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1号染色体上与奶牛乳蛋白率性状相关的分子标记及其应用制造技术

技术编号:42708713 阅读:14 留言:0更新日期:2024-09-13 12:01
本发明专利技术提供了奶牛1号染色体上与乳蛋白率性状相关的分子标记位点,所述分子标记的位点为奶牛1号染色体上第141715729C>T的SNPs突变。本发明专利技术通过优选上述标记的优势等位基因,能够逐代增加优势等位基因频率,提高奶牛的乳蛋白率,加快奶牛遗传改良进程,从而有效提高奶牛育种的经济效益。

【技术实现步骤摘要】


技术介绍

1、牛奶对人类有着极高的营养价值,在我国畜牧业发展中占有重要地位,近年来,牛奶质量已成为全世界消费者都共同关注的热门话题之一,越来越多的高端乳制品备受消费者的青睐。牛奶的品质与其主要的物质组成密不可分,其中乳蛋白率是衡量牛奶中蛋白质含量的一项指标,对牛奶的品质有直接关系。乳蛋白的含量和组成影响乳制品的质地、凝固性能和风味,例如在生产奶酪、酸奶等产品时,高蛋白牛奶能提高产品的稠度和口感。不同类型的乳制品加工对乳蛋白的需求不同,高蛋白牛奶更适合制作某些特定乳制品,而较低蛋白的牛奶可能在其他应用中更为合适。乳蛋白是人体必需氨基酸的优质来源,对成长、免疫功能至关重要,尤其对儿童发育、维持成人健康同样重要。因此,高乳蛋白奶牛产奶的市场需求高,利于满足特定营养强化乳品制造,提升市场竞争力。

2、奶牛产奶受很多因素影响,但更为根本的因素是遗传因素,遗传优势可以世代相传。想要获得遗传进展,就要选择优秀奶牛进行育种。常规育种策略中主要包括品种登记、dhi测定、后裔测定等,但这种方法有着其局限性,如世代间隔长、进展慢等,不能满足奶业发展需求。20世纪八十年以来,随着数学理论和计算机的普及,数量遗传学得到了迅速发展,并逐步建立了数量性状遗传的分子基础,由于数量性状的分子理论与分子遗传学交叉极多,使得两门学科融合形成了一门新的交叉学科,即分子数量遗传学,这也使得动物育种从常规育种开始向分子育种过渡,值得注意的是,这并不意味着常规育种失去作用和意义,品种登记、dhi测定这些都是实施分子育种的基本前提与基础。分子育种主要包括转基因育种和标记辅助选择育种(mas,即marker-assisted selection),针对奶牛乳蛋白率的育种,应用更广泛的是mas育种。近年来,在奶牛育种中应用较为广泛的标记辅助选择育种是基因组选择(gs,即genomic selection),因为它的核心与mas育种一致,都是通过对遗传标记进行选择来实现对性状的间接选择,所以被认为是mas育种的一种,不同的地方是gs育种中的遗传标记密度更高,一般以高密度覆盖全基因组范围,以方便开展育种值估计工作。通过计算得到的基因组育种值是一个估计值,并不是真实值,估计值的准确性与多种因素相关,如表型记录的多少、模型的选择、先验分布的设定等,有研究表明将与复杂性状相关的遗传效应较大的功能基因或标记整合加入信息后,会提高基因组选择的准确性。因此,挖掘并验证与奶牛乳蛋白率相关的新遗传标记,是奶牛遗传改良中的需要解决的重要问题。


技术实现思路

1、针对现有技术存在的问题,本专利技术提供通过基因分型和相关性分析策略鉴别到的与奶牛乳蛋白率显著相关的分子标记,将其用于分子标记辅助选择和基因组选择中,选择有利的基因型进行留种,从而逐代提高优势等位基因的基因频率,则能加快种奶牛遗传育种改良的进程,为地方奶牛养殖带来巨大经济效益。

2、首要目的在于确定影响奶牛乳蛋白率的snps分子标记。所述分子标记位于奶牛基因组参考序列1号染色体(nc_037328.1)上。

3、所述的分子标记的snp位点对应于奶牛ars-ucd1.2基因组1号染色体(nc_037328.1)上第141715729c>t突变。

4、所述分子标记1:g.141715729c>t位于如下序列(seq id no.4)中:

