【技术实现步骤摘要】
本申请涉及微生物领域，更具体涉及分离获得的克里斯滕森菌新菌种、包含其的组合物及用途。
技术介绍
1、克里斯滕森菌属(christensenella)是近年来鉴定出的肠道共生细菌，该菌属下的菌种数极其有限，根据在lpsn上的查询仅有6个菌种，且都是近年来发现的。
2、克里斯滕森菌属新菌种的筛选面临很大困难，原因是其主要存在于人或动物肠道中，属于严格厌氧的微生物，对营养及培养环境要求极高，并且生长周期长。另外，在进行药效验证的时候，该菌属的菌因为厌氧而难以通过体外细胞实验进行验证；在动物体内实验过程中，该菌属的菌由于培养困难、厌氧程度高而很难保持稳定的活菌数，且存在重复性不足的问题。这些体内外相关的技术难题均限制了克里斯滕森菌属新菌种的发现及应用。
3、当前肥胖、糖尿病、高血压、高脂血症、脂肪肝等代谢性疾病的患病率不断增加，同时也有研究表明这些疾病与微生物菌群的生态失调有关。在许多人群中，克里斯滕森菌属的某些菌与低体重指数相关。小克里斯滕森氏菌(c.mintua)是克里斯滕森菌属中研究最多的一个菌种，然而同时有报道表明其在治疗肥胖的过程中会导致炎症，如急性阑尾炎。然而，在肥胖治疗的过程中不引发炎症，是一个迫切需求，也是临床减肥药物行政审批的一个重要考量点。
4、现有技术中通常使用多种微生物混合物用于治疗代谢和肥胖相关疾病或障碍，例如益生菌或者肠道菌群移植(fmt)。然而，多种微生物的混合物使得机理更复杂，各微生物之间的相互影响也未有成熟的研究，且微生物混合物的使用会打破肠道菌群的稳态。相比较而言，
5、微生物资源的数量极其庞大，而从中筛选出能够有效用于治疗或预防例如肥胖、糖尿病、高血压、高脂血症、肝肾功能疾病等代谢性疾病的新菌种是一项巨大挑战，但同时也代表着巨大的未满足的需求。
技术实现思路
1、本申请通过基因预测菌株的丁酸通路完整性，来预测其产短链脂肪酸的能力，筛选获得了能够有效治疗或预防代谢性疾病的克里斯滕森菌株。
2、第一方面，本申请提供了分离的克里斯滕森菌(christensenella sp.)，其与保藏编号为gdmcc no：62509的菌株或保藏编号为gdmcc no：61118的菌株的平均核苷酸同一性(ani)值为至少95％，和/或具有与seq id no.1或2所示的序列具有至少98.65％、至少98.7％、至少98.8％、至少98.9％、至少99.0％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％或100％同一性的16s rdna序列。
3、在一些实施方案中，所述克里斯滕森菌是克里斯滕森菌属(christensenella)的一个新菌种，所述新菌种中的菌株与保藏编号为gdmcc no：62509的菌株或保藏编号为gdmcc no：61118的菌株的平均核苷酸同一性(ani)值为至少95％，例如95.1％、95.2％、95.3％、95.4％、95.5％、95.6％、95.7％、95.8％、95.9％、96％、96.1％、96.2％、96.3％、96.4％、96.5％、96.6％、96.7％、96.8％、96.9％、97％、97.1％、97.2％、97.3％、97.4％、97.5％、97.6％、97.7％、97.8％、97.9％、98％、98.1％、98.2％、98.3％、98.4％、98.5％、98.6％、98.7％、98.8％、99％、99.1％、99.2％、99.3％、99.4％、99.5％、99.6％、99.7％、99.8％、99.9％或100％；和/或通过16s rdna比对，该菌种中的菌株的16s rdna序列与seqid no.1或2所示的序列具有至少98％、98.1％、98.2％、98.3％、98.4％、98.5％、98.6％、98.65％、至少98.7％、至少98.8％、至少98.9％、至少99.0％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％或100％同一性。
4、在一些实施方案中，所述克里斯滕森菌的代谢产物包括短链脂肪酸，所述短链脂肪酸包括乙酸、丙酸、丁酸、丁戊酸、戊酸和己酸中的至少一种；优选地，所述克里斯滕森菌能高产丁酸和乙酸；其中，丁酸产量不低于50μg/g和/或乙酸的产量不低于300μg/g；更优选地，所述丁酸产量不低于400μg/g和/或所述乙酸产量不低于2600μg/g。
5、在一些实施方案中，所述克里斯滕森菌为保藏编号为gdmcc no：62509或gdmccno：61118的克里斯滕森菌。
6、第二方面，本申请提供了包含第一方面所述的克里斯滕森菌或其培养物或其代谢产物的组合物。
7、在一些实施方案中，所述克里斯滕森菌的培养物包括克里斯滕森菌的固体培养物，发酵培养物、或者发酵培养物的上清。
