System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种与山羊体重相关的SNP标记的应用制造技术_技高网

一种与山羊体重相关的SNP标记的应用制造技术

技术编号:42001741 阅读:4 留言:0更新日期:2024-07-12 12:24
本发明专利技术公开一个影响山羊体重的JAK2基因内含子区的SNP标记的应用。该标记位于山羊8号染色体的JAK2基因,具体的SNP标记为序列表SEQ ID NO:1的第635bp处的A>G碱基突变,该位点GG基因型山羊体重显著高于AA基因型和GA基因型个体。本发明专利技术以麻城黑山羊为研究对象,利用PCR扩增山羊JAK2基因的DNA序列变异,分析该突变位点多态性对山羊体重的影响,并据此进行山羊个体的留种,可用于提高麻城黑山羊体重,加快以麻城黑山羊为育种素材的山羊品种培育,为山羊生长性状的标记辅助选择育种提供标记资源。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于动物分子育种,涉及与山羊体重性状相关的snp标记在麻城黑山羊育种中的应用。


技术介绍

1、单核苷酸多态性(snp)是生物个体多样的重要原因,全基因组重测序技术是寻找snp的一种快速准确的方法。人类驯化野生动物获得生活所需的肉、奶和皮毛等,导致动物的基因型和表型发生变化。在自然选择和人工选择的综合影响下,野山羊向家养山羊的转变过程中,体重性状变化较大,并在基因组上留下大量的选择印迹,因此,比较野山羊与家养山羊的基因组数据,可以筛选出与体重相关的snp位点。我们分析麻城黑山羊和野山羊全基因组测序数据,发现一个snp位点受到正选择,该位点位于jak2基因,该基因可能是影响山羊体重的重要基因。

2、junas激酶2(jak2)是一种非受体型的酪氨酸蛋白激酶,属于细胞因子受体相关的酪氨酸激酶家族,既能与细胞因子受体结合磷酸化,也能催化下游靶蛋白磷酸化。jak2/stats是细胞因子和生长因子信号传导的关键通路之一,参与许多细胞活动,在信号转导、细胞增殖和生长等方面具有重要的生物学功能。生长激素(gh)是调控生物个体体重的重要激素,jak2是gh信号转导的关键,被gh激活的jak2/ghr复合物招募多种信号蛋白,从而启动多种信号通路和细胞反应,包括与体重调节相关通路和蛋白表达。jak2对体重的影响体现在骨骼发育上,也体现在肌肉和脂肪细胞的物质代谢和能量稳态方面。jak2/ghr复合物招募的信号蛋白质sh2b1激活jak2并增强gh对肌动蛋白细胞骨架的调节,该蛋白被募集到瘦素受体-jak2复合物时参与体重调节,其变异与肥胖有关。jak2被激活后,瘦素诱导jak2/p42/44mapk和jak2/pi3k级联反应,从而诱导生长激素mrna的表达,导致gh启动子的反式激活,从而控制哺乳动物的生长和代谢。脂肪细胞可通过jak2调节体重,敲除jak2基因的小鼠体重显著高于同窝对照小鼠,且雌性小鼠体重增加尤为明显。总之,jak2影响生长发育过程中的信号转导和能量平衡,可能参与动物体重的调控。本专利技术以麻城黑山羊为对象,分析jak2基因多态性与体重的关系,发现该基因的一个snp位点与体重相关,该位点gg基因型山羊个体的体重显著升高,为麻城黑山羊体重性状的分子标记辅助选择育种提供标记资源。


技术实现思路

1、本专利技术为现有山羊体重性状选育过程中所存在的技术问题提供一种解决方法。

2、根据本专利技术的实施例,所述snp标记位于seq id no:1所示核苷酸序列的第635位碱基,该snp标记的gg基因型麻城黑山羊个体的体重极显著高于ga和aa基因型的个体。通过检测山羊的上述snp标记,能够根据该snp标记的基因型对山羊体重进行评估。因此,本专利技术的snp标记与山羊体重紧密相关,能够有效用于山羊的分子标记辅助育种,进而能够根据实际育种需求对山羊育种素材进行选择,从而能够准确、高效地选育出高体重的优良个体,提高育种选择的效率和准确性。

3、本专利技术提供一种用于检测权利要求1所述snp标记的引物对。根据本专利技术的实施例,所述引物为seq id no:2和seq id no:3所示的核苷酸序列,用于检测所述snp标记。

4、根据本专利技术的实施例,利用本专利技术的引物对能够有效地对待测麻城黑山羊的上述与体重相关的snp标记所在片段进行pcr扩增,通过测序能够有效实现对这种snp标记的检测,确定待测山羊个体在该snp标记位点的基因型,进而能够有效预测待测山羊体重。具体地,该snp标记位点的gg基因型个体的体重显著高于ga和aa基因型的个体,因此该snp标记位点的gg基因型可以作为判断山羊体重值的重要标准。在麻城黑山羊选育工作中可以通过保留该snp标记位点基因型为gg的个体用于繁育,淘汰该snp标记位点的基因型为aa和ga的个体,从而逐步提高麻城黑山羊群体的体重。由此,本专利技术用于检测上述所述snp标记的引物对,能够有效用于麻城黑山羊的分子标记辅助育种,进而能够实现低成本、高准确性地选择出体重大的麻城黑山羊。

5、本专利技术具有以下有益效果:(1)本专利技术提供的snp标记与麻城黑山羊体重显著相关,gg基因型山羊的体重显著高于ga和aa基因型山羊。(2)该snp标记可以用于麻城黑山羊体重性状的辅助选择,筛选具有高体重的麻城黑山羊,对进一步提高麻城黑山羊生长性能和利用麻城黑山羊为素材进行品种(或品系)选育具有重要的实际应用价值。

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种根据与山羊体重性状相关分子标记选择山羊的方法,所述分子标记位于核苷酸序列SEQ ID NO:1,其中该序列第635位点的GG基因型山羊个体的体重显著高于AA和GA基因型的个体;其方法包括以下步骤:

2.权利要求1所述的分子标记在筛选具有高体重麻城黑山羊中的应用,选择所述分子标记的GG基因型山羊个体留种。

【技术特征摘要】

1.一种根据与山羊体重性状相关分子标记选择山羊的方法,所述分子标记位于核苷酸序列seq id no:1,其中该序列第635位点的gg基因型山羊个体的体重显著高于a...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘桂琼姜勋平陈孟雅王贝贝帖卓英
申请(专利权)人:华中农业大学
类型:发明
国别省市:

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