【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于南美白对虾育种，具体涉及一种南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记及其应用。
技术介绍
1、近年来，随着凡纳对虾养殖规模的扩大和养殖密度的增加，养殖池塘底部大量饲料、虾粪便和残留饲料，导致细菌性病害频繁爆发。这不仅给养殖生产造成严重经济损失，还造成抗菌素滥用以及抗药性菌株蔓延等诸多负面影响。副溶血性弧菌（vibrioparahaemolyticus）引起的弧菌病是南美白对虾养殖过程中最为常见、危害最大的细菌性疾病。人们通常使用抗生素来防治弧菌病，但对药物的依赖和滥用导致环境污染，抗药性菌株蔓延等诸多负面影响。随着分子生物学和基因分型技术的发展，以性状相关功能基因为基础的分子标记技术成为精准选育高抗病性状的动物的关键技术之一。单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，snp），即指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性。snp具有数量多、分布广泛、代表性强、遗传稳定性好、便于高通量、高度自动化的检测分析等优点。在南美白对虾育种中，snp标记已经得到应用，已经报道有耐氨氮性状、耐硝酸盐性状以及生长性状等相关的分子标记，但是与抗副溶血性弧菌性状相关的snp标记却鲜有报道。
2、细菌病原体感染机体时，通常利用“极化胞吐作用”的宿主囊泡运输途径在感染期间重塑真核细胞的细胞质膜。这种胞吐作用通常由进化上保守的八聚体蛋白复合物exocyst（称为胞外囊）介导。exocyst包括八种蛋白质：sec3、sec5、sec6、sec8、sec10、sec15、exo70和ex
技术实现思路
1、针对上述不足，本专利技术公开了一种南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记，其是基于南美白对虾的exocyst complex component 1基因筛选得到的snp分子标记，将它们作为南美白对虾抗副溶血性弧菌性状的功能标记，用于南美白对虾的抗病育种可以得到具有良好抗副溶血性弧菌能力的南美白对虾新品种。
2、本专利技术是采用如下技术方案实现的：
3、一种南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记，其包括分子标记a、分子标记b、分子标记c、分子标记d、分子标记e、分子标记f、分子标记g、分子标记h、分子标记i、分子标记j、分子标记k和分子标记l中的任意一种或多种；
4、所述分子标记a位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5271 bp位点处，记为d.5271 c>t，该位点的碱基为c或t，突变类型为c/c纯合型、c/t杂合型、t/t纯合型；
5、所述分子标记b位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5280 bp位点处，记为d.5280 a>g，该位点的碱基为a或g，突变类型为a/a纯合型、a/g杂合型、g/g纯合型；
6、所述分子标记c位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5328 bp位点处，记为d.5328 a>g该位点的碱基为a或g，突变类型为a/a纯合型、a/g杂合型、g/g纯合型；
7、所述分子标记d位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5373 bp位点处，记为d.5373 a>t，该位点的碱基为a或t，突变类型为a/a纯合型、a/t杂合型、t/t纯合型；
8、所述分子标记e位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5381 bp位点处，记为d.5381 a>c，该位点的碱基为a或c，突变类型为a/a纯合型、a/c杂合型、c/c纯合型；
9、所述分子标记f位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5392 bp位点处，记为d.5392 a>g，该位点的碱基为a或g，突变类型为a/a纯合型、a/g杂合型、g/g纯合型；
10、所述分子标记g位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5401 bp位点处，记为d.5401 a>t，该位点的碱基为a或t，突变类型为a/a纯合型、a/t杂合型、t/t纯合型；
11、所述分子标记h位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5422 bp位点处，记为d.5422 a>t，该位点的碱基为a或t，突变类型为a/a纯合型、a/t杂合型、t/t纯合型；
12、所述分子标记i位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5448 bp位点处，记为d.5448 c>t，该位点的碱基为c或t，突变类型为c/c纯合型、c/t杂合型、t/t纯合型；
13、所述分子标记j位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5450 bp位点处，记为d.5450 a>g，该位点的碱基为a或g，突变类型为a/a纯合型、a/g杂合型、g/g纯合型；
14、所述分子标记k位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5474 bp位点处，记为d.5474 a>c，该位点的碱基为a或c，突变类型为a/a纯合型、a/c杂合型、c/c纯合型；
15、所述分子标记l位于序列表中序列1所示的核苷酸序列的5519 bp位点处，记为d.5519 a>t，该位点的碱基为a或t，突变类型为a/a纯合型、a/t杂合型、t/t纯合型。
