System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种卫星RNA预防病毒侵染植物的方法技术_技高网

一种卫星RNA预防病毒侵染植物的方法技术

技术编号:42311677 阅读:9 留言:0更新日期:2024-08-14 15:56
本发明专利技术属于分子生物学领域,具体方法为利用RNA干扰技术,通过设计并整合小干扰RNA至卫星RNA发夹结构中,以预防植物病毒侵染。本发明专利技术提供一种卫星RNA预防病毒侵染植物的方法:预防植物病毒侵染的卫星RNA基因沉默系统由一种表达特殊小干扰RNA的卫星RNA和一种弱毒的辅助病毒Fny‑CMV‑2brds组成;卫星RNA主体为satT1‑KN,把其第90位至109位序列替换为靶向植物病毒基因组的小干扰RNA序列,并使之形成新的长发夹结构。siRNA介导的植物抗病毒机制具有高效、特异性、持久性、环保和灵活性等多个优势。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域,具体方法为利用rna干扰(rna interference,rnai)技术,通过设计并整合小干扰rna(small interfering rna,sirna)至卫星rna(satelliterna,satrna)发夹结构中,以预防植物病毒侵染。


技术介绍

1、rnai是一种在植物体内自然发生的分子机制,主要用于防御外来病毒的侵染。该机制的具体过程包含dcl蛋白(dicer-like,dcl)对病毒基因组的切割,产生双链rna(double-stranded rna,dsrna),进而引发ago蛋白(ago,argonaute proteins)介导的rna诱导的沉默复合体(rna-induced silencing complex,risc)形成,特异性降解外来病毒rna。植物体内产生的小分子rna,包括微小rna(microrna,mirna)、sirna和dsrna,对病原体防御和胁迫响应至关重要,并已成为功能基因组学和生物技术的重要工具。

2、已有许多报道将rnai应用于防控植物病毒,如病毒诱导的基因沉默(virusinterfering gene silence,vigs)、人工合成mirna和编辑植物体内的抗性基因等等方法。

3、郭依等人以烟草脆裂病毒(tobacco rattle virus,trv)为载体,将烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus,tmv)、马铃薯y病毒(potato virusy,pvy)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,cmv)的多个核酸序列构建到trv载体中,通过农杆菌浸润接种的方法将重组载体应用至植物,诱导产生vigs。然后,通过实时荧光定量pcr检测植物体内tmv、cmv、pvy三种病毒rna的积累量,结果发现重组表达载体减少病毒积累量。vigs技术虽然成本较低、操作简便,但其产生的sirna多样性高,表达精确度有限,且不能稳定遗传。

4、shuo等人针对黄瓜绿色斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,cgmmv)的基因组,设计mirna和反式作用小干扰rna(trans-acting sirna,tasirna),将这些mirna在植物体内瞬时表达,筛选出最有效的mirna序列,然后建立表达多顺反子人工mirna的稳定转基因黄瓜植物,赋予其对cgmmv的抗病性。人工合成mirna虽然表达精确,但缺乏自主复制和移动能力,通常需要通过转基因技术实现,存在遗传复杂性和公众接受度问题。

5、le等人通过研究pvy在植物中的复制过程,发现pvy复制依赖于植物中的真核转录起始因子(eukaryotic initiation factor,elf4e),运用基因编辑技术切割寄主的elf4es,得到将elf4es基因敲除的烟草,由于elf4e是一种隐性抗性基因,这种烟草植株获得对pvy病毒的部分抗性。研究植物的抗性基因防治植物病毒,可以有效截断病毒在植物体内的传播通路,但是目前的研究对植物病毒在植物体内的传播机制还不够深入,难以获得完全免疫病毒的栽培品种。


技术实现思路

1、本专利技术要解决的技术问题是通过改造satrna的特定结构,使它表达sirna,实现对植物病毒侵染的有效预防。

2、即,针对现有技术的不足,本专利技术提供一种新的植物病毒防控手段。通过将设计的sirna序列整合至satrna的发夹结构中,利用cmv伴生的satrna和表达少量2b蛋白的cmv变体fny-cmv-2brds,增强植物对植物病毒的抗性。该方法不仅可以提高sirna的表达稳定性和遗传性,而且避免传统转基因和基因编辑技术的局限性,为植物病毒防控提供了一种稳定、高效、遗传的新策略。

