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检测装置及检测方法制造方法及图纸

技术编号:42059106 阅读:8 留言:0更新日期:2024-07-19 16:45
本发明专利技术提出一种检测装置及检测方法。检测装置(200)包括CPU(211)以及存储器(212)。CPU(211)设定将熔解曲线划分为前区域与后区域的边界点,并设定开始点与结束点,通过最小二乘法算出近似直线,重复进行近似直线的设定处理。CPU(211)在前区域中设定第一直线,在后区域中设定第二直线,并检测将第一直线与第二直线中核酸的温度变得相同时的核酸的吸光度的中间值连结的线和熔解曲线的交点所对应的核酸的温度作为熔解温度。

【技术实现步骤摘要】

本公开涉及一种用于检测核酸的熔解温度的检测装置及检测方法


技术介绍

1、在表示脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,dna)等核酸的稳定性的指标中,有熔解温度(以下,也称为tm值)。核酸呈现双链结构。通过使溶解有核酸的溶液的温度上升,核酸中的双链结构逐渐分离,在高温溶液中完全分离而成为单链结构。当核酸自双链结构变化成单链结构时,波长260μm附近的紫外光的吸光度大幅上升。核酸因具有此种特性,因此当制作将横轴设为温度、将纵轴设为吸光度的熔解曲线的曲线图时,会出现曲线图急剧变化的区域。tm值是在此种区域中单链结构与双链结构所占的比例变得相等时的温度。

2、在日本专利特开2003-121396号公报中,公开了一种能够以高精度算出dna的吸光度的装置。由此,在日本专利特开2003-121396号公报中,可制作高精度的熔解曲线的曲线图。


技术实现思路

1、tm值例如可通过以下所示的方法(以下,也称为“中线法”)求出。在中线法中,在核酸的曲线图的前区域(双链结构的区域)与后区域(单链结构的区域)中分别设定开始点以及结束点,并画出将两点连结的直线。中线法是根据这两个直线将核酸的温度变为同一温度时的核酸的吸光度的中间值连结而成的线与熔解曲线的交点处的核酸的温度设为tm值的方法。在日本专利特开2003-121396号公报中,未对tm值的详细检测方法进行公开。

2、在tm值的算出中使用中线法的情况下,用户任意设定开始点与结束点。因此,关于tm值,即便是使用了相同数据的情况,也会在每个用户中产生开始点与结束点的偏差,因此在检测中有时会产生误差。

3、本专利技术是为了解决上述问题而成,其目的在于提供一种能够消除每个用户的熔解温度(tm值)的检测误差的检测装置及检测方法。

4、本公开的检测装置涉及一种使用表示分析装置所测定的核酸的温度和与紫外光对应的核酸的吸光度的关系的数据,来检测核酸的熔解温度的检测装置。检测装置包括控制装置;以及存储装置,存储来自分析装置的数据。数据由熔解曲线表示,所述熔解曲线是当以核酸的温度为横轴、以核酸的吸光度为纵轴而对数据进行了绘图时,随着核酸的温度上升而核酸的吸光度上升的熔解曲线。控制装置在将存储于存储装置的数据表示为熔解曲线时,根据核酸的温度而设定将所述熔解曲线划分为前区域与后区域的边界点,对于前区域中的数据中根据核酸的温度而连续地变化的既定的数据数量所规定的第一数据,将最低温度设定为第一开始点,将最高温度设定为第一结束点,使用第一开始点与第一结束点的范围内的数据,通过最小二乘法算出近似直线,一边使第一数据的范围向边界点的方向移动,一边重复进行使用了移动后的各第一数据的近似直线的设定处理,直至第一结束点到达边界点为止,对于后区域中的数据中根据核酸的温度而连续地变化的既定的数据数量所规定的第二数据,将最高温度设定为第二开始点,将最低温度设定为第二结束点,使用第二开始点与第二结束点的范围内的数据,通过最小二乘法算出近似直线,一边使第二数据的范围向边界点的方向移动,一边重复进行使用了移动后的各第二数据的近似直线的设定处理,直至第二结束点到达边界点为止,在将基于第一数据中的相邻数据的绘图间隔而预先设定的第一常数设为k1、将第一数据的从第一开始点到第一结束点的温度差设为w1、将由第一数据算出的近似直线的斜率设为r的情况下,设定k1×w1+1/r为最大时的第一直线,在将基于第二数据中的相邻数据的绘图间隔而预先设定的第二常数设为k2、将第二数据的从第二开始点到第二结束点的温度差设为w2、将由第二数据算出的近似直线的斜率设为r的情况下,设定k2×w2+1/r为最大时的第二直线,检测将第一直线与第二直线中核酸的温度变得相同时的核酸的吸光度的中间值连结的线和熔解曲线的交点所对应的核酸的温度作为熔解温度。