16、序列表中序列表1所述的核苷酸序列为exocyst complex component 1 基因的核苷酸序列。
17、所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的应用是将其用于南美白对虾的选择育种，具体是先提取待测南美白对虾肌肉组织的基因组dna，再将得到的基因组dna作为模板dna进行pcr扩增以及pcr扩增产物纯化，然后对得到的pcr扩增产物进行测序，确定所述的分子标记a、分子标记b、分子标记c、分子标记d、分子标记e、分子标记f、分子标记g、分子标记h、分子标记i、分子标记j、分子标记k和分子标记l的基因型；
18、当分子标记a的基因型为优势基因型的cc基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种；当分子标记b的基因型为优势基因型的gg基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种；当分子标记c的基因型为优势基因型的gg基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种；当分子标记d的基因型为优势基因型的aa基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种; 当分子标记e的基因型为优势基因型的cc基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种；当分子标记f的基因型为优势基因型的aa基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种；当分子标记g的基因型为优势基因型的tt基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种；当分子标记h的基因型为优势基因型的tt基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白对虾品种育种; 当分子标记i的基因型为优势基因型的tt基因型时，选择该个体作为后备亲本进行南美白本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记，其特征在于：所述基因分子标记包括分子标记A、分子标记B、分子标记C、分子标记D、分子标记E、分子标记F、分子标记G、分子标记H、分子标记I、分子标记J、分子标记K和分子标记L中的任意一种或多种；
2.如权利要求1所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的应用，其特征在于：将所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记用于南美白对虾的选择育种，具体是先提取待测南美白对虾肌肉组织的基因组DNA，再将得到的基因组DNA作为模板DNA进行PCR扩增以及PCR扩增产物纯化，然后对得到的PCR扩增产物进行测序，确定所述的分子标记A、分子标记B、分子标记C、分子标记D、分子标记E、分子标记F、分子标记G、分子标记H、分子标记I、分子标记J、分子标记K和分子标记L的基因型；
3.根据权利要求2所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的应用，其特征在于：所述PCR扩增过程中，用于检测南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的引物组，其包括引物F和引物R，所述引物F的序列为CAAAAGCCCTCATCATCAGTG，所述引物R的序列为TTTGTGA
4. 根据权利要求2所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的应用，其特征在于：所述PCR扩增体系由以下组分组成：2.0μL的10×Taq缓冲液、0.4μL的dNTP、0.2μL的浓度为5U/μL的Taq DNA聚合酶、0.5μL的引物F、0.5μL的引物R、14.4μL的ddH2O、2.0μL的模板DNA。
5.根据权利要求2所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的应用，其特征在于：所述PCR扩增的反应程序包括以下步骤：
...【技术特征摘要】
1.一种南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记，其特征在于：所述基因分子标记包括分子标记a、分子标记b、分子标记c、分子标记d、分子标记e、分子标记f、分子标记g、分子标记h、分子标记i、分子标记j、分子标记k和分子标记l中的任意一种或多种；
2.如权利要求1所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记的应用，其特征在于：将所述南美白对虾胞泌复合体1基因分子标记用于南美白对虾的选择育种，具体是先提取待测南美白对虾肌肉组织的基因组dna，再将得到的基因组dna作为模板dna进行pcr扩增以及pcr扩增产物纯化，然后对得到的pcr扩增产物进行测序，确定所述的分子标记a、分子标记b、分子标记c、分子标记d、分子标记e、分子标记f、分子标记g、分子标记h、分子标记i、分子标记j、分子标记k和分子标记l的基因型；
3.根据...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵永贞，彭敏，王焕岭，罗双双，杨春玲，张彬，王卉，李旻，刘青云，李强勇，陈田聪，朱威霖，黄玉柳，冯鹏霏，
申请(专利权)人：广西壮族自治区水产科学研究院广西壮族自治区渔业病害防治环境监测和质量检验中心，广西壮族自治区水生野生动物救护中心，
类型：发明
国别省市：
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