【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及化合物的制造方法、化合物文库的制造方法、化合物文库及筛选方法。另外，涉及肽或蛋白质的制造方法、肽或蛋白质文库的制造方法、肽或蛋白质文库及筛选方法。
技术介绍
1、异戊二烯化是与包括萜类化合物、聚酮化合物、非核糖体肽、及核糖体翻译系统翻译后修饰肽(ripps)在内的多样的天然产物生物合成路径同样地分布在初级代谢中的普遍的修饰。异戊二烯化通常在这些天然产物的多样的生物活性中发挥重要的作用。其原因在于，异戊二烯基通常提高分子的亲油性及与脂质膜的相互作用，由此获得期望的生物利用度及膜渗透性。异戊二烯基的这种特性在因膜渗透性低而为人所知的肽制剂的开发中尤其备受关注。作为用于克服低膜渗透性的最成功的重要战略之一，已知有烷基化，在药物中用于利拉鲁肽及地特胰岛素等肽制剂的开发。
2、因此，开发用于肽的异戊二烯化的新型生物体催化剂不仅扩展用于合成生物学的工具箱，而且促进用于创新药物的生理活性肽设计。
3、参与作为ripp的类型的蓝藻菌素(cyanobactin)的生物合成的异戊烯转移酶(prenyltransferase；ptase)是能针对多样的肽用作异戊二烯化生物体催化剂的有意思的酶。这样的异戊烯转移酶、所谓的f家族酶形成具有曝露于溶剂中的特有的孔洞的截短型α/βptase桶状折叠结构，能够与大的肽底物结合。该独特的结构虽然带来了针对异戊二烯基供体和受体残基的严格的选择性，但由于整体的底物肽序列的选择性是宽松的，因此有望成为用于容易且多用途的肽烷基化的生物体催化剂。尽管具有相似的三级结构，但f家族的异戊烯
4、现有技术文献
5、专利文献
6、专利文献1：国际公开第2020/080490号
7、非专利文献
8、非专利文献1：hao,y.等人，molecular basis for the broad substrateselectivity of a peptide prenyltransferase.proc.natl.acad.sci.usa,113,14037-14042(2016).
9、非专利文献2：dalponte,l.等人，n-prenylation of tryptophan by anaromatic prenyltransferase from the cyanobactin biosyntheticpathway.biochemistry,57,6860-6867(2018).
10、非专利文献3：tianero,m.d.等人，metabolic model for diversity-generatingbiosynthesis.proc.natl.acad.sci.usa,113,1772-1777(2016).
11、非专利文献4：phan,c.-s.等人，argicyclamides a-c unveil enzymatic basisfor guanidine bis-prenylation.j.am.chem.soc.,143,10083-10087(2021).
12、非专利文献5：parajuli,a.等人，a unique tryptophan c-prenyltransferasefrom the kawaguchipeptin biosynthetic pathway.angew.chem.,55,3596-3599(2016).
13、非专利文献6：okada,m.等人，stereospecific prenylation of tryptophan bya cyanobacterial post-translational modification enzyme.org.biomol.chem.,14,9639-9644(2016).
