System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE-F基因及其dsRNA杀螨效应制造技术_技高网
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叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE-F基因及其dsRNA杀螨效应制造技术

技术编号:42063421 阅读:6 留言:0更新日期:2024-07-19 16:47
本发明专利技术公开叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE‑F基因及其dsRNA杀螨效应,涉及生物技术领域。该叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE‑F基因及其dsRNA杀螨效应,使用特异性引物克隆获得的ABCE基因cDNA全长序列为1845bp,编码的氨基酸序列为615a.a;通过实验发现高浓度(1ug/μL)dsRNA‑ABCE以及dsRNA‑ABCF1能降低叶螨的存活率,dsRNA‑ABCE以及dsRNA‑ABCF对叶螨卵的孵化和幼螨的存活有不良影响;dsRNA‑ABCE以及dsRNA‑ABCF沉默叶螨ABC基因后可降低其产卵量,包括日均产卵量和单雌产卵量,dsRNA‑ABCE能显著降低雌螨存活时间;dsRNA‑ABCE以及dsRNA‑ABCF沉默叶螨ABC基因后影响F1代生长发育,表现为延长各发育历期,降低各发育历期的存活率,说明dsRNA‑ABCE以及dsRNA‑ABCF在处理雌成螨诱导的ABC基因沉默现象,从而导致了适合度代价。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物,具体为叶螨abc转运蛋白亚家族abce-f基因及其dsrna杀螨效应。


技术介绍

1、农业害螨属于节肢动物门,蛛形纲,蜱螨亚纲,真螨目的小型及微型动物,广泛分布于各种农林作物上,是当今世界农林作物上的主要害虫。

2、近年来害螨的危害越来越严重,长期使用化学防治对环境已构成威胁,使防治工作难上加难,因此,研究工作者需要寻找新的防控方向,达到害虫治理工作与环境保护的和谐发展,本专利技术采用rna干扰技术,对叶螨abce-f基因的表达进行干扰(沉默),探究沉默叶螨abce-f基因后对叶螨的致死率,对卵的正常孵化和幼螨生长发育的影响,以期探寻新的害螨控制方法。


技术实现思路

1、(一)解决的技术问题

2、针对现有技术的不足,本专利技术公开了叶螨abc转运蛋白亚家族abce-f基因及其dsrna杀螨效应,以解决上述
技术介绍
中提出的问题。

3、(二)技术方案

4、为实现以上目的,本专利技术通过以下技术方案予以实现:叶螨abc转运蛋白亚家族abce-f基因及其dsrna杀螨效应;abce-f基因的提取步骤如下;

5、s1、叶螨总rna提取及cdna合成

6、选用叶螨雌成螨600头,于1.5mlrnasefree离心管中充分研磨,按照lifetechnologies公司puerlinktmrnaminikit试剂盒说明书提取总rna,用takara公司的反转录试剂盒primescriptrt-pcrkit反转录合成cdna,保存于-80℃备用;

7、s2、叶螨abce转运蛋白基因片段的克隆

8、根据测序后得到的abce-f的mrna序列,采用primer5.0软件分别设计叶螨abce-f特异性引物:

9、abce-f1:atggcaggtcgtggtccagct

10、abce-r1:ttaaagatcgtccaagaaa

11、abcf1-f:atgtcaaaaactgaagacatt

12、abcf1-r:tcattcaggtctggcattttct

13、abcf2-f:atgtctgatcgaaagacaa

14、abcf2-r:ttaaatggcaccagct

15、abcf3-f:atgtcaaaaactgaagacatt

16、abcf3-r:ttatttaacatcctctaattctt

17、以cdna为模板采用常规pcr进行扩增反应体系同上,扩增条件为:

18、95℃预变形3min;

19、94℃30s,t1℃45s,72℃90s,运行5个循环;

20、94℃30s,t2℃45s,72℃90s,运行30个循环;总计35个循环;

21、72℃10min;4℃保存;

22、注:t1,t2是根据引物的tm值的不同而定的;

23、对pcr产物进行1%凝胶电泳检测、回收、连接、转化、测序;

24、s3、叶螨abce转运蛋白基因序列分析及进化树构建

25、利用orcae分析获得的cdna序列的开放阅读框及蛋白质翻译情况;使用expasy中protparam软件分析abc转运蛋白基因编码的氨基酸序列组成;利用netphos3.0server程序的磷酸化位点分析功能预测蛋白序列中的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3种氨基酸残基可能的磷酸化位点;用dnaman进行氨基酸序列比对;利用mega5.0邻位相接法(nj)进行重复分析构建系统发育树;