5、5’-cttctgttctgtaacctgctgtgtcccccagggtgacagtggaggtcctctggtcacactgaagagcagt gtctggtggctgattggagacacgagctgggggtcaggctgtgccaaggcgtaccgaccgggagtgtacgggaacgtga cagtgttcacagactggatctatcaacaaatgagggtaacctttccatcctcctgatcggctccccacttcactgtgtc agagcctggggg[c/t]ctaggaggtgtggtcctgtgacaggtcgcacccctccccatatgcgtttggatgaaaacttc tgggtcccagctttgcagggtccagggttacctgtgatgggcttgcttctggctctaatagctccattcacctactcag atgtcattgcatcaaacttctggggatgggcagaaagcagagcgaggctgccaggcatgattcaggcctatccttctct gggctgtcacaggcacccaggggagcagctggggtctctggtacaaggagagggcatgagaagggaa-3’

6、所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示,snp位于seq id no.1自5’端起第241位。

7、本专利技术的另一目的在于提供检测上述分子标记的引物和探针组,其特征在于,所述141715729c>t引物和探针组的碱基序列如下:

8、seq id no.1:acgttggatgcacttcactgtgtcagagcc

9、seq id no.2:acgttggatggggacccagaagttttcatc

10、seq id no.3:ggaccacacctcctag

11、本专利技术的另一目的在于提供检测上述分子标记的试剂盒,所述试剂盒包含前述引物和探针组。

12、本专利技术的另一目的在于提供上述的分子标记在筛选优良乳蛋白率的奶牛个体中的应用。具体为,检测奶牛基因组ars-ucd1.2基因组1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点的基因型,淘汰奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点为tc型的个体,以淘汰劣势基因型。

13、在另一个优选实施例中,分别保留奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点为cc或tt型的个体。

14、在另一个优选实施例中,分别保留奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点为cc型的个体。

15、在另一个优选实施例中,分别保留奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点为tt型的个体。

16、本专利技术的另一目的在于提供一种上述kasp引物和探针组或检测试剂盒在鉴定与奶牛乳蛋白率性状相关的位点基因型中的应用。具体为,利用上述引物和探针组或试剂盒检测奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点的基因型,淘汰上述点为杂合tc型的个体,以淘汰劣势基因型。

17、在一个优选实施例中,分别保留奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点为纯合cc型或纯合tt型的个体。

18、在另一个优选实施例中,分别保留奶牛1号染色体(nc_037328.1)上第141715729位点为cc型的个体。

19、在另一个优选本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.与奶牛乳蛋白率性状相关的分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,SNP位于SEQ ID NO.1自5’端起第241位,对应于牛基因组ARS-UCD1.2基因组1号染色体NC_037328.1上第141715729C>T突变。

2.用于检测权利要求1所述的分子标记的引物和探针组,其特征在于,141715729C>T所述引物和探针组的碱基序列如下:

3.用于检测权利要求1所述的分子标记的试剂盒。

4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,试剂盒包含权利要求2所述的引物。

5.一种改良奶牛乳蛋白率的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:检测奶牛基因组ARS-UCD1.2基因组1号染色体(NC_037328.1)上第141715729位点的基因型,淘汰位点为纯合TC基因型的个体。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述检测奶牛的奶牛基因组ARS-UCD1.2基因组1号染色体(NC_037328.1)上第141715729位点基因型的方法包括以下步骤:

>7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述奶牛群体包括中国荷斯坦奶牛及其合成系。

8.权利要求1所述的分子标记在改良奶牛乳蛋白率中的应用。

9.权利要求2所述的引物和探针组或权利要求3所述的试剂盒在改良奶牛乳蛋白率中的应用。

...

【技术特征摘要】

1.与奶牛乳蛋白率性状相关的分子标记,其特征在于,所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示,snp位于seq id no.1自5’端起第241位,对应于牛基因组ars-ucd1.2基因组1号染色体nc_037328.1上第141715729c>t突变。

2.用于检测权利要求1所述的分子标记的引物和探针组,其特征在于,141715729c>t所述引物和探针组的碱基序列如下:

3.用于检测权利要求1所述的分子标记的试剂盒。

4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,试剂盒包含权利要求2所述的引物。

5.一种改良奶牛乳蛋白率的方法,其特征在于,所...

【专利技术属性】
技术研发人员:张娟韩丽云张国俊刘维平陈亚飞杨俊杰徐军冯小芳田佳顾亚玲王雅春马丽娜马若霜杨丽娟田进理伍昌
申请(专利权)人:宁夏大学
类型:发明
国别省市:

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