【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体涉及一种与绵羊尾长相关的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、绵羊是常见的饲养动物，身体丰满，体毛绵密，可以为人类提供肉和毛皮等产品。绵羊按尾型可分为短瘦尾羊、长瘦尾羊、短脂尾羊、长脂尾羊和脂臀尾羊。长尾绵羊易引发感染性疾病，还会影响自然交配，降低繁殖率，长尾细毛羊也会因污染导致羊毛品质降低。因此，长尾绵羊群体的养殖需要在羔羊阶段进行断尾。目前，断尾处理不利于动物福利，许多国家提出了禁止绵羊断尾的相关规定。但是，绵羊后躯肛门周围易被粪便污染，导致苍蝇幼虫的侵袭(flystrike)，而产生蛆病(myiasis)，长尾还增加了尾椎骨骨折的风险。所以，选育和培育短尾绵羊将成为未来解决绵羊断尾难题的有效途径。目前以非编码区域在绵羊群体中开展与尾长性状相关的自发性变异研究较少，也未见tbxt基因非编码区域在不同尾长绵羊群体间存在对绵羊尾椎数量相关的自发性变异的任何相关报道。
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种与绵羊尾长相关的snp分子标记及其应用，通过所述snp分子标记进行检测、分型，选择所述snp分子标记的位点的优势基因型，选育出短尾绵羊。
2、为解决上述技术问题，本专利技术提供了以下技术方案：
3、本专利技术提供一种与绵羊尾长相关的snp分子标记，所述与绵羊尾长相关的snp分子标记至少包括以下标记之一：snp1：位于绵羊基因组序列信息ars-ui_ramb_v2.0的第8号染色体上第88946608bp位点，该位点存在t>c；
4、本专利技术提供所述的snp分子标记在短尾绵羊选育中的应用。
5、本专利技术提供一种用于检测所述snp分子标记的引物组合，所述引物组合包括上游引物和下游引物，所述上游引物的序列为seq id no：1，所述下游引物的序列为seq id no：2。
6、本专利技术提供一种用于检测绵羊尾长的试剂盒，包括所述的引物组合。
7、本专利技术提供所述的引物组合或所述的试剂盒在短尾绵羊选育中的应用。
8、本专利技术提供一种短尾绵羊选育方法，所述方法包括：检测所述snp分子标记的位点的基因型，选择snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6、snp7和snp8位点中至少一个位点的优势基因型的个体。
9、优选的，所述snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6、snp7和snp8位点对应的优势基因型分别为cc、gg、aa、gg、cc、tt、tt、gg基因型。
10、优选的，所述的短尾绵羊选育方法包括：检测所述snp分子标记的位点的基因型，选择snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6、snp7和snp8这8个位点组合的短尾优势单倍型的个体。
11、优选的，所述短尾优势单倍型为h001，对应的优势基因型分别为cc、gg、aa、gg、cc、tt、tt、gg。
12、优选的，所述基因型的检测包括以下步骤：(1)提取待测绵羊的基因组dna；(2)采用所述引物组合扩增待测绵羊的基因组dna；(3)对pcr扩增产物进行进行sanger测序，判定所述snp分子标记的位点的基因型。
13、与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：
14、本专利技术研究并确定与绵羊尾长相关的snp分子标记，验证其对绵羊尾椎数的影响，表明所述snp分子标记与绵羊尾椎数显著性相关，最终建立高效准确的基因组选择育种技术，将其用于短尾绵羊育种的遗传改良中，从而提高短尾绵羊的繁殖力，增加养殖企业市场竞争力。
15、本专利技术在尾长差异显著的受试群体中，绵羊tbxt增强子(otne)区域共筛选到8个snps，长尾绵羊和短尾绵羊群体间snps的遗传存在差异，且8个snps存在较高程度的连锁，可形成1个block，在尾长差异显著的受试群体中单倍型分布存在显著差异，短尾绵羊受试群体中的优势单倍型为h001，长尾绵羊受试群体的优势单倍型为h002，可以将单倍型为h001个体选留下来，对短尾绵羊大规模分子育种具有潜在的应用价值。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与绵羊尾长相关的SNP分子标记，其特征在于，所述与绵羊尾长相关的SNP分子标记至少包括以下标记之一：
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记在短尾绵羊选育中的应用。
3.一种用于检测权利要求1所述SNP分子标记的引物组合，其特征在于，所述引物组合包括上游引物和下游引物，所述上游引物的序列为SEQ ID NO：1，所述下游引物的序列为SEQ ID NO：2。
4.一种用于检测绵羊尾长的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物组合。
5.权利要求3所述的引物组合或权利要求4所述的试剂盒在短尾绵羊选育中的应用。
6.一种短尾绵羊选育方法，其特征在于，所述方法包括：检测权利要求1所述SNP分子标记的位点的基因型，选择SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7和SNP8位点中至少一个位点的优势基因型的个体。
7.根据权利要求6所述的短尾绵羊选育方法，其特征在于，所述SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7和SNP8的位点对应的优势基因型分别为CC、GG、
8.根据权利要求6所述的短尾绵羊选育方法，其特征在于，所述方法包括：检测权利要求1所述SNP分子标记的位点的基因型，选择SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7和SNP8这8个位点组合的短尾优势单倍型的个体。
9.根据权利要求8所述的短尾绵羊选育方法，其特征在于，所述短尾优势单倍型为H001，对应的优势基因型分别为CC、GG、AA、GG、CC、TT、TT、GG。
10.根据权利要求6～9任意一项所述的短尾绵羊选育方法，其特征在于，所述基因型的检测包括以下步骤：
...【技术特征摘要】
1.一种与绵羊尾长相关的snp分子标记，其特征在于，所述与绵羊尾长相关的snp分子标记至少包括以下标记之一：
2.根据权利要求1所述的snp分子标记在短尾绵羊选育中的应用。
3.一种用于检测权利要求1所述snp分子标记的引物组合，其特征在于，所述引物组合包括上游引物和下游引物，所述上游引物的序列为seq id no：1，所述下游引物的序列为seq id no：2。
4.一种用于检测绵羊尾长的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物组合。
5.权利要求3所述的引物组合或权利要求4所述的试剂盒在短尾绵羊选育中的应用。
6.一种短尾绵羊选育方法，其特征在于，所述方法包括：检测权利要求1所述snp分子标记的位点的基因型，选择snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6、snp7和snp8位点中至少一个位点...
【专利技术属性】
技术研发人员：李文蓉，李忠慧，李婧平，刘晨曦，韩冰，
申请(专利权)人：新疆畜牧科学院生物技术研究所新疆畜牧科学院中国澳大利亚绵羊育种研究中心，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。