8、在一些实施方式中，所述发酵培养物或发酵培养物上清为使用液体培养基在厌氧培养条件下得到的发酵培养物或发酵培养物上清液。
9、在一些实施方案中，其中所述组合物以液态形式或固态形式提供。
10、在一些实施方案中，所述组合物包含1×104至1×1013cfu/ml或1×104至1×1013cfu/g的所述克里斯滕森菌活菌。
11、在一些实施方案中，所述组合物包含1×104至1×1012cfu/ml或1×104至1×1012cfu/g的所述克里斯滕森菌活菌。
12、在一些实施方案中，所述组合物包含1×105至1×1011cfu/ml或1×105至1×1011cfu/g的所述克里斯滕森菌活菌。
13、在一些实施方案中，所述组合物包含1×106至1×1010cfu/ml或1×106至1×1010cfu/g的所述克里斯滕森菌活菌。
14、在一些实施方案中，所述组合物包含1×107至1×109cfu/ml或1×107至1×109cfu/g的所述克里斯滕森菌活菌。
15、在一些实施方案中，每g所述组合物中包含1×103至1×1014个菌落形成单位(cfu)的菌；例如1×104至1×1012个、1×105至1×1011个或者1×106至1×1010个菌落形成单位(cfu)的菌，具体地，例如1×103、2×103、3×103、4×103、5×103、6×103、7×103、8×103、9×103、1×104、2×104、3×104、4×104、5×104、6×104、7×104、8×104、9×104、1×105、2×105、3×105、4×105、5×105、6×105、7×105本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种分离的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)，具有与SEQ ID NO.1或2所示的序列至少98％同一性的16S rDNA序列；和/或所述克里斯滕森菌与保藏编号为GDMCC NO：62509的菌株或保藏编号为GDMCC NO：61118的菌株的平均核苷酸同一性(ANI)值为至少95％。
2.如权利要求1所述的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)，所述克里斯滕森菌(Christensenella sp.)与保藏编号为GDMCC NO：62509的菌株或保藏编号为GDMCC NO：61118的菌株的平均核苷酸同一性(ANI)值为95.1％、95.2％、95.3％、95.4％、95.5％、95.6％、95.7％、95.8％、95.9％、96％、96.1％、96.2％、96.3％、96.4％、96.5％、96.6％、96.7％、96.8％、96.9％、97％、97.1％、97.2％、97.3％、97.4％、97.5％、97.6％、97.7％、97.8％、97.9％、98％、98.1％、98.2％、98.3％、98.4％、98.5％、9
3.如权利要求1所述的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)，所述克里斯滕森菌为保藏编号为GDMCC NO：62509或GDMCC NO：61118的克里斯滕森菌。
4.一种组合物，其包含权利要求1-3任一项所述的克里斯滕森菌(Christensenellasp.)、其培养物或其代谢产物。
5.如权利要求4所述的组合物，所述克里斯滕森菌(Christensenella sp.)为活菌、减毒菌、被杀死的菌、冻干菌或经辐照的菌；和/或
6.如权利要求4所述的组合物，所述的组合物还包含一种或多种药学或营养学上可接受的载体或赋形剂或辅料。
7.如权利要求4所述的组合物，所述组合物还包含用于预防或治疗代谢性疾病的一种或者多种其它活性剂，
8.如权利要求4所述的组合物，所述组合物为药物，保健品或食品。
9.权利要求1-3任一项的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)或权利要求4-8任一项的组合物在制备用于治疗、预防或缓解代谢性疾病或代谢障碍引起的疾病的药物、保健品或食品中的应用。
10.如权利要求9所述的应用，所述代谢性疾病、代谢障碍、或代谢障碍引起的疾病选自：肝脏类疾病、肥胖及肥胖类相关疾病、心血管疾病、糖尿病、血脂异常、心脑血管疾病、葡萄糖不耐受、动脉粥样硬化、冠心病或高血压、I型糖尿病、II型糖尿病、糖耐量受损、胰岛素抵抗、肥胖症、高血糖症、高胰岛素血症、脂肪肝、酒精性脂肪性肝炎、高胆固醇血症、高血压、高脂蛋白血症、高脂血症、高甘油三酯血症、尿毒症、酮症酸中毒、低血糖、血栓性疾病、血脂异常、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、动脉粥样硬化、肾病中的至少一种；