3、为解决上述技术问题,本专利技术提供一种卫星rna预防病毒侵染植物的方法:预防植物病毒侵染的卫星rna基因沉默系统由一种表达特殊小干扰rna的卫星rna和一种弱毒的辅助病毒fny-cmv-2brds组成;

4、卫星rna主体为satt1-kn,把其第90位至109位序列替换为靶向植物病毒基因组的小干扰rna序列,并使之形成新的长发夹结构,本专利技术以tmv为例。

5、说明:

6、本专利技术中,植物病毒以烟草花叶病毒为例;

7、sat-t1-kn、fny-cmv-2brds参照202311809853.5的专利技术《卫星rna系统表达sirna的构建方法及应用》。

8、作为本专利技术一种卫星rna预防病毒侵染植物的方法进一步改进:

9、通过pssrnait网站https://www.zhaolab.org/pssrnait/home.gy设计靶向tmv复制酶的sirna序列,设计sirna具体步骤如下:

10、1)、输入病毒基因组序列至pssrnait网站(https://www.zhaolab.org/pssrnait/home.gy)的fasta format方框内。

11、2)、运行得出结果,根据网站优选说明筛减序列。

12、3)、下载序列,得到21个碱基的小干扰rna序列。

13、4)、将最终得到的序列向3’端延伸1个碱基,使序列的碱基长度为22个碱基,得到靶向病毒基因组的8个小干扰rna序列。

14、筛选得到的靶向tmv复制酶的sirna序列如下:

15、tmv 1:5’-ataacaacagtgtagtacttga-3’

16、tmv 2:5’-aatagcagctgtatctttgagg-3’

17、tmv 3:5’-ataattaagagtactctctgat-3’

18、tmv 4:5’-attgatgtatggaatctgctgt-3’

19、tmv 5:5’-aaagactctatctcctcgttct-3’

20、tmv 6:5’-aggtgtgccttgacaatgcgac-3’

21、tmv 7:5’-atggaatctgctgtgtgtctcc-3’

22、tmv 8:5’-aagcaggttctcagagaagtgg-3’

23、作为本专利技术一种卫星rna预防病毒侵染植物的方法进一步改进:

24、一种卫星rna预防病毒侵染植物的方法中,关于替换至t1-kn第90位至109位序列的sirna序列需要满足以下几点要求:

25、1)、sirna序列第2位碱基不能进行配对;

26、2)、第2位碱基之后,每5个碱基,需要使1对碱基不形成配对,使satrna形成突起;

27、3)、在sirna序列的最后1个碱基后,加上胞嘧啶,序列的最后3个碱基,不与后添加的3个碱基配对,使这7个碱基形成环状结构;

28、4)、补足sirna序列的另一边结构,使之形成长发夹结构。本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种卫星RNA预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:预防植物病毒侵染的卫星RNA基因沉默系统由一种表达特殊小干扰RNA的卫星RNA和一种弱毒的辅助病毒Fny-CMV-2brds组成;

2.根据权利要求1所述的卫星RNA预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:卫星RNA基因沉默表达系统通过RNA干扰途径降解外来病毒基因组,预防外来植物病毒的侵染。

3.根据权利要求1或2所述的卫星RNA预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:卫星RNA预防植物病毒的侵染中设计小干扰RNA的方法通过以下步骤实现:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,筛选得到的靶向烟草花叶病毒复制酶的小干扰RNA序列如下:

5.根据权利要求1~4任一所述的卫星RNA预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:表达靶向烟草花叶病毒复制酶小干扰RNA的卫星RNA突变体KN-TMV1~-KN-TMV8的序列如SEQ IDNO:2~9所示。

6.一种用于实验验证如权利要求4所述的不同siRNA预防病毒侵染效果的方法,其特征在于,包括以下步骤:

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于siRNA优选序列:

...

【技术特征摘要】

1.一种卫星rna预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:预防植物病毒侵染的卫星rna基因沉默系统由一种表达特殊小干扰rna的卫星rna和一种弱毒的辅助病毒fny-cmv-2brds组成;

2.根据权利要求1所述的卫星rna预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:卫星rna基因沉默表达系统通过rna干扰途径降解外来病毒基因组,预防外来植物病毒的侵染。

3.根据权利要求1或2所述的卫星rna预防病毒侵染植物的方法,其特征在于:卫星rna预防植物病毒的侵染中设计小干扰rna的方法通过以下步骤实现:<...

【专利技术属性】
技术研发人员:杜志游王瑾赖家良
申请(专利权)人:浙江理工大学
类型:发明
国别省市:

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