System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记及其应用制造技术_技高网

一种与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记及其应用制造技术

技术编号:42327000 阅读:5 留言:0更新日期:2024-08-14 16:05
本发明专利技术涉及一种与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记及其应用,属于生物技术领域。本发明专利技术的KCNQ1基因分子标记位点是位于鸽参考基因组Cliv_NAU_1.0版本的1号染色体第142229577位碱基的SNP分子标记,存在A/G多态性,所述分子标记检测所需鸽子DNA特异性引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。其有益效果是可以实现对鸽蛋重性状进行早期选择,提高选育效率,更好地服务于鸽的育种,具有很大的经济应用和科研价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记及其应用,属于生物。


技术介绍

1、蛋重性状在鸽育种和生产中十分重要,是蛋鸽品种改良和新品种(配套系)培育的主要性状之一。由于常规的选育技术世代周期长,进展缓慢,难以精准选育。随着现代生物技术的快速发展,分子标记辅助育种技术在动植物新品种选育领域得到广泛的应用,与常规选育技术结合可以提高对目标性状选择的精确性,实现早期选择,加快选育进度,节省育种成本,提高选育效率。然而,目前缺少与鸽蛋重性状相关的分子标记。

2、kcnq1基因是一个在心脏、内耳、胃和结肠等多个组织中发挥重要作用的钾通道,它与kcneβ亚单位结合,调节电流动力学。kcnq1基因通过快速激活和缓慢失活的方式诱导电压依赖性电流,从而产生钾选择性的外向电流,可以影响心脏复极化、近端小管和肠道钠离子吸收、胃酸分泌、调节血液和脑脊液之间肌醇的梯度,影响神经元兴奋性等功能。但是此前还未报道该基因与鸽子产蛋间隔相关。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是针对现有技术存在的缺陷,提出一种与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记及其应用,提高选育效率。

2、本专利技术通过记录鸽的第26至39周龄平均蛋重性状、利用全基因组重测序技术进行snp基因分型,通过全基因组关联分析筛选得到相关的kcnq1基因分子标记,为鸽子的蛋重性状选育提供了新的基因和分子标记资源。

3、本专利技术通过以下技术方案解决技术问题:提供一种与鸽第26至39周龄期间平均蛋重显著相关的kcnq1基因分子标记,所述snp分子标记位于鸽参考基因组cliv_nau_1.0版本的1号染色体第142229577位碱基处,存在a/g多态性,序列如seq id no:3或seq id no:4所示第159位碱基,所述snp分子标记检测所需鸽子dna特异性引物对的核苷酸序列如seq idno:1和seq id no:2所示。

4、将上述特异性引物对用于鸽第26至39周龄平均蛋重性状的分子检测。

5、本专利技术进一步提供与鸽蛋重相关的snp分子标记的应用,检测方法包括以下步骤,

6、步骤一、将待测鸽子dna样品用dna特异性引物进行pcr扩增,得到扩增产物,所述待测鸽子dna样品中含有鸽1号染色体第142229577位碱基的snp分子标记;

7、步骤二、对pcr产物进行sanger测序;

8、步骤三、根据测序峰图判断1号染色体第142229577位碱基的snp分子标记基因型。

9、上述检测方法的所述步骤一中,pcr扩增引物由f核苷酸序列如seq id no:1和r核苷酸序列如seq id no:2组成,反应体系以50 μl计,体系为

10、待测鸽子dna                        50 ng

11、accurate taq dna 聚合酶            1.25 iu

12、含mg2+的10x pcr反应缓冲液          5μl

13、10mm dntps                         1μl

14、10μm 上游引物f                     1μl

15、10μm 下游引物r                     1μl

16、无菌水                             补足至50μl;

17、所述的pcr扩增的反应条件为94℃预变性5min;94℃变性30sec,60℃退火30sec,72℃延伸60sec,共30循环;72℃延伸5min;20℃保存。

18、其中,分子标记检测所需鸽子dna特异性引物对扩增产物的核苷酸序列如seq idno:3或seq id no:4示。

19、所述步骤三中,判断标准是snp位点g/g基因型鸽子的第26至39周龄期间平均蛋重显著高于a/g基因型和a/a基因型个体,a/g基因型的个体第26至39周龄期间平均蛋重高于a/a基因型个体。

20、本专利技术经鉴定首次得出与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记,基于特异snp分子标记的基因型发现,g/g基因型鸽子的第26至39周龄平均蛋重高于a/g基因型和a/a基因型个体,a/g基因型鸽子的第26至39周龄平均蛋重高于a/a基因型。通过以待测鸽的基因组dna为模板,采用特异引物对进行pcr扩增,然后将pcr扩增产物进行sanger测序和snp基因分型,基于该snp分子标记的基因型可以实现对鸽蛋重性状进行选择。在育种中,通过淘汰a/g基因型和a/a基因型的个体,保留g/g基因型的个体,其有益效果是可以实现对鸽平均蛋重性状进行早期选择,提高选种的精确性,加快选育进度,节省育种成本,提高选育效率,更好地服务于鸽的育种,具有很大的经济应用和科研价值。

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【技术保护点】

1.一种与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记,其特征在于:所述分子标记位点是位于鸽参考基因组Cliv_NAU_1.0版本的1号染色体第142229577位碱基的SNP,存在A/G多态性,所述SNP分子标记所需鸽子DNA特异性引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ IDNO:2所示。

2.根据权利要求1所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:用于鸽蛋重性状的分子检测。

3.根据权利要求2所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:检测方法包括以下步骤,

4.根据权利要求3所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:所述步骤一中,PCR扩增引物由F核苷酸序列如SEQ ID NO:1和R核苷酸序列如SEQ ID NO:2组成,反应体系以50 μl计,体系为

5.根据权利要求4所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:分子标记所需鸽子DNA特异性引物对扩增产物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示。

6.根据权利要求3所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:所述步骤三中,判断标准是SNP位点为G/G基因型鸽子的第26至39周龄期间平均蛋重显著高于A/G基因型个体和A/A基因型个体,A/G基因型鸽子的第26至39周龄期间平均蛋重高于A/A基因型个体。

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【技术特征摘要】

1.一种与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记,其特征在于:所述分子标记位点是位于鸽参考基因组cliv_nau_1.0版本的1号染色体第142229577位碱基的snp,存在a/g多态性,所述snp分子标记所需鸽子dna特异性引物对的核苷酸序列如seq id no:1和seq idno:2所示。

2.根据权利要求1所述与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记的应用,其特征在于:用于鸽蛋重性状的分子检测。

3.根据权利要求2所述与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记的应用,其特征在于:检测方法包括以下步骤,

4.根据权利要求3所述与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记的应用,其特征在于:...

【专利技术属性】
技术研发人员:冯春刚段颖杜岳松陈慧丁纪强刘相平江旭升常玲玲
申请(专利权)人:南京农业大学
类型:发明
国别省市:

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