11.如权利要求9所述的应用，所述药物或保健品或食品具有选自如下的至少一种效果：减少肝脏重量；
12.克里斯滕森菌(Christensenella sp.)、其培养物或其代谢产物在制备GLP-1受体激动剂中的应用，所述克里斯滕森菌具有选自如下的一种或者多种特征：
13.克里斯滕森菌(Christensenella sp.)、其培养物或其代谢产物在制备DPP4(DPPIV)抑制剂中的应用，所述克里斯滕森菌具有与SEQ ID NO.3所示的序列至少99％同一性的16S rDNA序列；所述克里斯滕森菌革兰氏染色阴性；
14.权利要求1-3任一项的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)、权利要求4-8任一项的组合物、权利要求12的GLP-1受体激动剂或权利要求13的DPP4抑制剂在制备用于通过调节脂肪组织代谢和/或葡萄糖稳态而增加受试者的能量消耗的组合物中的应用；
15.权利要求1-3任一项的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)、权利要求4-8任一项的组合物、权利要求12的GLP-1受体激动剂或权利要求13的DPP4抑制剂在制备用于促进受试者的体重减轻的组合物中的应用；
16.权利要求1-3任一项的克里斯滕森菌(Christensenella sp.)、权利要求4-8任一项的组合物、权利要求12的GLP-1受体激动剂或权利要求13的DPP4抑制剂在促进受试者的体重减轻中的应用；所述...
【技术特征摘要】
1.一种分离的克里斯滕森菌(christensenella sp.)，具有与seq id no.1或2所示的序列至少98％同一性的16s rdna序列；和/或所述克里斯滕森菌与保藏编号为gdmcc no：62509的菌株或保藏编号为gdmcc no：61118的菌株的平均核苷酸同一性(ani)值为至少95％。
2.如权利要求1所述的克里斯滕森菌(christensenella sp.)，所述克里斯滕森菌(christensenella sp.)与保藏编号为gdmcc no：62509的菌株或保藏编号为gdmcc no：61118的菌株的平均核苷酸同一性(ani)值为95.1％、95.2％、95.3％、95.4％、95.5％、95.6％、95.7％、95.8％、95.9％、96％、96.1％、96.2％、96.3％、96.4％、96.5％、96.6％、96.7％、96.8％、96.9％、97％、97.1％、97.2％、97.3％、97.4％、97.5％、97.6％、97.7％、97.8％、97.9％、98％、98.1％、98.2％、98.3％、98.4％、98.5％、98.6％、98.7％、98.8％、99％、99.1％、99.2％、99.3％、99.4％、99.5％、99.6％、99.7％、99.8％、99.9％或100％；和/或
3.如权利要求1所述的克里斯滕森菌(christensenella sp.)，所述克里斯滕森菌为保藏编号为gdmcc no：62509或gdmcc no：61118的克里斯滕森菌。
4.一种组合物，其包含权利要求1-3任一项所述的克里斯滕森菌(christensenellasp.)、其培养物或其代谢产物。
5.如权利要求4所述的组合物，所述克里斯滕森菌(christensenella sp.)为活菌、减毒菌、被杀死的菌、冻干菌或经辐照的菌；和/或
6.如权利要求4所述的组合物，所述的组合物还包含一种或多种药学或营养学上可接受的载体或赋形剂或辅料。
7.如权利要求4所述的组合物，所述组合物还包含用于预防或治疗代谢性疾病的一种或者多种其它活性剂，
8.如权利要求4所述的组合物，所述组合物为药物，保健品或食品。
9.权利要求1-3任一项的克里斯滕森菌(christensenella sp.)或权利要求4-8任一项的组合物在制备用于治疗、预防或缓解代谢性疾病或代谢障碍引起的疾病的药物、保健品或食品中的应用。
10.如权利要求9所述的应用，所述代谢性疾病、代谢障碍、或代谢障碍引起的疾病选自：肝脏类疾病、肥胖及肥胖类相关疾病、心血管疾病、糖尿病、血脂异常、...
【专利技术属性】
技术研发人员：黄宝家，孔萍，贤一博，
申请(专利权)人：慕恩广州生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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