中的用途，其特征在于：
3、上述基因的分子标记为牛argn基因的启动子区域的g.51463789处a>t突变，即snp1：g.51463789 a>t。
4、本专利技术所述的argn基因snp1作为检测牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状分子标记的方法，包括以下步骤：
5、第一步：采集需要检测的牛的全血或组织样品，利用牛的全血或组织样品完成基因组dna的提取；
6、第二步：根据牛agrn基因序列设计的一对引物如下：
7、agrn-f：５’gacctgacggtgaagatgcta３’；
8、agrn-r：５’gctggacagtgtattctgatgg３’；
9、第三步：以牛基因组dna为模板，使用上一步合成的引物进行pcr扩增获得包含牛argn基因目的片段的pcr产物； pcr扩增体系为20 μl，其中：2×taq pcr master mix 10 μl，上下游引物各0.3 μl，dna样本1.4 μl，ddh2o 8 μl。pcr程序为95℃ 5 min预变性；95℃变性30 s，60℃退火30 s，72℃延伸60 s，共35个循环；最后72℃延伸10 min，4℃保存。
10、第四步：采用dna测序技术对pcr产物进行测序，使用序列分析软件查找测序结果中agrn基因启动子区域snp位点的位置，根据agrn基因的分子标记snp1，对检测的牛群体或个体样品进行基因型分型，即tt基因型、ta基因型或aa基因型，最后根据基因型评估牛的屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状的相关性。
11、本专利技术的积极效果在于：
12、通过对牛agrn基因启动子区域的pcr扩增，结合dna测序的方法，获得并公开牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状相关的agrn基因g.51463789 a>t的1个snp作为分子遗传标记，检测方法快捷有效，可应用于牛肉用性能的早期选育，为进一步加快建立遗传资源优良的肉牛种群奠定基础。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种ARGN基因分子标记在制备牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状检测标记试剂中的用途；
2.以AGRN基因单核苷酸多态性作为牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状分子标记的检测方法，其特征在于根据牛AGRN基因序列设计的一对引物如下：
3.根据权利要求2所述的ARGN基因SNP1作为检测牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状分子标记的方法，包括以下步骤：
【技术特征摘要】
1.一种argn基因分子标记在制备牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状检测标记试剂中的用途；
2.以agrn基因单核苷酸多态性作为牛屠宰率和胴体脂肪覆盖率性状分子标记的检测方法...
【专利技术属性】
技术研发人员：房希碧，杨润军，刘月，卢鑫，穆雅男，
申请(专利权)人：吉林大学，
类型：发明
国别省市：
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