System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种用于环状RNA光电化学比色检测的生化传感体系制造技术_技高网

一种用于环状RNA光电化学比色检测的生化传感体系制造技术

技术编号:42662406 阅读:2 留言:0更新日期:2024-09-10 12:19
本发明专利技术公开了一种基于催化发夹组装循环反应和G四联体‑血红素DNA酶形成反应的生化传感体系,用于环状RNA(circRNA)的光电化学比色检测。核酸探针H1与纳米磁珠(MNPs)结合后对circRNA特异性识别,形成MNPs/H1/circRNA复合物;再与探针H2反应形成MNPs/H1/H2复合物;利用限制性核酸内切酶切割,H1和H2探针被释放出一部分序列,未释放的序列与hemin结合,形成具有类过氧化物酶活性的G四联体‑血红素DNA酶;通过级联催化反应,反应体系的溶液颜色发生变化,拟合溶液吸光度与其中circRNA浓度的线性关系,开发出对circRNA进行光电化学比色检测的有效方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及环状rna光电化学检测和生化传感体系的制备,具体涉及一种基于催化发夹组装循环反应和g四联体-血红素dna酶形成反应的生化传感体系的制备方法,该生化传感体系用于环状rna的光电化学比色检测。


技术介绍

1、环状rna(circularrna缩写为circrna)是一类不具有5’末端帽子和3’末端poly(a)尾巴,并以共价键连接形成环形结构的非编码rna分子。circrna含有mirna应答元件,可充当竞争性内源rna,与mirna结合,在细胞中起到mirna海绵的作用,进而解除mirna对其靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达水平。作为具有闭合环状结构的一类特殊的非编码rna分子,circrna具备环状结构、无poly(a)尾巴和非编码rna的三个显著特征,相比于线性mirna分子,circrna的生物稳定性更高。circrna是单链共价的闭合型rna分子,在从病毒到哺乳动物的物种中无处不在。大部分的circrna由外显子环化而成,而少部分是由内含子环化而形成了套索结构。

2、circrna主要存在于细胞质中,也有一些储存于外泌体内,这种分布使circrna能在细胞质中发挥重要的生物学功能,也可通过外泌体在细胞间进行传递。circrna的序列与其同源异构体-线性rna的序列几乎重叠,由于其独特的共价闭合环状结构和反向剪接位点(back-splice junction缩写为bsj)的存在,circrna和同源异构体-线性rna在细胞内的功能和稳定性上均存在显著的差异。特别是共价闭合环状结构赋予了circrna不易受到rna外切酶降解的生物学特性,因此,circrna能在细胞内持续存在并发挥功能。circrna通过充当转录调节剂、mirna海绵和蛋白质模板来发挥其生物学功能。

3、circrna具有独特的表达特征,并在各种疾病中发挥关键作用,使其能够潜在地作为诊断生物标志物和治疗靶点。circrna通过参与基因的转录与翻译调控,在细胞增殖、凋亡、衰老等多种生命活动中发挥着重要作用。同时,circrna在心血管病、肝癌、乳腺癌等疾病中的特异性表达,使其成为潜在的生物标志物。比较常见的circrna检测方法主要包括实时荧光定量pcr(qrt-pcr)法定量验证,以及印迹杂交分析(northernblotting)、测序与比对等。例如,刘敬欣等开发了一种基于微流控技术检测环状rna的方法(刘敬欣;贺世亮;温建城.国家专利技术专利申请公布号:cn117587103a),王珊珊等设计了一种基于毛细管凝胶电泳的环状rna检测方法(王珊珊;董佳;曹金平;王番.国家专利技术专利申请公布号:cn117538404a),朱立博等公开了一种基于纳米孔的环状rna疫苗纯度的定量快速检测方法(朱立博;谭生伟;杨海平;高兵;谭政.国家专利技术专利申请公布号:cn117517427a),廖迅等提供了一种基于crispr-cas13a系统的可视化环状rna快速检测试剂盒及其应用(廖迅;彭勇.国家专利技术专利申请公布号:cn115948405a)。

