【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物基因工程，特别是涉及一种与宁都黄鸡肉色性状相关的indel标记及其应用。
技术介绍
1、我国的养鸡业发展迅速，是世界上生产和销售大国，随着居民收入水平的不断提高，对鸡肉品质的要求和需求激增，优质肉鸡市场前景巨大，肉色作为评价肉品质最直观的感官特征，已成为影响消费者购买的主要因素之一，因此，在选育种及养殖生产过程中，筛选出与动物肉色形成相关的候选基因或分子标记，对于改善畜禽肉制品的质量，提高畜禽肉制品的经济效益具有十分重要的意义。
2、肉色是反映肌肉生理、生化和微生物学变化的综合指标，其主要决定于肌肉中肌红蛋白(mb)的含量，也受外界光照的影响。肉色是评定肉品质的重要评判指标。肉色的深浅及均匀度最终是由肌肉色素含量、分布及其化学状态决定。肌肉中的色素主要由肌红蛋白(mb)和血红蛋白(hb)以及微量有色代谢物组成。肌红蛋白是肌肉色素的基本成分，约占总色素量的67％，肌红蛋白的3种存在形式即还原型肌红蛋白(紫红)、氧合肌红蛋白(鲜红)、高铁肌红蛋白(褐色)赋予肌肉不同的色调，所以肌红蛋白的状态对肉色有很大的影响。不同物种，肌肉中mb的含量不同，鲜猪肉中的mb含量为0.20％～0.60％，家禽肉中mb含量为0.02％～0.18％(吴信法，1984)。
3、caspase 3是caspase家族中最主要的执行蛋白酶之一，可由内在(线粒体)和外在(死亡配体)途径激活，通过降解底物诱导细胞凋亡。宁都黄鸡具有肉质鲜嫩、风味独特、营养价值高等特点。鸡肉品质受剪切力、肉色、ph值等多种因素影响，其直接影响鸡
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种与宁都黄鸡肉色性状相关的indel标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，本专利技术以caspase 3基因3’utr区域的indel标记为候选标记，检测该indel在地方鸡种宁都黄公鸡中的多态性并分析其与肉色红度值(a值)的关系，并利用这种关系和方法作为肉色性状优良的宁都黄鸡品种选育和标记的手段，为宁都黄鸡的育种及遗传资源保护与利用提供参考依据。
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供一种与宁都黄鸡肉色性状相关的indel标记，所述indel标记位于caspase 3基因3’utr区，其核苷酸序列如seq id no：1所示。
4、进一步地，所述indel标记为一段插入片段，大小为141bp，位于如seq id no：1所示核苷酸序列的第107-247bp处。
5、本专利技术还提供一种检测上述indel标记的引物组，所述引物组的核苷酸序列如seqid no：2-3所示。
6、本专利技术还提供一种含有上述引物组的试剂盒。
7、本专利技术还提供一种检测宁都黄鸡肉色性状的方法，以待测鸡的基因组dna为模板，利用上述引物组或上述试剂盒进行pcr扩增，检测待测鸡在上述indel标记处基因型，根据基因型判断宁都黄鸡肉色性状。
8、进一步地，若基因型显示一条链有indel标记或两条链均有indel标记，则60日龄宁都黄鸡肉色性状好；若基因型显示两条链均没有indel标记或两条链均有indel标记，则107日龄宁都黄鸡肉色性状好。
9、进一步地，所述肉色性状为肉色红度值性状。
10、本专利技术还提供上述indel标记或上述的引物组或上述的试剂盒在检测宁都黄鸡肉色性状中的应用。
11、本专利技术还提供上述indel标记或上述的引物组或上述的试剂盒在宁都黄鸡育种中的应用。
12、本专利技术还提供上述indel标记在检测宁都黄鸡肉色性状相关性中的应用，所述应用具体为通过所述indel标记为候选标记，分析其基因型与肉色性状的关系，从而对宁都黄鸡品种进行选育。
13、本专利技术公开了以下技术效果：
14、本专利技术以caspase 3基因3’utr区域的indel标记为候选标记，检测该indel在地方鸡种宁都黄公鸡中的多态性并分析其与肉色红度值(a值)的关系，并利用这种关系和方法作为肉色性状优良的宁都黄鸡品种选育和标记的手段。可见，本专利技术为宁都黄鸡的育种及遗传资源保护与利用提供参考依据。
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1.一种与宁都黄鸡肉色性状相关的InDel标记，其特征在于，所述InDel标记位于Caspase3基因3’UTR区，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。
2.根据权利要求1所述的InDel标记，其特征在于，所述InDel标记为一段插入片段，大小为141bp，位于如SEQ ID NO：1所示核苷酸序列的第107-247bp处。
3.一种检测权利要求1或2所述InDel标记的引物组，其特征在于，所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO：2-3所示。
4.一种含有权利要求3所述引物组的试剂盒。
5.一种检测宁都黄鸡肉色性状的方法，其特征在于，
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，若基因型显示一条链有InDel标记或两条链均有InDel标记，则60日龄宁都黄鸡肉色性状好；若基因型显示两条链均没有InDel标记或两条链均有InDel标记，则107日龄宁都黄鸡肉色性状好。
7.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述肉色性状为肉色红度值性状。
8.如权利要求1所述InDel标记或权利要求3所述
9.如权利要求1所述InDel标记或权利要求3所述的引物组或权利要求4所述的试剂盒在宁都黄鸡育种中的应用。
10.如权利要求1或2所述InDel标记在检测宁都黄鸡肉色性状相关性中的应用，其特征在于，所述应用具体为通过所述InDel标记为候选标记，分析其基因型与肉色性状的关系，从而对宁都黄鸡品种进行选育。
...【技术特征摘要】
1.一种与宁都黄鸡肉色性状相关的indel标记，其特征在于，所述indel标记位于caspase3基因3’utr区，其核苷酸序列如seq id no：1所示。
2.根据权利要求1所述的indel标记，其特征在于，所述indel标记为一段插入片段，大小为141bp，位于如seq id no：1所示核苷酸序列的第107-247bp处。
3.一种检测权利要求1或2所述indel标记的引物组，其特征在于，所述引物组的核苷酸序列如seq id no：2-3所示。
4.一种含有权利要求3所述引物组的试剂盒。
5.一种检测宁都黄鸡肉色性状的方法，其特征在于，
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，若基因型显示一条链有indel标记或两条...
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