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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医学,具体的,本专利技术涉及一种cladosporiumcladosporioides在作为胃癌早筛以及风险评估的标志物中的应用。
技术介绍
1、1982年幽门螺旋杆菌( helicobacter pylori, h. pylori)的发现结束了胃被视为无菌器官的历史,尽管 h. pylori是who认定的ⅰ类致癌物,感染 h. pylori的患者仅5%发展为胃癌,因此其他因素会影响胃癌的发生,探索非 h. pylori感染导致胃癌发生发展的机制意义重大。既往关于胃癌和微生物群的研究表明,胃癌发生过程中胃内微生物群发生了改变,近年来的研究发现了比 h. pylori更常见的多种菌种,例如链球菌、普雷沃氏菌、维罗氏菌、梭状芽胞杆菌、嗜血杆菌和奈瑟氏菌等,而目前对于胃内真菌感染致癌研究较少,仅部分文献报道白色念珠菌感染可机会致病导致胃黏膜疾病的发生发展,对于其他病原体尚不明确。本专利技术通过配对非 h. pylori感染胃癌患者及慢性浅表性胃炎患者胃黏膜病理组织石蜡切片,提取其dna,通过pcr扩增后进行通过16s及its测序并分析差异菌群。结果提示,胃癌、癌旁组与慢浅炎组间存在显著差异菌群,共19中差异细菌、4中差异真菌。首次发现 cladosporium cladosporioides在胃癌
2、目前胃癌的确诊依赖于病理组织学检查,胃镜及镜下活检目前是诊断胃癌的“金标准”。由于早期胃癌的症状不典型,通常难以发现,而传统肿瘤标志物如cea、ca19-9及ca72-4的灵敏度和特异度均不高,多数胃癌发现时已进展为中晚期,预后差,死亡率高。因此早期筛查、预警对胃癌的防治极为重要。既往相关筛查手段主要针对h. pylori,对其他病原体的筛查尚未见明确的临床应用。目前临床病原学检测及相关疾病的诊断仍依靠对“金标准”分离培养结果进行形态学观察。通过对致病真菌的培养,2周内若无菌体生长则为阴性结果,反之则为阳性结果。此类方法的可靠性毋庸置疑,但也存在耗时较长、检出率较低、检测效率不足以满足临床需求等问题,故在实际应用中仍具备改良优化的空间。革兰氏染色镜检以观察真菌形态也是可使用的病原学检测方法,但其检测阳性率较低,检测效率和准确性均不能较好地满足临床需求。
技术实现思路
1、针对现有技术的不足,本专利技术提供如下的技术方案:
2、本专利技术的第一个方面,提供一种cladosporium cladosporioides作为生物标志物在制备用于胃癌早期筛查的产品中的应用。
3、在一种实施方式中,上述应用中所述样本选自黏膜活检组织、石蜡固定标本、胃液、血清或血浆。
4、在另一种实施方式中,上述应用中所述产品为试剂、试剂盒或基因芯片等。
5、在另一种实施方式中,上述应用包括通过定量分析患者样本中cladosporiumcladosporioides的相对丰度,来筛选胃癌高危人群,优选的,所述胃癌高危人群为早期胃癌高危人群。
6、在一种优选的实施方式中,上述应用中所述定量分析使用的检测试剂包括如下引物:
7、内参引物:
8、18s fr1: aiccattcaatcggtait;
9、18s ff390: cgataacgaacgagacct;
10、真菌特异性引物:
11、cc1-107 qf:ctccgggtggacacttcaaa;
12、cc1-228 qr:gcatttcgctgcgttcttca。
13、相对于现有技术,本专利技术具有以下显著的进步:
14、本专利技术首次提出通过 cladosporium cladosporioides的检测进行胃癌早筛及风险评估检测。通过定量分析黏膜活检组织、石蜡固定标本、胃液及血清、血浆中 cladosporium cladosporioides的相对丰度的无创、简便的检测方式,即可早期筛选诊断出胃癌高危人群,尤其是早期胃癌高危人群,并且对胃癌的诊断具有较高的准确性、敏感性和特异性,可以成为胃癌的一种辅助诊断手段,有助于高危人群早期发现胃癌,做好胃癌的预警工作。
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1.Cladosporium cladosporioides作为生物标志物在制备用于胃癌早期筛查的产品中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述样本选自黏膜活检组织、石蜡固定标本、胃液、血清或血浆。
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品为试剂、试剂盒或基因芯片等。
4.如权利要求1-3任一所述的应用,其特征在于,所述应用包括通过定量分析患者样本中Cladosporium cladosporioides的相对丰度,来筛选胃癌高危人群。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述胃癌高危人群为早期胃癌高危人群。
6.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述定量分析使用的检测试剂包括如下引物:
【技术特征摘要】
1.cladosporium cladosporioides作为生物标志物在制备用于胃癌早期筛查的产品中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述样本选自黏膜活检组织、石蜡固定标本、胃液、血清或血浆。
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品为试剂、试剂盒或基因芯片等。
4.如权利要求...
【专利技术属性】
技术研发人员:宁静,丁士刚,张静,郎艳飞,俎明,郝新宇,张贺军,张静,雄英,韩秀瑞,
申请(专利权)人:北京大学第三医院北京大学第三临床医学院,
类型:发明
国别省市:
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