技术实现思路
1、专利技术所要解决的课题
2、已报道的异戊二烯化之中，c-异戊二烯化是最具吸引力的修饰之一。其原因在于，碳-碳键的形成对于用于构建分子的碳骨架的生物化学和有机化学这两方面而言具有核心重要性。
3、然而，已知大部分f家族异戊烯转移酶会催化富含电子的杂原子的异戊二烯化。蓝藻菌素生物合成基因簇(bgc)中具有c-异戊二烯化活性的已知的异戊烯转移酶只有催化trp c-3异戊二烯化的源自kawaguchipeptin bgc的kgpf(非专利文献5～6)。因此，不仅为了扩大异戊二烯化天然物的化学空间，还为了提供用于各种生理活性肽的多样的烷基化的潜在的生物体催化剂，期望探索出对没有先例的受体催化c-异戊二烯化的新型异戊烯转移酶。
4、另外，不限于c-异戊二烯化，还期望探索出能使多样的底物异戊二烯化的异戊烯转移酶、及异戊二烯化方法。
5、本专利技术的目的在于提供能够解决上述任一课题的经异戊二烯化的化合物的新型制造方法、和经异戊二烯化的化合物文库的新型制造方法等。
6、用于解决课题的手段
7、本申请专利技术人为了解决上述课题而进行了深入研究，结果发现，以limf为代表的规定的异戊烯转移酶不仅能够催化新型c-异戊二烯化，而且催化针对各种底物的异戊二烯化，从而完成了本专利技术。
8、即，本专利技术如下所述。
9、[1]
10、具有至少1个下述式(i)或(ii)所示的结构的化合物的制造方法，
11、[化学式1]
12、
13、[化学式2]
14、
15、(上述式(i)中，r1为氢原子或任意的取代基，n表示0～11的整数，
16、上述式(ii)中，r2各自独立地为任意的取代基，p表示0～4的整数，n表示0～11的整数。)
17、前述制造方法包括：使具有至少1个下述式(iii)或(iv)所示的结构的化合物与异戊烯转移酶接触而将异戊二烯基引入于前述结构中的工序，
18、[化学式3]
19、
20、[化学式4]
21、
22、(上述式(iii)和式(iv)中，r1、r2及p与前述含义相同。)
23、前述异戊烯转移酶为limf或与其具有同源性的酶。
24、[2]
25、如[1]所述的制造方法，其中，使具有包含至少1个his、tyr、或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质与异戊烯转移酶接触，将异戊二烯基引入于至少1个his残基、tyr残基或它们的衍生物残基中。
26、[3]
27、包含经异戊二烯化的肽或蛋白质的化合物文库的制造方法，前述制造方法包括：使包含具本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.具有至少1个下述式(I)或(II)所示的结构的化合物的制造方法，
2.如权利要求1所述的制造方法，其中，使具有包含至少1个His、Tyr或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质与异戊烯转移酶接触，将异戊二烯基引入于至少1个His残基、Tyr残基或它们的衍生物残基中。
3.包含经异戊二烯化的肽或蛋白质的化合物文库的制造方法，所述制造方法包括：使包含具有包含至少1个His、Tyr或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质的化合物文库与异戊烯转移酶接触而将异戊二烯基引入于至少1个His残基、Tyr残基或它们的衍生物残基中的工序，
4.如权利要求3所述的制造方法，其还包括：通过无细胞翻译系统翻译mRNA文库，制备包含具有包含至少1个His、Tyr或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质的所述化合物文库的工序。
5.如权利要求3或4所述的制造方法，其中，所述化合物文库中的所述肽或所述蛋白质是结合有基因型的肽或蛋白质。
6.如权利要求5所述的制造方法，其还包括：利用mRNA展示法制备包含结合有基因型的肽或蛋白质的所述化合物文库的工序，<...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.具有至少1个下述式(i)或(ii)所示的结构的化合物的制造方法，
2.如权利要求1所述的制造方法，其中，使具有包含至少1个his、tyr或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质与异戊烯转移酶接触，将异戊二烯基引入于至少1个his残基、tyr残基或它们的衍生物残基中。
3.包含经异戊二烯化的肽或蛋白质的化合物文库的制造方法，所述制造方法包括：使包含具有包含至少1个his、tyr或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质的化合物文库与异戊烯转移酶接触而将异戊二烯基引入于至少1个his残基、tyr残基或它们的衍生物残基中的工序，
4.如权利要求3所述的制造方法，其还包括：通过无细胞翻译系统翻译mrna文库，制备包含具有包含至少1个his、tyr或它们的衍生物的氨基酸序列的肽或蛋白质的所述化合物文库的工序。
5.如权利要求3或4所述的制造方法，其中，所述化合物文库中的所述肽或所述蛋白质是结合有基因型的肽或蛋白质。
6.如权利要求5所述的制造方法，其还包括：利用mrna展示法制备包含结合有基因型的肽或蛋白质的所述化合物文库的工序，
7.如权利要求1...
【专利技术属性】
技术研发人员：菅裕明，后藤佑树，张宇琛，冈田正弘，
申请(专利权)人：国立大学法人东京大学，
类型：发明
国别省市：
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