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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记及其应用,属于生物。
技术介绍
1、蛋重性状在鸽育种和生产中十分重要,是蛋鸽品种改良和新品种(配套系)培育的主要性状之一。由于常规的选育技术世代周期长,进展缓慢,难以精准选育。随着现代生物技术的快速发展,分子标记辅助育种技术在动植物新品种选育领域得到广泛的应用,与常规选育技术结合可以提高对目标性状选择的精确性,实现早期选择,加快选育进度,节省育种成本,提高选育效率。然而,目前缺少与鸽蛋重性状相关的分子标记。
2、kcnq1基因是一个在心脏、内耳、胃和结肠等多个组织中发挥重要作用的钾通道,它与kcneβ亚单位结合,调节电流动力学。kcnq1基因通过快速激活和缓慢失活的方式诱导电压依赖性电流,从而产生钾选择性的外向电流,可以影响心脏复极化、近端小管和肠道钠离子吸收、胃酸分泌、调节血液和脑脊液之间肌醇的梯度,影响神经元兴奋性等功能。但是此前还未报道该基因与鸽子产蛋间隔相关。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是针对现有技术存在的缺陷,提出一种与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记及其应用,提高选育效率。
2、本专利技术通过记录鸽的第26至39周龄平均蛋重性状、利用全基因组重测序技术进行snp基因分型,通过全基因组关联分析筛选得到相关的kcnq1基因分子标记,为鸽子的蛋重性状选育提供了新的基因和分子标记资源。
3、本专利技术通过以下技术方案解决技术问题:提供一种与鸽第26至39周龄期间平均蛋重显
4、将上述特异性引物对用于鸽第26至39周龄平均蛋重性状的分子检测。
5、本专利技术进一步提供与鸽蛋重相关的snp分子标记的应用,检测方法包括以下步骤,
6、步骤一、将待测鸽子dna样品用dna特异性引物进行pcr扩增,得到扩增产物,所述待测鸽子dna样品中含有鸽1号染色体第142229577位碱基的snp分子标记;
7、步骤二、对pcr产物进行sanger测序;
8、步骤三、根据测序峰图判断1号染色体第142229577位碱基的snp分子标记基因型。
9、上述检测方法的所述步骤一中,pcr扩增引物由f核苷酸序列如seq id no:1和r核苷酸序列如seq id no:2组成,反应体系以50 μl计,体系为
10、待测鸽子dna 50 ng
11、accurate taq dna 聚合酶 1.25 iu
12、含mg2+的10x pcr反应缓冲液 5μl
13、10mm dntps 1μl
14、10μm 上游引物f 1μl
15、10μm 下游引物r 1μl
16、无菌水 补足至50μl;
17、所述的pcr扩增的反应条件为94℃预变性5min;94℃变性30sec,60℃退火30sec,72℃延伸60sec,共30循环;72℃延伸5min;20℃保存。
18、其中,分子标记检测所需鸽子dna特异性引物对扩增产物的核苷酸序列如seq idno:3或seq id no:4示。
19、所述步骤三中,判断标准是snp位点g/g基因型鸽子的第26至39周龄期间平均蛋重显著高于a/g基因型和a/a基因型个体,a/g基因型的个体第26至39周龄期间平均蛋重高于a/a基因型个体。
20、本专利技术经鉴定首次得出与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记,基于特异snp分子标记的基因型发现,g/g基因型鸽子的第26至39周龄平均蛋重高于a/g基因型和a/a基因型个体,a/g基因型鸽子的第26至39周龄平均蛋重高于a/a基因型。通过以待测鸽的基因组dna为模板,采用特异引物对进行pcr扩增,然后将pcr扩增产物进行sanger测序和snp基因分型,基于该snp分子标记的基因型可以实现对鸽蛋重性状进行选择。在育种中,通过淘汰a/g基因型和a/a基因型的个体,保留g/g基因型的个体,其有益效果是可以实现对鸽平均蛋重性状进行早期选择,提高选种的精确性,加快选育进度,节省育种成本,提高选育效率,更好地服务于鸽的育种,具有很大的经济应用和科研价值。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记,其特征在于:所述分子标记位点是位于鸽参考基因组Cliv_NAU_1.0版本的1号染色体第142229577位碱基的SNP,存在A/G多态性,所述SNP分子标记所需鸽子DNA特异性引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ IDNO:2所示。
2.根据权利要求1所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:用于鸽蛋重性状的分子检测。
3.根据权利要求2所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:检测方法包括以下步骤,
4.根据权利要求3所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:所述步骤一中,PCR扩增引物由F核苷酸序列如SEQ ID NO:1和R核苷酸序列如SEQ ID NO:2组成,反应体系以50 μl计,体系为
5.根据权利要求4所述与鸽蛋重性状相关的KCNQ1基因分子标记的应用,其特征在于:分子标记所需鸽子DNA特异性引物对扩增产物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示。
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...【技术特征摘要】
1.一种与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记,其特征在于:所述分子标记位点是位于鸽参考基因组cliv_nau_1.0版本的1号染色体第142229577位碱基的snp,存在a/g多态性,所述snp分子标记所需鸽子dna特异性引物对的核苷酸序列如seq id no:1和seq idno:2所示。
2.根据权利要求1所述与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记的应用,其特征在于:用于鸽蛋重性状的分子检测。
3.根据权利要求2所述与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记的应用,其特征在于:检测方法包括以下步骤,
4.根据权利要求3所述与鸽蛋重性状相关的kcnq1基因分子标记的应用,其特征在于:...
【专利技术属性】
技术研发人员:冯春刚,段颖,杜岳松,陈慧,丁纪强,刘相平,江旭升,常玲玲,
申请(专利权)人:南京农业大学,
类型:发明
国别省市:
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