4、尽管qrt-pcr的准确性较高且检测时间短,但是其准确性可能受到多种因素的影响,尤其是引物的设计需要非常精确才能避免扩增线性rna。印迹杂交分析对于低丰度的circrna不够敏感,且分析过程耗时较长,不利于快速检测和分析。在当前分析检测技术的背景下,亟需开发出一种能够检出低丰度,且灵敏度高和操作简单的用于circrna高效检测的生化传感体系。基于此,本专利技术开发了一种基于催化发夹组装循环反应(catalytichairpin assembly缩写为cha)和g四联体-血红素dna酶(g-quadruplex-hemin dnazyme)形成反应的生化传感体系及其制备方法,该生化传感体系用于环状rna的光电化学比色检测。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于克服现有技术的不足,提供一种基于催化发夹组装循环反应和g四联体-血红素dna酶形成反应的生化传感体系的制备方法,该生化传感体系用于针对环状rna的高选择性、高灵敏度和简单快速的光电化学比色检测。

2、为实现上述目的,本专利技术涉及的一种用于环状rna光电化学比色检测的生化传感体系,具备如下显著特征:

3、(1)利用特定的探针,通过催化发夹组装循环反应(cha)对环状rna(circrna)进行特异性识别;利用限制性核酸内切酶切割cha的产物,然后再与血红素(hemin)结合形成g四联体-血红素dna酶(g-quadruplex-hemin dnazyme),实现信号的放大;最后通过比色方法检测,实现了对circrna的定量测定。

4、(2)连接在纳米磁珠(mnps)表面的探针本体是对circrna反向剪接位点(bsj)序列具有特异性识别功能的特定核酸探针即h1,其核酸序列为5’-cac aag cct ccc ttt tgtttt tct gaa att gagagt cagaaa aacaaa agg gcc gggagg gatggg tt-3’,探针h1采用3’-端氨基化处理后与羧基化的mnps组成探针mnps/h1;游离探针h2,其核酸序列为5’-gtttttctgact ctcaatttcagaaaaacaaaa ggg gaaattgagagtc-3’,在目标检测物circrna存在的条件下,游离探针h2与mnps/h1发生特异性识别作用,进而形成mnps/h1/h2复合体系。

5、(3)探针mnps/h1的制备:mnps与偶联剂1-(3-二甲基氨丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(edc)和n-羟基琥珀酰亚胺(nhs)混合,完成mnps表面羧基的活化后与h1混合,过夜孵育,制备得到探针mnps/h1。

6、(4)cha的反应条件:按1:1:1:1的体积比依次量取探针mnps/h1、目标检测物circrna、h2分散液和磷酸盐缓冲液(pbs)缓冲液,均匀混合后在37℃下反应,通过磁分离处理混合体系得到cha反应产物;该产物具备如下特征,即探针mnps/h1与circrna的bsj序列通过碱基互补配对结合后形成mnps/h1/bsj复合物,探针h1的发夹结构因此被打开,探针h2与探针h1的识别位点暴露,二者相互结合,进而释放出circrna,形成cha反应产物与mnps/h1/h2的复合物。

7、(5)g-quadruplex-hemin dnazym的形成反应:在限制性核酸内切酶的作用下,mnps/h1/h2复合物中的探针h1和h2的部分序列被释放出来,而探针h1靠近3’端的序列依然保留在mnps上,随后与hemin溶液结合,形成具有类过氧化物酶活性的g-quadruplex-hemindnazyme结构。

8、(6)circrna的测定:将表面结合了一定量g-quadruplex-hemin dnazyme的mnps与3,3',5,5'-四甲基联苯胺(tmb)和过氧化氢(h2o2)混合,加入目标检测物circrna后进行反应;基于所形本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于环状RNA光电化学比色检测的生化传感体系,具备如下显著特征:

【技术特征摘要】

1.一种用于环状rna光电化学比色检...

【专利技术属性】
技术研发人员:徐庆国李春涵戴德淑曹喜玥夏建飞李欣蔚徐显朕
申请(专利权)人:青岛大学附属医院
类型:发明
国别省市:

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