【技术实现步骤摘要】
本申请涉及基因测序，特别是涉及一种基因测序循环间视野校准方法、测序设备和存储介质。
技术介绍
1、随着基因技术的发展，出现了基因测序技术，基因测序可以对携带着遗传信息的核酸碱基序列进行识别，这相当于对编码生物性状的原始密码进行解析。发展基因测序技术有望破解困扰人类的诸多疾病难题，对于疾病预防、精准诊断等均具有巨大潜力。
2、测序技术在边合成边测序的过程中，需要不同温度点控制。由于测序仪器接收不同方向的热应力，可能会出现热变形，进而导致测序过程中的对芯片上的信息采集不准，造成数据损失。
技术实现思路
1、基于此，有必要针对上述技术问题，提供一种能够提高基因测序时数据采集的准确率的基因测序循环间视野校准方法、测序设备和存储介质。
2、第一方面，本申请提供了一种基因测序循环间视野校准方法，包括：
3、在当前视野位置下获取目标基因片的测序图像，并将测序图像与有效测序图像进行匹配，得到测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向；
4、若图像偏移量大于第一阈值，则基于图像偏移量、图像偏移方向以及关联列表，确定当前视野位置对应的校准方向与校准量，第一阈值是基于基因测序的数据损失率确定的，关联列表表征图像偏移方向与当前视野位置的校准方向间的反向补偿关系；
5、基于校准方向与校准量对当前视野位置进行校准。
6、在其中一个实施例中，基于图像偏移量、图像偏移方向以及关联列表，确定当前视野位置对应的校准方向与校准量，包括：基于图像偏移量、
7、在其中一个实施例中，基于校准方向与校准量对当前视野位置进行校准，包括：将当前视野位置按照校准方向移动校准光栅条数的距离。
8、在其中一个实施例中，本申请的方法还包括：利用数据损失率确定测序图像在至少一个方向上的容许偏移量；利用容许偏移量确定第一阈值，第一阈值小于或等于容许偏移量。
9、在其中一个实施例中，基于校准方向与校准量对当前视野位置进行校准之前包括：判断校准量是否大于第二阈值，第二阈值大于第一阈值，第二阈值是基于基因测序的异常偏移确定的；若校准量大于第二阈值，则启动预警机制。
10、在其中一个实施例中，将测序图像与有效测序图像进行匹配，得到测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向，包括：获取测序图像与有效测序图像之间的非重叠区域；基于非重叠区域获取测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向。
11、在其中一个实施例中，本申请的方法还包括：在当前视野位置下获取目标基因片的当前标记点，并将当前标记点与有效标记点进行匹配，得到当前标记点与有效标记点的标记偏移量与标记偏移方向，有效标记点是首次测序循环时获取的目标基因片上的标记点信息；基于标记偏移量和标记偏移方向确定当前视野位置对应的校准方向与校准量；基于校准方向与校准量对当前视野位置进行偏移，以校准当前视野位置。
12、在其中一个实施例中，目标基因片位于承载台上，方法还包括：获取承载台的载台偏移方向与载台偏移量；基于承载台的载台偏移方向与载台偏移量对承载台进行偏移，以对视野位置进行校准，视野位置的变化与承载台的偏移有关。
13、第二方面，本申请还提供了一种基因测序设备，包括存储器和处理器，存储器存储有计算机程序，处理器执行计算机程序时实现以下步骤：
14、在当前视野位置下获取目标基因片的测序图像，并将测序图像与有效测序图像进行匹配，得到测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向；
15、若图像偏移量大于第一阈值，则基于图像偏移量、图像偏移方向以及关联列表，确定当前视野位置对应的校准方向与校准量，第一阈值是基于基因测序的数据损失率确定的，关联列表表征图像偏移方向与当前视野位置的校准方向间的反向补偿关系；
16、基于校准方向与校准量对当前视野位置进行校准。
17、第三方面，本申请还提供了一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行时实现以下步骤：
18、在当前视野位置下获取目标基因片的测序图像，并将测序图像与有效测序图像进行匹配，得到测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向；
19、若图像偏移量大于第一阈值，则基于图像偏移量、图像偏移方向以及关联列表，确定当前视野位置对应的校准方向与校准量，第一阈值是基于基因测序的数据损失率确定的，关联列表表征图像偏移方向与当前视野位置的校准方向间的反向补偿关系；
20、基于校准方向与校准量对当前视野位置进行校准。
21、上述基因测序循环间视野校准方法、基因测序设备和存储介质，通过在当前视野位置下获取目标基因片的测序图像，并将测序图像与有效测序图像进行匹配，得到测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向，在得到图像偏移量之后，若图像偏移量大于第一阈值，即目标基因片的位置发生变化导致在当前视野位置下所获取的目标基因片的测序图像的数据信息存在一定的损失，为限制这种损失，本申请基于图像偏移量、图像偏移方向以及关联列表确定当前视野位置对应的校准方向与校准量，进而基于确定的校准方向与校准量对当前视野位置进行校准。如此可以解决由于基因测序设备的热变形导致测序图像采集对应的视野定位不准确，导致数据损失的问题。通过上述方法可以减少基因测序时的图像采集的数据损失，也就可以确保基因测序时所采集的基因信息的数据量，从而提高基因测序的准确率和完整率。
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1.一种基因测序循环间视野校准方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述校准量包括校准光栅条数，所述基于所述图像偏移量、所述图像偏移方向以及关联列表，确定所述当前视野位置对应的校准方向与校准量，包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于所述校准方向与所述校准光栅条数对所述当前视野位置进行校准，包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述校准方向与所述校准量对所述当前视野位置进行校准之前包括：
6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述将所述测序图像与有效测序图像进行匹配，得到所述测序图像对应的图像偏移量与图像偏移方向，包括：
7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：
8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述目标基因片位于承载台上，所述方法还包括：
9.一种基因测序设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，
10.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至8中任一项所述的方法的步骤。
...【技术特征摘要】
1.一种基因测序循环间视野校准方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述校准量包括校准光栅条数，所述基于所述图像偏移量、所述图像偏移方向以及关联列表，确定所述当前视野位置对应的校准方向与校准量，包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于所述校准方向与所述校准光栅条数对所述当前视野位置进行校准，包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述校准方向与所述校准量对所述当前视野位置进行校准之前包括：
6.根据权利要求1所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：张朋，刘长根，肖育劲，
申请(专利权)人：深圳市大道测序生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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