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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及肉牛分子标记辅助选择,特别涉及一种与肉牛3月龄体高性状相关的snp分子标记的应用。
技术介绍
1、随着我国居民生活水平的不断提高,传统饮食观念发生改变,膳食消费结构升级。高蛋白低脂肪的牛肉因其丰富的营养价值逐渐受到消费者喜爱,从而极大促进我国牛肉消费。现如今,我国肉牛业产值接近2000亿元,屠宰头数、牛肉产量分别位列世界第一和第三。虽然我国是肉牛养殖大国,但由于人口基数大,牛肉供给仍有较大的缺口。我国地方牛品种普遍存在体型小、单产水平低(胴体小)的缺点。出栏肉牛胴体重,世界平均231.5kg,而我国仅有147.8kg。因此,提高我国肉牛的胴体重,可显著提升牛肉产量,减少供需缺口。
2、牛的体高是指从地面到肩胛骨最高点的垂直高度,可以反映牛只的高度和骨架的发育程度,是评估牛体型的重要指标之一。犊牛在3月龄时期生长发育速度最快,研究该时期的肉牛体高性状为肉牛的选育目标确定和优良个体的筛选提供科学依据。
3、分子标记辅助选择是指通过与目标基因紧密连锁的分子标记的基因型与表型性状进行关联分析,从而对特定的性状进行较为准确的早期选择。单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,snp)属于分子标记的一种,指个体间基因组中同一位置单个核苷酸发生变异而导致的dna序列改变,进而影响基因的表达。借助snp对肉牛的体高进行早期辅助选择,将有助于提高我国肉牛的体型及单产水平。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种与肉牛3月
2、本专利技术的技术方案如下:
3、本专利技术提供了一种肉牛snp分子标记,该分子标记为肉牛基因组gcf_002263795.1_ars-ucd1.2_genomic.fna中第21号染色体第8674692位点的碱基处,该分子标记的snp位点具有g/c多态性,其中c是肉牛3月龄体高性状的有利等位变异。
4、所述肉牛snp分子标记和检测所述肉牛snp分子标记的物质在以下任一方面的应用:
5、用于检测或辅助检测肉牛3月龄体高性状;
6、用于提高肉牛3月龄体高性状遗传育种;
7、优选的,所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示。
8、本专利技术中,所述检测肉牛snp分子标记的物质包括扩增所述分子标记snp位点在内的基因组dna片段的pcr引物,或含有所述引物的试剂盒。
9、优选的,所述引物的核苷酸序列如seq id no.2和seq id no.3所示。
10、优选的,所述试剂盒还包括pcr扩增试剂,和/或酶切试剂,所述酶切试剂中包括限制性内切酶hha i。
11、本专利技术还提供了一种检测肉牛3月龄体高性状的方法,包括:检测肉牛基因组第21号染色体第8674692位点的碱基类型,cc基因型群体的3月龄体高高于gc基因型群体,gc基因型群体3月龄体高高于gg基因型群体。
12、优选的,检测肉牛基因组第21号染色体第8674692位点碱基类型的方法包括:设计扩增seq id no.1所示核苷酸序列的引物组,利用所述引物组对肉牛基因组dna进行pcr扩增,使用限制性内切酶hha i对获得的扩增产物进行酶切,酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳条带判断肉牛基因组第21号染色体第8674692位点的碱基类型:酶切产物为1条带为gg型,2条带为cc型,3条带为gc型。
13、进一步优选的,所述仅有1条带的酶切产物大小为541bp,有2条带的酶切产物大小分别为341bp和200bp,有3条带的酶切产物大小分别为541bp、341bp和200bp。
14、本专利技术还提供了一种优化肉牛3月龄体高性状的遗传育种方法,包括:确定肉牛核心群中种牛第21号染色体第8674692位点的碱基类型,并根据该碱基类型做出相应的选择:
15、种牛的继代选育挑选牛第21号染色体第8674692位点碱基为cc型和gc型的个体,淘汰gg型个体,以逐代提高该位点基因c的频率,从而优化后代肉牛的3月龄体高性状。
16、优选的,所述牛第21号染色体第8674692位点的碱基如seq id no.1所示序列中第341bp所示。
17、本专利技术的有益效果:
18、本专利技术研究并确定影响肉牛3月龄体高性状的snp分子标记,使用所述分子标记进行早期分子标记辅助选择,能够加快肉牛品种选育进程。
19、本专利技术通过检测所述分子标记snp位点的碱基类型,预测肉牛3月龄体高性状,cc基因型群体的3月龄体高高于gc基因型群体,gc基因型群体3月龄体高高于gg基因型群体。应用扩增影响肉牛3月龄体高性状分子标记的引物组,通过所述分子标记和引物组,建立高效准确的肉牛分子标记辅助育种技术,将其应用于肉牛选育,能够筛选具有优良3月龄体高性状的犊牛,从而减少养殖周期,提高牛场养殖效益。
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1.一种肉牛SNP分子标记或检测所述肉牛SNP分子标记的物质在以下任一方面的应用,其特征在于,
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测肉牛SNP分子标记的物质包括扩增所述分子标记SNP位点在内的基因组DNA片段的PCR引物,或含有所述引物的试剂盒。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR扩增试剂,和/或酶切试剂,所述酶切试剂中包括限制性内切酶Hha I。
6.一种检测肉牛3月龄体高性状的方法,其特征在于,检测肉牛基因组第21号染色体第8674692位点的碱基类型,CC基因型群体的3月龄体高高于GC基因型群体,GC基因型群体3月龄体高高于GG基因型群体。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,检测肉牛基因组第21号染色体第8674692位点碱基类型的方法
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述仅有1条带的酶切产物大小为541bp,有2条带的酶切产物大小分别为341bp和200bp,有3条带的酶切产物大小分别为541bp、341bp和200bp。
9.一种优化肉牛3月龄体高性状的遗传育种方法,其特征在于,确定肉牛核心群中种牛第21号染色体第8674692位点的碱基类型,并根据该碱基类型做出相应的选择:
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述牛第21号染色体第8674692位点的碱基如SEQ ID NO.1所示序列中第341bp所示。
...【技术特征摘要】
1.一种肉牛snp分子标记或检测所述肉牛snp分子标记的物质在以下任一方面的应用,其特征在于,
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述snp分子标记的核苷酸序列如seq idno.1所示。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测肉牛snp分子标记的物质包括扩增所述分子标记snp位点在内的基因组dna片段的pcr引物,或含有所述引物的试剂盒。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述引物的核苷酸序列如seq id no.2和seq id no.3所示。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括pcr扩增试剂,和/或酶切试剂,所述酶切试剂中包括限制性内切酶hha i。
6.一种检测肉牛3月龄体高性状的方法,其特征在于,检测肉牛基因组第21号染色体第8674692位点的碱基类型,cc基因型群体的3月龄体高高于gc基因型群体,gc基因型群体3月龄体高高于gg基因型群体。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征...
【专利技术属性】
技术研发人员:张凤,王成梅,熊琪,柴进,上官爱哨,杨前平,索效军,陶虎,张年,李晓锋,
申请(专利权)人:湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,
类型:发明
国别省市:
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