26、s4、叶螨abc基因dsrna体外合成

27、使用primer5.0分别设计abce-f基因的双链rna(dsrna)合成引物,以含有abc基因的pcr产物为模板,用已合成的叶螨abc基因dsrna合成引物进行pcr扩增,生成合成dsrna的模板;

28、反应体系如下:

29、

30、扩增条件:

31、94℃预变性1min;

32、94℃30s,65℃30s,72℃40s,5次循环;

33、94℃30s,68℃30s,72℃40s,30次循环,共35次循环;

34、72℃延伸l0min;4℃保存;

35、pcr产物检测:

36、取扩增产物在1.0%的琼脂糖凝胶电泳上检测;对凝胶产物进行回收纯化使所获产物满足进行dsrna体外合成的量;

37、按照体外dsrna合成试剂盒说明书,在0.2ml离心管中建立下列反应体系:

38、nuclease-freewater6μl

39、ntpbuffermix10μl

40、temeplate2μl

41、t7rnapolymerasemix2μl

42、total20μl

43、扩增条件为:37℃,2h。

44、优选的,通过特异性引物克隆,获得棉叶螨的三个abcf基因,分别为abcf1基因,abcf2基因和abcf3基因:其中abcf1基因全长为1839bp,编码的氨基酸序列为613a.a;abcf2基因全长1755bp,编码的氨基酸序列为585a.a;abcf3基因全长2157bp,编码的氨基酸序列为719a.a。

45、优选的,一、叶螨abce基因沉默后对存活率影响

46、为确定叶螨abc基因沉默后对存活率的影响,分别用不同浓度的dsrna-abce-f进行点滴,浓度设置为0.1ug/μl和1ug/μl,以ddh2o作为对照dsrna-nc;用0.1ug/μldsrna-abce点滴一周,从第三天开始存活率逐渐降低;用1ug/μldsrna-abce点滴一周,从第四天开始存活率显著降低,与ck相比差异显著;总体而言,高浓度(1ug/μl)dsrna-abce能显著降低叶螨的存活率(p<0.05)。

47、二、dsrna-abcf1饲喂棉叶螨影响

48、0.1ug/ul浓度的dsrna-abcf1喂饲叶螨时,对叶螨存活率在前3天没有影响,从第4天开始跟对照组开始产生差别,最后可以得出0.1ug/ul浓度dsrna-abcf1对叶螨存活率有影响;

49、用1ug/ul浓度dsrna-abcf1饲喂叶螨一周时间时,从第4天开始,存活率与对照组相比显著降低,比0.1ug/ul浓度的dsrna-abcf1饲养时的差别还要大。可以得出1ug/ul浓度的dsrna-abcf1对叶螨存活率有显著的负面影响,浓度越大影响也会越大;

50、用0.1ug/ul浓度的dsrna-abcf2饲养棉叶螨一周,结果可以看到dsrna-abcf2饲喂叶螨的存活率跟对照组没有明显差别,从而可以得出0.1ug/ul浓度的dsrna-abcf1对叶螨存活率没有显著影响;

51、1本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE-F基因,其特征在于:通过特异性引物克隆,获得棉叶螨的三个ABCF基因,分别为ABCF1基因,ABCF2基因和ABCF3基因:其中ABCF1基因全长为1839bp,编码的氨基酸序列为613a.a;ABCF2基因全长1755bp,编码的氨基酸序列为585a.a;ABCF3基因全长2157bp,编码的氨基酸序列为719a.a。

2.根据权利要求1任一项所述的叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE-F基因的dsRNA杀螨效应,其特征在于:

3.根据权利要求2所述的叶螨ABC转运蛋白亚家族ABCE-F基因的dsRNA杀螨效应,其特征在于:分别测定不同dsRNA片段对叶螨存活、卵孵化和适合度的影响,结果表明:

【技术特征摘要】

1.叶螨abc转运蛋白亚家族abce-f基因,其特征在于:通过特异性引物克隆,获得棉叶螨的三个abcf基因,分别为abcf1基因,abcf2基因和abcf3基因:其中abcf1基因全长为1839bp,编码的氨基酸序列为613a.a;abcf2基因全长1755bp,编码的氨基酸序列为585a.a;abcf3基因全长2157bp,编...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵伊英崔丹丹王莎王鑫磊可汗·穆罕默德·阿斯凡迪亚尔巴斯特·阿里
申请(专利权)人:石河子大学
类型:发明
国别省市:

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