【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物技术及作物育种，特别涉及一种检测番茄颈腐根腐病抗性基因的snp分子标记及其应用，检测snp分子标记的方法和试剂盒。
技术介绍
1、番茄是种植面积和消费量最大的蔬菜作物之一，也是我国重要的蔬菜作物之一，营养丰富，用途广泛，深受种植者和消费者喜爱。
2、在番茄长期的生产过程中，其病虫危害也随之加重，尤其是近几年番茄颈腐根腐病(fusarium crown and root rot,fcrr)已发展为破坏性极大的番茄土传病害之一，严重威胁着番茄的安全生产。番茄颈腐根腐病被称为“死棵病”，该病害在番茄生长的各个时期均可发生。防治番茄颈腐根腐病最经济、安全、高效和环保的方法是培育抗病品种。
3、番茄颈腐根腐病抗源来自于野生番茄(solanum peruvianum)，抗性由9号染色体上一个显性基因frl控制(laterrot h,moretti a.allelism of various forlresistance sources.report of the tomato genetics cooperative,1991,41:28-30)。2015年frl基因被定位在标记pnu-d4与scarfrl之间，位于6.10-62.00mb的55.90mb区间(mutlu n,demirelli a,ilbi h,ikten c.development of co-dominant scar markerslinked to resistant gene against the fusarium
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种基于番茄颈腐根腐病抗性基因frl的snp分子标记来检测番茄颈腐根腐病抗性，以期对番茄品种的颈腐根腐病抗性进行评价或在番茄育种过程中采用这种检测方法选育出具有高抗颈腐根腐病抗性的番茄品种。
2、本专利技术在第一方面提供了一种用于鉴定番茄颈腐根腐病抗性的引物，所述引物包括用于扩增位于番茄第9号染色体的目标核苷酸序列的引物；所述目标核苷酸序列包含位于番茄第9号染色体第4836403位点处的snp分子标记(solanum lycopersicum cultivarheinz 1706chromosome 9，sl3.0)；所述snp分子标记具有多态性的核苷酸t/c。
3、本专利技术在第二方面提供一种用于检测番茄颈腐根腐病抗性的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测本专利技术第一方面所述的snp分子标记的试剂。
4、本专利技术在第三方面提供了本专利技术第一方面所述的引物或本专利技术第二方面所述的试剂盒在检测番茄颈腐根腐病抗性或番茄抗颈腐根腐病育种(例如辅助番茄抗颈腐根腐病育种)中的应用。其中，当被检测番茄品种在所述snp分子标记位置的核苷酸有c时，该番茄品种被鉴定为抗颈腐根腐病品种。当被检测番茄品种在所述snp分子标记位置的核苷酸为t时，该番茄品种被鉴定为非抗颈腐根腐病品种。
5、本专利技术在第四方面提供了一种检测番茄颈腐根腐病抗性的方法，所述方法包括如下步骤：(1)获取待检测番茄品种的dna样品；(2)利用所述dna样品来检测该番茄品种的在所述snp分子标记位置的基因型；(3)根据所述snp分子标记位置的基因型鉴定被检测番茄品种的颈腐根腐病抗性。所述鉴定的规则如下：当被检测番茄品种在所述snp分子标记位置的核苷酸有c时，该番茄品种被鉴定为抗颈腐根腐病品种；当被检测番茄品种在所述snp分子标记位置的核苷酸为t时，该番茄品种被鉴定为非抗颈腐根腐病品种。
6、本专利技术的有益效果是：利用本专利技术提供的用于检测frl基因上的snp分子标记的引物、试剂盒或检测方法能够快速检测番茄颈腐根腐病抗性(即，对基因frl基因在所述snp分子标记位点进行分型)，成本低，操作简单，检测结果准确可靠(snp分子标记位点核苷酸(或基因型)和颈腐根腐病抗性鉴定表型吻合率高达92.55％)，对番茄颈腐根腐病的防治具有重要的实用价值。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种用于鉴定番茄颈腐根腐病抗性的引物，其特征在于：
2.根据权利要求1所述的引物，其特征在于：
3.根据权利要求2所述的引物，其特征在于：
4.根据权利要求3所述的引物，其特征在于，
5.一种用于检测番茄颈腐根腐病抗性的试剂盒，其特征在于：
6.权利要求1至4中任一项所述的引物或权利要求5所述的试剂盒在检测番茄颈腐根腐病抗性或番茄抗颈腐根腐病育种中的应用，其中：
7.一种检测番茄颈腐根腐病抗性的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：
8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于：
9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于：
10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于：
【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定番茄颈腐根腐病抗性的引物，其特征在于：
2.根据权利要求1所述的引物，其特征在于：
3.根据权利要求2所述的引物，其特征在于：
4.根据权利要求3所述的引物，其特征在于，
5.一种用于检测番茄颈腐根腐病抗性的试剂盒，其特征在于：
6.权利要求1至4中任一项所述的引物...
【专利技术属性】
技术研发人员：叶青静，程远，王荣青，姚祝平，阮美颖，周国治，万红建，李志邈，刘晨旭，
申请(专利权)人：浙江省农业科学院，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。