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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及植物分子生物学领域,特别涉及桂花花瓣开放与衰老过程中lncrna内参基因及其引物的应用。
技术介绍
1、桂花(osmanthus fragrans)作为一种具有浓郁芳香的植物,长久以来在园艺、食品及药用领域备受青睐。其花朵的开放和衰老过程是一个深奥而复杂的生物学现象。近年来,长链非编码rna(lncrna)作为一种重要的调控因子逐渐引起了研究者的关注。lncrna是一类长度超过200个核苷酸的rna分子,尽管它们不编码蛋白质,但在基因表达调控、细胞信号传导以及染色质修饰等生物学过程中扮演着关键的角色。
2、在花瓣开放与衰老过程中,研究表明lncrna参与调控多种关键基因的表达,进而影响细胞的生长、分化和凋亡等生理过程。为了深入了解桂花花瓣的生长发育状态和抗衰老机制,需要使用qrt-pcr技术来分析和验证基因的表达水平。在这一过程中,确保内参的稳定性和可靠性尤为重要。然而,对于桂花中lncrna的研究,目前尚缺乏合适的内参基因。
3、通过筛选出适用于该过程的lncrna作为内参基因,可以更准确地评估桂花花瓣的生物学状态,为进一步研究提供可靠的基础。这一工作不仅有助于揭示桂花花瓣开放和衰老的分子机制,还为桂花的栽培、开发新品种以及药用价值的挖掘提供了理论支持和实践指导。
技术实现思路
1、针对现有技术存在的上述问题,本专利技术的目的在于获得桂花花瓣开放与衰老过程中稳定表达的lncrna内参基因,该内参能够满足qrt-pcr检测桂花转录表达水平的要求
2、为了解决上述技术问题,本专利技术所采用的技术方案如下:
3、lnc00229717和ran1作为lncrna内参基因在桂花荧光定量分析中的应用,所述lnc00229717的核苷酸序列如seq id no.1所示,ran1的核苷酸序列如seq id no.2所示。
4、进一步的,本专利技术提供用于检测所述lncrna内参基因的引物,
5、lnc00229717的引物序列为:
6、正向引物:5’-cttagccgcccatccca-3’;
7、反向引物:5’-cacccgcattatccgttga-3’。
8、ran1的引物序列为:
9、正向引物:5’-agaaccgacaggtgaaggcaa-3’;
10、反向引物:5’-tggcaaggtacagaaagggct-3’。
11、进一步的,本专利技术涉及所述引物在桂花荧光定量分析中的应用。
12、进一步的,所述的应用包括:在桂花不同发育时期的花瓣间分析时,采用lnc00229717和ran1作为lncrna内参基因。
13、进一步的,所述不同发育时期包括桂花花瓣的开放和衰老过程。
14、进一步的,所述不同发育时期包括:灵梗期、初花期、盛花期、盛花后期和脱落期。
15、进一步的,所述应用包括以下步骤:
16、以桂花的cdna为模板,以lnc00229717和ran1作为内参基因,并利用所述的引物进行qrt-pcr检测。
17、与现有技术相比,本专利技术的有益效果是:
18、本专利技术通过文献资料查阅和数据库搜索,最终选取10个表达量较为丰富且稳定的lncrnas及7个常用内参基因作为候选内参,筛选或设计了内参的引物序列。通过5种算法(delta-ct、genorm、normfinder、bestkeeper和reffinder)评估候选内参的稳定性,获得了适用于桂花花瓣开放与衰老过程中稳定表达的lncrna内参,即lnc00229717和ran1,并设计了内参的qrt-pcr引物。该引物特异性强,扩增效率高,能够大大的提高采用qrt-pcr检测桂花基因时的效率,并提高了检测结果的可信度。
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1.lnc00229717和RAN1作为lncRNA内参基因在桂花花瓣开放与衰老过程中荧光定量分析中的应用,其特征在于,所述lnc00229717的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,RAN1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.用于检测权利要求1所述lncRNA内参基因的引物,其特征在于,
3.权利要求2所述引物在桂花花瓣开放与衰老过程中荧光定量分析中的应用。
4.根据权利要求1或权利要求3所述的应用,其特征在于,所述花瓣开放与衰老过程包括:灵梗期、初花期、盛花期、盛花后期和脱落期。
5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述应用包括以下步骤:
【技术特征摘要】
1.lnc00229717和ran1作为lncrna内参基因在桂花花瓣开放与衰老过程中荧光定量分析中的应用,其特征在于,所述lnc00229717的核苷酸序列如seq id no.1所示,ran1的核苷酸序列如seq id no.2所示。
2.用于检测权利要求1所述lncrna内参基因的引物,其特...
【专利技术属性】
技术研发人员:张莹婷,张规富,闫庆宇,谭云飞,尹鹏翔,曾进,
申请(专利权)人:湖北科技学院,
类型:发明
国别省市:
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