5、本公开的检测方法涉及一种使用表示分析装置所测定的核酸的温度和与紫外光对应的核酸的吸光度的关系的数据,来检测核酸的熔解温度的方法。数据由熔解曲线表示,所述熔解曲线是当以核酸的温度为横轴、以核酸的吸光度为纵轴而对数据进行了绘图时,随着核酸的温度上升而核酸的吸光度上升的熔解曲线。方法执行:存储来自分析装置的数据的步骤;在将所存储的数据表示为熔解曲线时,根据核酸的温度而设定将所述熔解曲线划分为前区域与后区域的边界点的步骤;对于前区域中的数据中根据核酸的温度而连续地变化的第一数量的数据,在熔解曲线上从核酸的温度低的点开始依次设定开始点与结束点的步骤;使用开始点与结束点的范围内的第一数量的数据,通过最小二乘法算出近似直线的步骤;一边使开始点及结束点向边界点的方向逐次移动1点,一边重复进行由第一数量的数据确定的近似直线的设定处理,直至结束点到达边界点为止的步骤;对于后区域中的数据中根据核酸的温度而连续地变化的第二数量的数据,在熔解曲线上自核酸的温度高的点开始依次设定开始点与结束点的步骤;使用开始点与结束点的范围内的第二数量的数据,通过最小二乘法算出近似直线的步骤;一边使开始点及结束点向边界点的方向逐次移动1点,一边重复进行由第二数量的数据确定的近似直线的设定处理,直至结束点到达边界点为止的步骤;在熔解曲线中将基于相邻的第一数量的数据的绘图间隔而预先设定的第一常数设为k1、将第一数量的数据的从开始点到结束点的宽度设为w1、将由第一数量的数据算出的近似直线的斜率设为r的情况下,设定k1×w1+1/r为最大时的第一直线的步骤;在熔解曲线中将基于相邻的第二数量的数据的绘图间隔而预先设定的第二常数设为k2、将第二数量的数据的从开始点到结束点的宽度设为w2、将由第二数量的数据算出的近似直线的斜率设为r的情况下,设定k2×w2+1/r为最大时的第二直线的步骤;以及检测将第一直线与第二直线中核酸的温度变得相同时的核酸的吸光度的中间值连结的线和熔解曲线的交点所对应的核酸的温度作为熔解温度的步骤。

6、通过本公开的检测装置及检测方法,可唯一地决定熔解温度,因此可消除每个用户的熔解温度(tm值)的检测误差。

7、本专利技术的所述目的及其他目的、特征、方面以及优点将根据结合附图来理解的与本专利技术相关的以下详细说明而变得明确。

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【技术保护点】

1.一种检测装置,使用表示分析装置所测定的核酸的温度和与紫外光对应的核酸的吸光度的关系的数据,来检测核酸的熔解温度,所述检测装置的特征在于包括:

2.根据权利要求1所述的检测装置,其特征在于,

3.根据权利要求2所述的检测装置,其特征在于,

4.根据权利要求1所述的检测装置,其特征在于,

5.一种检测方法,使用表示分析装置所测定的核酸的温度和与紫外光对应的核酸的吸光度的关系的数据,来检测核酸的熔解温度,所述检测方法的特征在于,

6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,

7.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于,

8.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,

【技术特征摘要】

1.一种检测装置,使用表示分析装置所测定的核酸的温度和与紫外光对应的核酸的吸光度的关系的数据,来检测核酸的熔解温度,所述检测装置的特征在于包括:

2.根据权利要求1所述的检测装置,其特征在于,

3.根据权利要求2所述的检测装置,其特征在于,

4.根据权利要求1所述的检测装置,其特征在于,

【专利技术属性】
技术研发人员:田中皓人
申请(专利权)人:株式会社岛津制作所
类型:发明
国别省市:

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