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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学,具体涉及一种肝细胞癌bclc b期患者手术治疗预后风险评估模型构建及应用。
技术介绍
1、原发性肝癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,为第六大最常见癌症,也是癌症死亡的第三大原因。肝细胞癌患者占原发性肝癌患者总人数的75%-85%。目前国际上应用最广泛的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,hcc)分期系统是巴塞罗那临床肝癌分期系统(barcelona clinic liver cancer,bclc)。该分期系统将患者分为0、a、b、c、d五个疾病阶段。其中针对0-a期hcc患者推荐主要治疗方法为根治性肝切除术、消融术和肝移植术;对于b期患者推荐治疗方法有肝移植术、肝动脉化疗栓塞术(transarterialchemoembolization,tace)和系统性治疗。然而由于bclc b期患者具有显著异质性,部分患者也能够通过肝切除术治疗获益,临床对这部分病人的治疗方法尤其对能否进行肝切除术的治疗存在争议。因此,迫切需要可靠的策略在bclc b期患者中筛选出肝切除术治疗后预后相对较好的人群。
2、已有很多研究基于蛋白质组学数据开发可预测疾病预后的分子标志物。血液是更容易被检测的微创样本,汇聚了所有组织生理病理学过程产生和交换的分子物质。此外,血液样本还可用于术前研究。因此,急需一种基于血液蛋白标志物的手术治疗预后风险评估模型,用于在术前判断肝癌bclc b期患者肝切除术后的预后情况,为病人的治疗决策提出依据。
技术实现思路
2、为了解决上述技术问题,本专利技术首先提供了一种计算机装置,包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序,所述处理器可执行所述计算机程序以实现如下步骤:
3、s1)数据接收:接收肝细胞癌受试患者和肝细胞癌患者群体构成的总患者群体中每个患者血清中lcp1、dok3和cnn2这三种蛋白的表达量;将所述三种蛋白的表达量分别在所述总患者群体中进行z-score处理,得到总患者群体中每个患者的所述三种蛋白的z-score值;分别提取所述总患者群体中所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的z-score值,得到所述三种蛋白的相对表达量;
4、s2)数据处理:将所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的相对表达量代入预后风险预测模型计算获得所述肝细胞癌受试患者手术治疗预后的风险评分值;所述手术治疗预后风险预测模型为如下式1:
5、风险评分=lcp1蛋白相对表达量×0.597+dok3蛋白相对表达量×(-0.667)+cnn2蛋白相对表达量×(-0.183)式1;
6、s3)数据输出:根据所述风险评分值输出肝细胞癌受试患者的手术治疗预后风险或手术前分层结果。
7、上述计算机装置中,所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者可为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为b的患者。
8、为了解决上述技术问题,本专利技术还提供了预测或辅助预测肝细胞癌患者手术治疗预后或手术前分层的装置,所述装置可包括如下模块:
9、a1)数据接收模块:用于接收肝细胞癌受试患者和肝细胞癌患者群体构成的总患者群体中每个患者血清中lcp1、dok3和cnn2这三种蛋白的表达量;将所述三种蛋白的表达量分别在所述总患者群体中进行z-score处理,得到总患者群体中每个患者的所述三种蛋白的z-score值;分别提取所述总患者群体中所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的z-score值,得到所述三种蛋白的相对表达量;
10、a2)数据处理模块:用于将所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的相对表达量代入预后风险预测模型计算获得所述肝细胞癌受试患者手术治疗预后的风险评分值;所述手术治疗预后风险预测模型为如下式1:
11、风险评分=lcp1蛋白相对表达量×0.597+dok3蛋白相对表达量×(-0.667)+cnn2蛋白相对表达量×(-0.183)式1;
12、a3)数据输出模块:用于根据所述风险评分值输出肝细胞癌受试患者的手术治疗预后风险或手术前分层结果。
13、上述装置中,所述风险评分值大于-0.072的肝细胞癌受试患者的预后(术后复发或死亡)风险可大于所述风险评分值小于等于-0.072的肝细胞癌受试患者。上文所述手术可为肝切除手术。
14、为了解决上述技术问题,本专利技术还提供了预测肝细胞癌患者是否受益于手术治疗的装置,所述装置可包括如下模块:
15、b1)数据接收模块:用于接收肝细胞癌受试患者和肝细胞癌患者群体构成的总患者群体中每个患者血清中lcp1、dok3和cnn2这三种蛋白的表达量;将所述三种蛋白的表达量分别在所述总患者群体中进行z-score处理,得到总患者群体中每个患者的所述三种蛋白的z-score值;分别提取所述总患者群体中所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的z-score值,得到所述三种蛋白的相对表达量;
16、b2)数据处理模块:用于将所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的相对表达量代入预后风险预测模型计算获得所述肝细胞癌受试患者手术治疗预后的风险评分值;所述手术治疗预后风险预测模型为如下式1:
17、风险评分=lcp1蛋白相对表达量×0.597+dok3蛋白相对表达量×
18、(-0.667)+cnn2蛋白相对表达量×(-0.183)式1;
19、b3)数据输出模块:用于根据所述风险评分值输出肝细胞癌受试患者是否受益于手术治疗。
20、上述装置中,所述风险评分值小于等于-0.072的肝细胞癌受试患者可受益于手术治疗。
21、上文所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者可为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为b的患者。
22、为了解决上述技术问题,本专利技术还提供了存储有计算机程序的计算机可读存储介质,所述计算机程序可使计算机执行如下步骤:
23、c1)数据接收:接收肝细胞癌受试患者和肝细胞癌患者群体构成的总患者群体中每个患者血清中lcp1、dok3和cnn2这三种蛋白的表达量;将所述三种蛋白的表达量分别在所述总患者群体中进行z-score处理,得到总患者群体中每个患者的所述三种蛋白的z-score值;分别提取所述总患者群体中所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的z-score值,得到所述三种蛋白的相对表达量;
24、c2)数据处理:将所述肝细胞癌受试患者的所述三种蛋白的相对表达量代入预后风险预测模型计算获得所述肝细胞癌受试患者手术治疗预后的风险评分值;所述手术治疗预后风险预测模型为如下式1:
25、风险评分=lcp1蛋白相对表达量×0.597+dok3蛋白相对表达量×
26、(-0.66本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种计算机装置,包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序以实现如下步骤:
2.根据权利要求1所述的计算机装置,其特征在于:所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为B的患者。
3.预测或辅助预测肝细胞癌患者手术治疗预后或手术前分层的装置,所述装置包括如下模块:
4.预测肝细胞癌患者是否受益于手术治疗的装置,所述装置包括如下模块:
5.根据权利要求3或4所述的装置,其特征在于:所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为B的患者。
6.存储有计算机程序的计算机可读存储介质,所述计算机程序使计算机执行如下步骤:
7.一种计算机程序产品,包括计算机程序,其特征在于,该计算机程序被处理器执行时实现实现如下步骤:
8.根据权利要求7所述的计算程序产品,其特征在于:所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为B的患者。
9.蛋白质和/或检测所述
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于:所述物质为试剂和/或仪器;所述肝细胞癌患者为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为B的患者。
...【技术特征摘要】
1.一种计算机装置,包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序以实现如下步骤:
2.根据权利要求1所述的计算机装置,其特征在于:所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为b的患者。
3.预测或辅助预测肝细胞癌患者手术治疗预后或手术前分层的装置,所述装置包括如下模块:
4.预测肝细胞癌患者是否受益于手术治疗的装置,所述装置包括如下模块:
5.根据权利要求3或4所述的装置,其特征在于:所述肝细胞癌患者和/或所述肝细胞癌受试患者为使用巴塞罗那临床肝癌分期系统分期为b的患者。
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【专利技术属性】
技术研发人员:任亮亮,王金花,李俊庆,姜颖,魏汉东,
申请(专利权)人:中国人民解放军军事科学院军事医学研究院,
类型:发明
国别省市:
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